Protein–RNA interactions for Protein: Q04835

YMR253C, Uncharacterized membrane protein YMR253C, yeastyeast

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR253CQ04835 RDS3YPR094W 324 nt-1.09□□□□□ -2.58
YMR253CQ04835 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-1.1□□□□□ -2.59
YMR253CQ04835 snR50snR50 90 nt-1.1□□□□□ -2.59
YMR253CQ04835 YDR413CYDR413C 576 nt-1.11□□□□□ -2.59
YMR253CQ04835 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-1.11□□□□□ -2.59
YMR253CQ04835 PMP2YEL017C-A 132 nt-1.12□□□□□ -2.59
YMR253CQ04835 VAR1Q0140 1197 nt-1.12□□□□□ -2.59
YMR253CQ04835 YER181CYER181C 324 nt-1.13□□□□□ -2.59
YMR253CQ04835 snR39BsnR39B 96 nt-1.14□□□□□ -2.59
YMR253CQ04835 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.14□□□□□ -2.59
YMR253CQ04835 YKL118WYKL118W 312 nt-1.15□□□□□ -2.59
YMR253CQ04835 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-1.15□□□□□ -2.59
YMR253CQ04835 YFL019CYFL019C 354 nt-1.16□□□□□ -2.6
YMR253CQ04835 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-1.16□□□□□ -2.6
YMR253CQ04835 JLP2YMR132C 627 nt-1.18□□□□□ -2.6
YMR253CQ04835 YPR012WYPR012W 255 nt-1.21□□□□□ -2.6
YMR253CQ04835 SKI7YOR076C 2244 nt-1.23□□□□□ -2.61
YMR253CQ04835 GIM4YEL003W 336 nt-1.23□□□□□ -2.61
YMR253CQ04835 snR55snR55 98 nt-1.24□□□□□ -2.61
YMR253CQ04835 snR67snR67 82 nt-1.24□□□□□ -2.61
YMR253CQ04835 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-1.24□□□□□ -2.61
YMR253CQ04835 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-1.26□□□□□ -2.61
YMR253CQ04835 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-1.28□□□□□ -2.61
YMR253CQ04835 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-1.31□□□□□ -2.62
YMR253CQ04835 YBR178WYBR178W 375 nt-1.35□□□□□ -2.63
YMR253CQ04835 YNL205CYNL205C 423 nt-1.36□□□□□ -2.63
YMR253CQ04835 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.37□□□□□ -2.63
YMR253CQ04835 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.38□□□□□ -2.63
YMR253CQ04835 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-1.38□□□□□ -2.63
YMR253CQ04835 snR48snR48 113 nt-1.42□□□□□ -2.64
YMR253CQ04835 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.43□□□□□ -2.64
YMR253CQ04835 YOR302WYOR302W 78 nt-1.43□□□□□ -2.64
YMR253CQ04835 snR77snR77 88 nt-1.44□□□□□ -2.64
YMR253CQ04835 YNR077CYNR077C 255 nt-1.44□□□□□ -2.64
YMR253CQ04835 Q0144Q0144 330 nt-1.45□□□□□ -2.64
YMR253CQ04835 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.47□□□□□ -2.64
YMR253CQ04835 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-1.47□□□□□ -2.64
YMR253CQ04835 snR65snR65 100 nt-1.48□□□□□ -2.65
YMR253CQ04835 YOR102WYOR102W 351 nt-1.49□□□□□ -2.65
YMR253CQ04835 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-1.5□□□□□ -2.65
YMR253CQ04835 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-1.51□□□□□ -2.65
YMR253CQ04835 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.55□□□□□ -2.66
YMR253CQ04835 snR52snR52 92 nt-1.55□□□□□ -2.66
YMR253CQ04835 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-1.56□□□□□ -2.66
YMR253CQ04835 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.57□□□□□ -2.66
YMR253CQ04835 snR81snR81 201 nt-1.58□□□□□ -2.66
YMR253CQ04835 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.6□□□□□ -2.67
YMR253CQ04835 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.61□□□□□ -2.67
YMR253CQ04835 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-1.62□□□□□ -2.67
YMR253CQ04835 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-1.67□□□□□ -2.68
YMR253CQ04835 snR80snR80 171 nt-1.76□□□□□ -2.69
