Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms