Protein–RNA interactions for Protein: Q12090

REX3, RNA exonuclease 3, yeastyeast

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
REX3Q12090 YJL182CYJL182C 318 nt-0.88□□□□□ -2.55
REX3Q12090 snR55snR55 98 nt-0.89□□□□□ -2.55
REX3Q12090 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.89□□□□□ -2.55
REX3Q12090 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.92□□□□□ -2.56
REX3Q12090 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.92□□□□□ -2.56
REX3Q12090 YNR077CYNR077C 255 nt-0.92□□□□□ -2.56
REX3Q12090 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.92□□□□□ -2.56
REX3Q12090 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-0.93□□□□□ -2.56
REX3Q12090 snR49snR49 165 nt-0.95□□□□□ -2.56
REX3Q12090 snR69snR69 101 nt-0.98□□□□□ -2.57
REX3Q12090 YEL014CYEL014C 306 nt-0.99□□□□□ -2.57
REX3Q12090 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-0.99□□□□□ -2.57
REX3Q12090 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-1.01□□□□□ -2.57
REX3Q12090 snR39BsnR39B 96 nt-1.03□□□□□ -2.57
REX3Q12090 snR65snR65 100 nt-1.04□□□□□ -2.58
REX3Q12090 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-1.04□□□□□ -2.58
REX3Q12090 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-1.06□□□□□ -2.58
REX3Q12090 RDS3YPR094W 324 nt-1.07□□□□□ -2.58
REX3Q12090 SKI7YOR076C 2244 nt-1.07□□□□□ -2.58
REX3Q12090 YER090C-AYER090C-A 90 nt-1.09□□□□□ -2.58
REX3Q12090 JLP2YMR132C 627 nt-1.09□□□□□ -2.58
REX3Q12090 PMP2YEL017C-A 132 nt-1.11□□□□□ -2.59
REX3Q12090 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-1.13□□□□□ -2.59
REX3Q12090 snR56snR56 88 nt-1.15□□□□□ -2.59
REX3Q12090 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.15□□□□□ -2.59
REX3Q12090 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-1.15□□□□□ -2.59
REX3Q12090 YNL266WYNL266W 420 nt-1.16□□□□□ -2.6
REX3Q12090 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-1.18□□□□□ -2.6
REX3Q12090 snR50snR50 90 nt-1.18□□□□□ -2.6
REX3Q12090 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-1.19□□□□□ -2.6
REX3Q12090 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.25□□□□□ -2.61
REX3Q12090 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-1.27□□□□□ -2.61
REX3Q12090 YOR302WYOR302W 78 nt-1.27□□□□□ -2.61
REX3Q12090 snR77snR77 88 nt-1.29□□□□□ -2.62
REX3Q12090 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-1.29□□□□□ -2.62
REX3Q12090 YNL205CYNL205C 423 nt-1.29□□□□□ -2.62
REX3Q12090 snR48snR48 113 nt-1.3□□□□□ -2.62
REX3Q12090 snR67snR67 82 nt-1.34□□□□□ -2.62
REX3Q12090 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-1.35□□□□□ -2.63
REX3Q12090 snR81snR81 201 nt-1.36□□□□□ -2.63
REX3Q12090 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.36□□□□□ -2.63
REX3Q12090 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.36□□□□□ -2.63
REX3Q12090 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-1.37□□□□□ -2.63
REX3Q12090 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.39□□□□□ -2.63
REX3Q12090 YOR102WYOR102W 351 nt-1.41□□□□□ -2.64
REX3Q12090 snR52snR52 92 nt-1.41□□□□□ -2.64
REX3Q12090 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-1.42□□□□□ -2.64
REX3Q12090 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-1.42□□□□□ -2.64
REX3Q12090 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.45□□□□□ -2.64
REX3Q12090 YBR178WYBR178W 375 nt-1.45□□□□□ -2.64
REX3Q12090 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-1.51□□□□□ -2.65
REX3Q12090 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-1.51□□□□□ -2.65
REX3Q12090 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.55□□□□□ -2.66
REX3Q12090 YOR309CYOR309C 381 nt-1.56□□□□□ -2.66
REX3Q12090 snR80snR80 171 nt-1.6□□□□□ -2.67
REX3Q12090 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.6□□□□□ -2.67
REX3Q12090 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.65□□□□□ -2.67
REX3Q12090 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.66□□□□□ -2.68
REX3Q12090 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.7□□□□□ -2.68
REX3Q12090 YNL198CYNL198C 303 nt-1.79□□□□□ -2.7
REX3Q12090 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.82□□□□□ -2.7
REX3Q12090 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.85□□□□□ -2.71
REX3Q12090 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.87□□□□□ -2.71
REX3Q12090 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.9□□□□□ -2.71
REX3Q12090 snR6snR6 112 nt-1.95□□□□□ -2.72
REX3Q12090 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.95□□□□□ -2.72
REX3Q12090 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-2.01□□□□□ -2.73
REX3Q12090 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-2.01□□□□□ -2.73
REX3Q12090 YJL150WYJL150W 303 nt-2.02□□□□□ -2.73
REX3Q12090 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-2.04□□□□□ -2.74
REX3Q12090 snR73snR73 106 nt-2.06□□□□□ -2.74
REX3Q12090 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.06□□□□□ -2.74
REX3Q12090 YDR543CYDR543C 300 nt-2.08□□□□□ -2.74
REX3Q12090 YBL053WYBL053W 375 nt-2.15□□□□□ -2.75
REX3Q12090 snR38snR38 95 nt-2.17□□□□□ -2.76
REX3Q12090 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-2.17□□□□□ -2.76
REX3Q12090 Q0142Q0142 177 nt-2.2□□□□□ -2.76
REX3Q12090 RPL41AYDL184C 78 nt-2.21□□□□□ -2.76
REX3Q12090 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.22□□□□□ -2.76
REX3Q12090 SPG3YDR504C 384 nt-2.27□□□□□ -2.77
REX3Q12090 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.29□□□□□ -2.78
REX3Q12090 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-2.32□□□□□ -2.78
REX3Q12090 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.34□□□□□ -2.78
REX3Q12090 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-2.39□□□□□ -2.79
REX3Q12090 YGR151CYGR151C 336 nt-2.41□□□□□ -2.8
REX3Q12090 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-2.45□□□□□ -2.8
REX3Q12090 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.46□□□□□ -2.8
REX3Q12090 snR47snR47 99 nt-2.49□□□□□ -2.81
REX3Q12090 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.52□□□□□ -2.81
REX3Q12090 snR85snR85 171 nt-2.53□□□□□ -2.81
REX3Q12090 snR87snR87 109 nt-2.55□□□□□ -2.82
REX3Q12090 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-2.58□□□□□ -2.82
REX3Q12090 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-2.59□□□□□ -2.82
REX3Q12090 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-2.61□□□□□ -2.83
REX3Q12090 YNL337WYNL337W 255 nt-2.64□□□□□ -2.83
REX3Q12090 YKL225WYKL225W 348 nt-2.65□□□□□ -2.83
REX3Q12090 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-2.66□□□□□ -2.84
REX3Q12090 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.67□□□□□ -2.84
REX3Q12090 YNL338WYNL338W 159 nt-2.78□□□□□ -2.85
REX3Q12090 YJR162CYJR162C 351 nt-2.81□□□□□ -2.86
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