YMR253CQ04835 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.76□□□□□ -2.69
YMR253CQ04835 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-1.77□□□□□ -2.69
YMR253CQ04835 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-1.78□□□□□ -2.69
YMR253CQ04835 YNL198CYNL198C 303 nt-1.8□□□□□ -2.7
YMR253CQ04835 YOR309CYOR309C 381 nt-1.8□□□□□ -2.7
YMR253CQ04835 snR56snR56 88 nt-1.81□□□□□ -2.7
YMR253CQ04835 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.81□□□□□ -2.7
YMR253CQ04835 YJL150WYJL150W 303 nt-1.9□□□□□ -2.71
YMR253CQ04835 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.9□□□□□ -2.71
YMR253CQ04835 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.91□□□□□ -2.72
YMR253CQ04835 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.92□□□□□ -2.72
YMR253CQ04835 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.94□□□□□ -2.72
YMR253CQ04835 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.97□□□□□ -2.72
YMR253CQ04835 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-1.98□□□□□ -2.73
YMR253CQ04835 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-2.02□□□□□ -2.73
YMR253CQ04835 YBL053WYBL053W 375 nt-2.02□□□□□ -2.73
YMR253CQ04835 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-2.1□□□□□ -2.75
YMR253CQ04835 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-2.1□□□□□ -2.75
YMR253CQ04835 RPL41AYDL184C 78 nt-2.13□□□□□ -2.75
YMR253CQ04835 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-2.16□□□□□ -2.76
YMR253CQ04835 snR6snR6 112 nt-2.19□□□□□ -2.76
YMR253CQ04835 YGR151CYGR151C 336 nt-2.23□□□□□ -2.77
YMR253CQ04835 snR38snR38 95 nt-2.26□□□□□ -2.77
YMR253CQ04835 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-2.27□□□□□ -2.77
YMR253CQ04835 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-2.28□□□□□ -2.77
YMR253CQ04835 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.32□□□□□ -2.78
YMR253CQ04835 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-2.33□□□□□ -2.78
YMR253CQ04835 snR73snR73 106 nt-2.34□□□□□ -2.78
YMR253CQ04835 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-2.41□□□□□ -2.8
YMR253CQ04835 SPG3YDR504C 384 nt-2.42□□□□□ -2.8
YMR253CQ04835 snR47snR47 99 nt-2.43□□□□□ -2.8
YMR253CQ04835 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-2.45□□□□□ -2.8
YMR253CQ04835 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-2.48□□□□□ -2.81
YMR253CQ04835 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.56□□□□□ -2.82
YMR253CQ04835 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-2.56□□□□□ -2.82
YMR253CQ04835 YDR543CYDR543C 300 nt-2.58□□□□□ -2.82
YMR253CQ04835 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-2.61□□□□□ -2.83
YMR253CQ04835 YKL225WYKL225W 348 nt-2.68□□□□□ -2.84
YMR253CQ04835 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.69□□□□□ -2.84
YMR253CQ04835 YNL337WYNL337W 255 nt-2.69□□□□□ -2.84
YMR253CQ04835 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.72□□□□□ -2.84
YMR253CQ04835 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.72□□□□□ -2.84
YMR253CQ04835 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.72□□□□□ -2.84
YMR253CQ04835 YNL338WYNL338W 159 nt-2.73□□□□□ -2.85
YMR253CQ04835 Q0142Q0142 177 nt-2.76□□□□□ -2.85
YMR253CQ04835 snR85snR85 171 nt-2.82□□□□□ -2.86
YMR253CQ04835 snR87snR87 109 nt-2.95□□□□□ -2.88
YMR253CQ04835 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-2.97□□□□□ -2.88
YMR253CQ04835 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-2.99□□□□□ -2.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.4 ms