Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 YJL182CYJL182C 318 nt-0.72□□□□□ -2.52
DDI1P40087 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-0.73□□□□□ -2.53
DDI1P40087 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.76□□□□□ -2.53
DDI1P40087 snR49snR49 165 nt-0.77□□□□□ -2.53
DDI1P40087 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-0.78□□□□□ -2.53
DDI1P40087 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.79□□□□□ -2.54
DDI1P40087 YOR170WYOR170W 306 nt-0.79□□□□□ -2.54
DDI1P40087 snR69snR69 101 nt-0.81□□□□□ -2.54
DDI1P40087 snR161snR161 161 nt-0.81□□□□□ -2.54
DDI1P40087 snR65snR65 100 nt-0.84□□□□□ -2.54
DDI1P40087 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.85□□□□□ -2.55
DDI1P40087 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-0.85□□□□□ -2.55
DDI1P40087 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.86□□□□□ -2.55
DDI1P40087 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.87□□□□□ -2.55
DDI1P40087 snR39BsnR39B 96 nt-0.87□□□□□ -2.55
DDI1P40087 snR56snR56 88 nt-0.88□□□□□ -2.55
DDI1P40087 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.88□□□□□ -2.55
DDI1P40087 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-0.88□□□□□ -2.55
DDI1P40087 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.9□□□□□ -2.55
DDI1P40087 YNR077CYNR077C 255 nt-0.9□□□□□ -2.55
DDI1P40087 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-0.9□□□□□ -2.55
DDI1P40087 RDS3YPR094W 324 nt-0.91□□□□□ -2.56
DDI1P40087 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.91□□□□□ -2.56
DDI1P40087 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.92□□□□□ -2.56
DDI1P40087 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.92□□□□□ -2.56
DDI1P40087 YOR302WYOR302W 78 nt-0.93□□□□□ -2.56
DDI1P40087 snR50snR50 90 nt-0.95□□□□□ -2.56
DDI1P40087 YNL266WYNL266W 420 nt-0.96□□□□□ -2.56
DDI1P40087 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-1.03□□□□□ -2.57
DDI1P40087 JLP2YMR132C 627 nt-1.05□□□□□ -2.58
DDI1P40087 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-1.07□□□□□ -2.58
DDI1P40087 snR48snR48 113 nt-1.08□□□□□ -2.58
DDI1P40087 SKI7YOR076C 2244 nt-1.09□□□□□ -2.58
DDI1P40087 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-1.1□□□□□ -2.59
DDI1P40087 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-1.11□□□□□ -2.59
DDI1P40087 snR52snR52 92 nt-1.11□□□□□ -2.59
DDI1P40087 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.12□□□□□ -2.59
DDI1P40087 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-1.12□□□□□ -2.59
DDI1P40087 YNL205CYNL205C 423 nt-1.12□□□□□ -2.59
DDI1P40087 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-1.14□□□□□ -2.59
DDI1P40087 snR67snR67 82 nt-1.15□□□□□ -2.59
DDI1P40087 YBR178WYBR178W 375 nt-1.15□□□□□ -2.59
DDI1P40087 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-1.18□□□□□ -2.6
DDI1P40087 snR80snR80 171 nt-1.19□□□□□ -2.6
DDI1P40087 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.19□□□□□ -2.6
DDI1P40087 YOR102WYOR102W 351 nt-1.2□□□□□ -2.6
DDI1P40087 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.24□□□□□ -2.61
DDI1P40087 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.26□□□□□ -2.61
DDI1P40087 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-1.27□□□□□ -2.61
DDI1P40087 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.28□□□□□ -2.61
DDI1P40087 snR81snR81 201 nt-1.29□□□□□ -2.62
DDI1P40087 snR77snR77 88 nt-1.3□□□□□ -2.62
DDI1P40087 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.31□□□□□ -2.62
DDI1P40087 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.37□□□□□ -2.63
DDI1P40087 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.4□□□□□ -2.63
DDI1P40087 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.41□□□□□ -2.64
DDI1P40087 YNL198CYNL198C 303 nt-1.47□□□□□ -2.64
DDI1P40087 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.53□□□□□ -2.65
DDI1P40087 YOR309CYOR309C 381 nt-1.54□□□□□ -2.66
DDI1P40087 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.54□□□□□ -2.66
DDI1P40087 YJL150WYJL150W 303 nt-1.57□□□□□ -2.66
DDI1P40087 YBL053WYBL053W 375 nt-1.6□□□□□ -2.67
DDI1P40087 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.61□□□□□ -2.67
DDI1P40087 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.66□□□□□ -2.68
DDI1P40087 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.7□□□□□ -2.68
DDI1P40087 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.71□□□□□ -2.68
DDI1P40087 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.71□□□□□ -2.68
DDI1P40087 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.73□□□□□ -2.69
DDI1P40087 Q0142Q0142 177 nt-1.75□□□□□ -2.69
DDI1P40087 SPG3YDR504C 384 nt-1.84□□□□□ -2.7
DDI1P40087 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.84□□□□□ -2.7
DDI1P40087 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.93□□□□□ -2.72
DDI1P40087 snR6snR6 112 nt-1.95□□□□□ -2.72
DDI1P40087 YGR151CYGR151C 336 nt-1.96□□□□□ -2.72
DDI1P40087 RPL41AYDL184C 78 nt-1.98□□□□□ -2.73
DDI1P40087 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.98□□□□□ -2.73
DDI1P40087 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.98□□□□□ -2.73
DDI1P40087 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2□□□□□ -2.73
DDI1P40087 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.01□□□□□ -2.73
DDI1P40087 snR73snR73 106 nt-2.02□□□□□ -2.73
DDI1P40087 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-2.06□□□□□ -2.74
DDI1P40087 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-2.08□□□□□ -2.74
DDI1P40087 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-2.09□□□□□ -2.74
DDI1P40087 YDR543CYDR543C 300 nt-2.1□□□□□ -2.75
DDI1P40087 snR38snR38 95 nt-2.1□□□□□ -2.75
DDI1P40087 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-2.12□□□□□ -2.75
DDI1P40087 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.16□□□□□ -2.76
DDI1P40087 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-2.18□□□□□ -2.76
DDI1P40087 YNL338WYNL338W 159 nt-2.2□□□□□ -2.76
DDI1P40087 snR47snR47 99 nt-2.24□□□□□ -2.77
DDI1P40087 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-2.28□□□□□ -2.77
DDI1P40087 snR85snR85 171 nt-2.31□□□□□ -2.78
DDI1P40087 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.32□□□□□ -2.78
DDI1P40087 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.38□□□□□ -2.79
DDI1P40087 YNL337WYNL337W 255 nt-2.38□□□□□ -2.79
DDI1P40087 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.39□□□□□ -2.79
DDI1P40087 YKL225WYKL225W 348 nt-2.45□□□□□ -2.8
DDI1P40087 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.49□□□□□ -2.81
DDI1P40087 snR87snR87 109 nt-2.5□□□□□ -2.81
DDI1P40087 Q0032Q0032 291 nt-2.6□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.3 ms