Protein–RNA interactions for Protein: P38834

YHR130C, Uncharacterized protein YHR130C, yeastyeast

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR130CP38834 snR77snR77 88 nt-2.22□□□□□ -2.76
YHR130CP38834 YGR035CYGR035C 351 nt-2.24□□□□□ -2.77
YHR130CP38834 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-2.24□□□□□ -2.77
YHR130CP38834 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-2.25□□□□□ -2.77
YHR130CP38834 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-2.26□□□□□ -2.77
YHR130CP38834 YBR178WYBR178W 375 nt-2.27□□□□□ -2.77
YHR130CP38834 YEL014CYEL014C 306 nt-2.28□□□□□ -2.77
YHR130CP38834 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-2.32□□□□□ -2.78
YHR130CP38834 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-2.35□□□□□ -2.79
YHR130CP38834 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-2.37□□□□□ -2.79
YHR130CP38834 snR78snR78 87 nt-2.38□□□□□ -2.79
YHR130CP38834 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-2.38□□□□□ -2.79
YHR130CP38834 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-2.42□□□□□ -2.8
YHR130CP38834 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-2.44□□□□□ -2.8
YHR130CP38834 YJR157WYJR157W 363 nt-2.47□□□□□ -2.8
YHR130CP38834 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-2.47□□□□□ -2.8
YHR130CP38834 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-2.49□□□□□ -2.81
YHR130CP38834 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-2.5□□□□□ -2.81
YHR130CP38834 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-2.51□□□□□ -2.81
YHR130CP38834 YER181CYER181C 324 nt-2.56□□□□□ -2.82
YHR130CP38834 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-2.57□□□□□ -2.82
YHR130CP38834 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-2.6□□□□□ -2.83
YHR130CP38834 YOR102WYOR102W 351 nt-2.6□□□□□ -2.83
YHR130CP38834 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-2.6□□□□□ -2.83
YHR130CP38834 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt-2.64□□□□□ -2.83
YHR130CP38834 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.64□□□□□ -2.83
YHR130CP38834 YPR197CYPR197C 564 nt-2.66□□□□□ -2.84
YHR130CP38834 YOR309CYOR309C 381 nt-2.69□□□□□ -2.84
YHR130CP38834 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-2.7□□□□□ -2.84
YHR130CP38834 YDR413CYDR413C 576 nt-2.71□□□□□ -2.84
YHR130CP38834 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-2.71□□□□□ -2.84
YHR130CP38834 snR55snR55 98 nt-2.73□□□□□ -2.85
YHR130CP38834 RPL39YJL189W 156 nt-2.73□□□□□ -2.85
YHR130CP38834 snR48snR48 113 nt-2.74□□□□□ -2.85
YHR130CP38834 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-2.75□□□□□ -2.85
YHR130CP38834 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-2.76□□□□□ -2.85
YHR130CP38834 YKL118WYKL118W 312 nt-2.8□□□□□ -2.86
YHR130CP38834 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-2.83□□□□□ -2.86
YHR130CP38834 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-2.83□□□□□ -2.86
YHR130CP38834 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-2.84□□□□□ -2.86
YHR130CP38834 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-2.84□□□□□ -2.86
YHR130CP38834 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-2.92□□□□□ -2.88
YHR130CP38834 YPR012WYPR012W 255 nt-2.92□□□□□ -2.88
YHR130CP38834 YDR157WYDR157W 402 nt-2.95□□□□□ -2.88
YHR130CP38834 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-2.96□□□□□ -2.88
YHR130CP38834 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-2.97□□□□□ -2.88
YHR130CP38834 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-2.99□□□□□ -2.89
YHR130CP38834 snR52snR52 92 nt-3□□□□□ -2.89
YHR130CP38834 YJL150WYJL150W 303 nt-3.01□□□□□ -2.89
YHR130CP38834 YOR302WYOR302W 78 nt-3.08□□□□□ -2.9
YHR130CP38834 GIM4YEL003W 336 nt-3.1□□□□□ -2.91
YHR130CP38834 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-3.15□□□□□ -2.91
YHR130CP38834 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-3.16□□□□□ -2.92
YHR130CP38834 YNL198CYNL198C 303 nt-3.19□□□□□ -2.92
YHR130CP38834 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-3.19□□□□□ -2.92
YHR130CP38834 RPL41AYDL184C 78 nt-3.2□□□□□ -2.92
YHR130CP38834 snR56snR56 88 nt-3.22□□□□□ -2.92
YHR130CP38834 snR6snR6 112 nt-3.27□□□□□ -2.93
YHR130CP38834 SOM1YEL059C-A 225 nt-3.28□□□□□ -2.93
YHR130CP38834 Q0017Q0017 162 nt-3.29□□□□□ -2.94
YHR130CP38834 snR80snR80 171 nt-3.3□□□□□ -2.94
YHR130CP38834 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-3.31□□□□□ -2.94
YHR130CP38834 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-3.33□□□□□ -2.94
YHR130CP38834 RPL41BYDL133C-A 78 nt-3.34□□□□□ -2.94
YHR130CP38834 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-3.4□□□□□ -2.95
YHR130CP38834 snR65snR65 100 nt-3.41□□□□□ -2.96
YHR130CP38834 snR73snR73 106 nt-3.42□□□□□ -2.96
YHR130CP38834 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-3.45□□□□□ -2.96
YHR130CP38834 snR38snR38 95 nt-3.46□□□□□ -2.96
YHR130CP38834 YDR543CYDR543C 300 nt-3.53□□□□□ -2.97
YHR130CP38834 VAR1Q0140 1197 nt-3.56□□□□□ -2.98
YHR130CP38834 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-3.62□□□□□ -2.99
YHR130CP38834 YGR151CYGR151C 336 nt-3.62□□□□□ -2.99
YHR130CP38834 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-3.65□□□□□ -2.99
YHR130CP38834 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-3.65□□□□□ -2.99
YHR130CP38834 YBL053WYBL053W 375 nt-3.68□□□□□ -3
YHR130CP38834 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-3.69□□□□□ -3
YHR130CP38834 snR47snR47 99 nt-3.72□□□□□ -3
YHR130CP38834 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-3.77□□□□□ -3.01
YHR130CP38834 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-3.82□□□□□ -3.02
YHR130CP38834 snR85snR85 171 nt-3.82□□□□□ -3.02
YHR130CP38834 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-3.87□□□□□ -3.03
YHR130CP38834 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-3.91□□□□□ -3.04
YHR130CP38834 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-3.93□□□□□ -3.04
YHR130CP38834 YKL225WYKL225W 348 nt-3.99□□□□□ -3.05
YHR130CP38834 SPG3YDR504C 384 nt-4.06□□□□□ -3.06
YHR130CP38834 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-4.1□□□□□ -3.07
YHR130CP38834 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-4.12□□□□□ -3.07
YHR130CP38834 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-4.13□□□□□ -3.07
YHR130CP38834 Q0142Q0142 177 nt-4.14□□□□□ -3.07
YHR130CP38834 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-4.15□□□□□ -3.07
YHR130CP38834 snR87snR87 109 nt-4.26□□□□□ -3.09
YHR130CP38834 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-4.31□□□□□ -3.1
YHR130CP38834 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-4.34□□□□□ -3.1
YHR130CP38834 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-4.39□□□□□ -3.11
YHR130CP38834 YNL337WYNL337W 255 nt-4.39□□□□□ -3.11
YHR130CP38834 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-4.42□□□□□ -3.12
YHR130CP38834 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-4.5□□□□□ -3.13
YHR130CP38834 snR58snR58 96 nt-4.53□□□□□ -3.13
YHR130CP38834 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-4.53□□□□□ -3.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms