Protein–RNA interactions for Protein: P53849

GIS2, Zinc finger protein GIS2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIS2P53849 YCS4YLR272C 3531 nt0.96□□□□□ -2.26
GIS2P53849 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.96□□□□□ -2.26
GIS2P53849 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.96□□□□□ -2.26
GIS2P53849 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.96□□□□□ -2.26
GIS2P53849 LAA1YJL207C 6045 nt0.96□□□□□ -2.26
GIS2P53849 FYV8YGR196C 2454 nt0.96□□□□□ -2.26
GIS2P53849 YSP1YHR155W 3687 nt0.95□□□□□ -2.26
GIS2P53849 CSE1YGL238W 2883 nt0.95□□□□□ -2.26
GIS2P53849 NUP188YML103C 4968 nt0.95□□□□□ -2.26
GIS2P53849 DOP1YDR141C 5097 nt0.95□□□□□ -2.26
GIS2P53849 BUD3YCL014W 4911 nt0.95□□□□□ -2.26
GIS2P53849 RPL41AYDL184C 78 nt0.95□□□□□ -2.26 RIP-Chip
GIS2P53849 ULP2YIL031W 3105 nt0.95□□□□□ -2.26
GIS2P53849 snR75snR75 89 nt0.94□□□□□ -2.26
GIS2P53849 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.93□□□□□ -2.26
GIS2P53849 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.93□□□□□ -2.26
GIS2P53849 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.93□□□□□ -2.26
GIS2P53849 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
GIS2P53849 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
GIS2P53849 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.93□□□□□ -2.26
GIS2P53849 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
GIS2P53849 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
GIS2P53849 RDS3YPR094W 324 nt0.93□□□□□ -2.26
GIS2P53849 snR38snR38 95 nt0.93□□□□□ -2.26
GIS2P53849 MYO1YHR023W 5787 nt0.92□□□□□ -2.26
GIS2P53849 AI1Q0050 2505 nt0.91□□□□□ -2.26
GIS2P53849 SKI7YOR076C 2244 nt0.91□□□□□ -2.26
GIS2P53849 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.91□□□□□ -2.26
GIS2P53849 CDC39YCR093W 6327 nt0.9□□□□□ -2.27
GIS2P53849 CDC25YLR310C 4770 nt0.89□□□□□ -2.27
GIS2P53849 BST1YFL025C 3090 nt0.88□□□□□ -2.27 RIP-Chip
GIS2P53849 MSN5YDR335W 3675 nt0.88□□□□□ -2.27
GIS2P53849 SPC110YDR356W 2835 nt0.88□□□□□ -2.27
GIS2P53849 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt0.88□□□□□ -2.27
GIS2P53849 NIP1YMR309C 2439 nt0.87□□□□□ -2.27
GIS2P53849 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.87□□□□□ -2.27
GIS2P53849 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.86□□□□□ -2.27
GIS2P53849 SIP4YJL089W 2490 nt0.85□□□□□ -2.27
GIS2P53849 BUL2YML111W 2763 nt0.85□□□□□ -2.27
GIS2P53849 NST1YNL091W 3723 nt0.85□□□□□ -2.27
GIS2P53849 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.84□□□□□ -2.27
GIS2P53849 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.84□□□□□ -2.27
GIS2P53849 EST2YLR318W 2655 nt0.84□□□□□ -2.28
GIS2P53849 UTP20YBL004W 7482 nt0.83□□□□□ -2.28
GIS2P53849 YJR029WYJR029W 5268 nt0.82□□□□□ -2.28
GIS2P53849 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.82□□□□□ -2.28
GIS2P53849 YOL014WYOL014W 375 nt0.8□□□□□ -2.28
GIS2P53849 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.8□□□□□ -2.28
GIS2P53849 SPT7YBR081C 3999 nt0.79□□□□□ -2.28
GIS2P53849 PET111YMR257C 2403 nt0.76□□□□□ -2.29
GIS2P53849 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.75□□□□□ -2.29
GIS2P53849 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.74□□□□□ -2.29
GIS2P53849 RKR1YMR247C 4689 nt0.73□□□□□ -2.29
GIS2P53849 BEM2YER155C 6504 nt0.71□□□□□ -2.3
GIS2P53849 VAM6YDL077C 3150 nt0.68□□□□□ -2.3
GIS2P53849 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.68□□□□□ -2.3
GIS2P53849 snR67snR67 82 nt0.67□□□□□ -2.3
GIS2P53849 YMR160WYMR160W 2451 nt0.66□□□□□ -2.3
GIS2P53849 SCC2YDR180W 4482 nt0.66□□□□□ -2.3
GIS2P53849 YPR117WYPR117W 7470 nt0.61□□□□□ -2.31
GIS2P53849 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.61□□□□□ -2.31
GIS2P53849 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.6□□□□□ -2.31
GIS2P53849 LTE1YAL024C 4308 nt0.56□□□□□ -2.32
GIS2P53849 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.55□□□□□ -2.32
GIS2P53849 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.55□□□□□ -2.32
GIS2P53849 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.55□□□□□ -2.32
GIS2P53849 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.55□□□□□ -2.32
GIS2P53849 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.55□□□□□ -2.32
GIS2P53849 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.55□□□□□ -2.32
GIS2P53849 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.55□□□□□ -2.32
GIS2P53849 MLP2YIL149C 5040 nt0.54□□□□□ -2.32
GIS2P53849 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.53□□□□□ -2.32
GIS2P53849 THO2YNL139C 4794 nt0.47□□□□□ -2.33
GIS2P53849 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.47□□□□□ -2.33
GIS2P53849 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.47□□□□□ -2.33
GIS2P53849 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.47□□□□□ -2.33
GIS2P53849 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.47□□□□□ -2.33
GIS2P53849 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
GIS2P53849 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
GIS2P53849 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.47□□□□□ -2.33
GIS2P53849 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
GIS2P53849 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
GIS2P53849 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
GIS2P53849 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
GIS2P53849 snR40snR40 97 nt0.44□□□□□ -2.34
GIS2P53849 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.43□□□□□ -2.34
GIS2P53849 MLP1YKR095W 5628 nt0.43□□□□□ -2.34
GIS2P53849 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.42□□□□□ -2.34
GIS2P53849 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.41□□□□□ -2.34
GIS2P53849 snR77snR77 88 nt0.4□□□□□ -2.35
GIS2P53849 IQG1YPL242C 4488 nt0.4□□□□□ -2.35
GIS2P53849 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.39□□□□□ -2.35
GIS2P53849 UTP10YJL109C 5310 nt0.38□□□□□ -2.35
GIS2P53849 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.38□□□□□ -2.35
GIS2P53849 FMP27YLR454W 7887 nt0.37□□□□□ -2.35
GIS2P53849 SBH2YER019C-A 267 nt0.36□□□□□ -2.35
GIS2P53849 SOV1YMR066W 2697 nt0.33□□□□□ -2.36
GIS2P53849 PAU9YBL108C-A 129 nt0.32□□□□□ -2.36
GIS2P53849 ESP1YGR098C 4893 nt0.3□□□□□ -2.36
GIS2P53849 snR128snR128 126 nt0.27□□□□□ -2.37
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