Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL2P13500 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL2P13500 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL2P13500 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL2P13500 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL2P13500 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL2P13500 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL2P13500 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL2P13500 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL2P13500 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL2P13500 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL2P13500 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL2P13500 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL2P13500 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL2P13500 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL2P13500 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL2P13500 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL2P13500 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL2P13500 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL2P13500 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL2P13500 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL2P13500 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL2P13500 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL2P13500 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL2P13500 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms