Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms