Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3C1V9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3C1V9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3C1V9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3C1V9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3C1V9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3C1V9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3C1V9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3C1V9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3C1V9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3C1V9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3C1V9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3C1V9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3C1V9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3C1V9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3C1V9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3C1V9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3C1V9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3C1V9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3C1V9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3C1V9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3C1V9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3C1V9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3C1V9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3C1V9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3C1V9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3C1V9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3C1V9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3C1V9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3C1V9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3C1V9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3C1V9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3C1V9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q3C1V9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3C1V9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3C1V9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3C1V9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3C1V9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3C1V9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3C1V9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3C1V9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3C1V9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3C1V9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3C1V9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3C1V9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3C1V9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3C1V9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3C1V9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3C1V9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3C1V9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3C1V9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3C1V9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3C1V9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3C1V9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3C1V9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3C1V9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3C1V9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3C1V9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3C1V9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3C1V9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3C1V9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms