Protein–RNA interactions for Protein: P38841

YHR138C, Uncharacterized protein YHR138C, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR138CP38841 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-2.36□□□□□ -2.79
YHR138CP38841 YBR178WYBR178W 375 nt-2.36□□□□□ -2.79
YHR138CP38841 YEL014CYEL014C 306 nt-2.38□□□□□ -2.79
YHR138CP38841 ATP19YOL077W-A 207 nt-2.4□□□□□ -2.79
YHR138CP38841 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-2.46□□□□□ -2.8
YHR138CP38841 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-2.48□□□□□ -2.81
YHR138CP38841 YGR035CYGR035C 351 nt-2.49□□□□□ -2.81
YHR138CP38841 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-2.5□□□□□ -2.81
YHR138CP38841 YJR157WYJR157W 363 nt-2.5□□□□□ -2.81
YHR138CP38841 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt-2.52□□□□□ -2.81
YHR138CP38841 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt-2.54□□□□□ -2.82
YHR138CP38841 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-2.54□□□□□ -2.82
YHR138CP38841 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.55□□□□□ -2.82
YHR138CP38841 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-2.58□□□□□ -2.82
YHR138CP38841 snR78snR78 87 nt-2.59□□□□□ -2.82
YHR138CP38841 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-2.6□□□□□ -2.83
YHR138CP38841 YOR309CYOR309C 381 nt-2.6□□□□□ -2.83
YHR138CP38841 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-2.61□□□□□ -2.83
YHR138CP38841 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-2.61□□□□□ -2.83
YHR138CP38841 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-2.62□□□□□ -2.83
YHR138CP38841 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-2.64□□□□□ -2.83
YHR138CP38841 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt-2.66□□□□□ -2.84
YHR138CP38841 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-2.67□□□□□ -2.84
YHR138CP38841 YER181CYER181C 324 nt-2.72□□□□□ -2.84
YHR138CP38841 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-2.77□□□□□ -2.85
YHR138CP38841 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-2.77□□□□□ -2.85
YHR138CP38841 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-2.77□□□□□ -2.85
YHR138CP38841 YOR102WYOR102W 351 nt-2.79□□□□□ -2.86
YHR138CP38841 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-2.81□□□□□ -2.86
YHR138CP38841 snR48snR48 113 nt-2.82□□□□□ -2.86
YHR138CP38841 YDR413CYDR413C 576 nt-2.83□□□□□ -2.86
YHR138CP38841 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-2.85□□□□□ -2.87
YHR138CP38841 YPR197CYPR197C 564 nt-2.85□□□□□ -2.87
YHR138CP38841 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-2.86□□□□□ -2.87
YHR138CP38841 YPR012WYPR012W 255 nt-2.89□□□□□ -2.87
YHR138CP38841 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-2.91□□□□□ -2.88
YHR138CP38841 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-2.91□□□□□ -2.88
YHR138CP38841 YKL118WYKL118W 312 nt-2.91□□□□□ -2.88
YHR138CP38841 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-2.92□□□□□ -2.88
YHR138CP38841 snR55snR55 98 nt-2.95□□□□□ -2.88
YHR138CP38841 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-2.95□□□□□ -2.88
YHR138CP38841 RPL39YJL189W 156 nt-3□□□□□ -2.89
YHR138CP38841 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-3□□□□□ -2.89
YHR138CP38841 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-3.04□□□□□ -2.9
YHR138CP38841 YJL150WYJL150W 303 nt-3.1□□□□□ -2.91
YHR138CP38841 snR6snR6 112 nt-3.15□□□□□ -2.91
YHR138CP38841 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-3.15□□□□□ -2.91
YHR138CP38841 YOR302WYOR302W 78 nt-3.16□□□□□ -2.92
YHR138CP38841 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-3.2□□□□□ -2.92
YHR138CP38841 snR52snR52 92 nt-3.2□□□□□ -2.92
YHR138CP38841 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-3.21□□□□□ -2.92
YHR138CP38841 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-3.22□□□□□ -2.92
YHR138CP38841 GIM4YEL003W 336 nt-3.22□□□□□ -2.92
YHR138CP38841 YDR157WYDR157W 402 nt-3.25□□□□□ -2.93
YHR138CP38841 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-3.29□□□□□ -2.94
YHR138CP38841 YNL198CYNL198C 303 nt-3.3□□□□□ -2.94
YHR138CP38841 snR56snR56 88 nt-3.31□□□□□ -2.94
YHR138CP38841 RPL41AYDL184C 78 nt-3.32□□□□□ -2.94
YHR138CP38841 snR73snR73 106 nt-3.35□□□□□ -2.95
YHR138CP38841 snR80snR80 171 nt-3.35□□□□□ -2.95
YHR138CP38841 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-3.35□□□□□ -2.95
YHR138CP38841 YDR543CYDR543C 300 nt-3.39□□□□□ -2.95
YHR138CP38841 snR38snR38 95 nt-3.41□□□□□ -2.96
YHR138CP38841 RPL41BYDL133C-A 78 nt-3.44□□□□□ -2.96
YHR138CP38841 SOM1YEL059C-A 225 nt-3.45□□□□□ -2.96
YHR138CP38841 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-3.48□□□□□ -2.97
YHR138CP38841 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-3.49□□□□□ -2.97
YHR138CP38841 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-3.62□□□□□ -2.99
YHR138CP38841 snR65snR65 100 nt-3.65□□□□□ -2.99
YHR138CP38841 Q0017Q0017 162 nt-3.67□□□□□ -3
YHR138CP38841 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-3.68□□□□□ -3
YHR138CP38841 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-3.69□□□□□ -3
YHR138CP38841 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-3.71□□□□□ -3
YHR138CP38841 YBL053WYBL053W 375 nt-3.71□□□□□ -3
YHR138CP38841 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-3.72□□□□□ -3
YHR138CP38841 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-3.73□□□□□ -3.01
YHR138CP38841 YGR151CYGR151C 336 nt-3.74□□□□□ -3.01
YHR138CP38841 snR47snR47 99 nt-3.81□□□□□ -3.02
YHR138CP38841 VAR1Q0140 1197 nt-3.86□□□□□ -3.03
YHR138CP38841 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-3.86□□□□□ -3.03
YHR138CP38841 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-3.89□□□□□ -3.03
YHR138CP38841 snR85snR85 171 nt-3.89□□□□□ -3.03
YHR138CP38841 Q0142Q0142 177 nt-3.92□□□□□ -3.04
YHR138CP38841 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-3.98□□□□□ -3.05
YHR138CP38841 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-4□□□□□ -3.05
YHR138CP38841 YKL225WYKL225W 348 nt-4.06□□□□□ -3.06
YHR138CP38841 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-4.11□□□□□ -3.07
YHR138CP38841 SPG3YDR504C 384 nt-4.13□□□□□ -3.07
YHR138CP38841 snR87snR87 109 nt-4.15□□□□□ -3.07
YHR138CP38841 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-4.17□□□□□ -3.08
YHR138CP38841 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-4.29□□□□□ -3.1
YHR138CP38841 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-4.33□□□□□ -3.1
YHR138CP38841 YNL337WYNL337W 255 nt-4.36□□□□□ -3.11
YHR138CP38841 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-4.42□□□□□ -3.12
YHR138CP38841 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-4.47□□□□□ -3.13
YHR138CP38841 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-4.49□□□□□ -3.13
YHR138CP38841 snR58snR58 96 nt-4.57□□□□□ -3.14
YHR138CP38841 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-4.59□□□□□ -3.14
YHR138CP38841 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-4.59□□□□□ -3.14
YHR138CP38841 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-4.61□□□□□ -3.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72.7 ms