Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 GOSR2-216ENST00000638468 1788 ntTSL 511.81□□□□□ -0.522e-7■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 GOSR2-244ENST00000640792 2452 ntTSL 511.01□□□□□ -0.652e-7■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 GOSR2-227ENST00000639365 1584 ntTSL 510.85□□□□□ -0.672e-7■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 GOSR2-212ENST00000638189 1945 ntTSL 59.92□□□□□ -0.822e-7■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 GOSR2-225ENST00000639199 2137 ntTSL 59.75□□□□□ -0.852e-7■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 GOSR2-214ENST00000638219 1425 ntTSL 58.62□□□□□ -1.032e-7■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 GOSR2-246ENST00000640866 1973 ntTSL 58.59□□□□□ -1.032e-7■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 AC005670.2-202ENST00000639822 1564 ntTSL 57.67□□□□□ -1.182e-7■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 GOSR2-223ENST00000639066 1180 ntTSL 56.99□□□□□ -1.292e-7■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 GOSR2-207ENST00000572403 648 ntTSL 56.8□□□□□ -1.322e-7■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 GOSR2-230ENST00000639985 1618 ntTSL 56.1□□□□□ -1.432e-7■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 GOSR2-243ENST00000640723 941 ntTSL 55.52□□□□□ -1.532e-7■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.852e-7■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.033e-7■■■■□ 23.4
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SRSF9Q13242 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.543e-7■■■■□ 23.4
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SRSF9Q13242 C2orf68-203ENST00000420686 1204 ntTSL 29.79□□□□□ -0.843e-7■■■■□ 23.4
SRSF9Q13242 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.853e-7■■■■□ 23.4
SRSF9Q13242 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.883e-7■■■■□ 23.4
SRSF9Q13242 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.893e-7■■■■□ 23.4
SRSF9Q13242 POFUT2-208ENST00000471540 3176 ntTSL 59.49□□□□□ -0.893e-7■■■■□ 23.4
SRSF9Q13242 POFUT2-202ENST00000334538 3077 ntTSL 1 (best)9.47□□□□□ -0.893e-7■■■■□ 23.4
SRSF9Q13242 POFUT2-210ENST00000485190 616 ntTSL 27.53□□□□□ -1.23e-7■■■■□ 23.4
SRSF9Q13242 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.462e-10■■■■□ 23.4
SRSF9Q13242 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.282e-10■■■■□ 23.4
SRSF9Q13242 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.482e-10■■■■□ 23.4
SRSF9Q13242 INPPL1-205ENST00000537755 535 ntTSL 47.83□□□□□ -1.162e-10■■■■□ 23.4
SRSF9Q13242 INPPL1-206ENST00000538339 505 ntTSL 27.1□□□□□ -1.272e-10■■■■□ 23.4
SRSF9Q13242 HNRNPH3-211ENST00000491200 2308 ntTSL 1 (best)10.5□□□□□ -0.737e-7■■■■□ 23.3
SRSF9Q13242 HNRNPH3-208ENST00000481819 2704 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.757e-7■■■■□ 23.3
SRSF9Q13242 HNRNPH3-206ENST00000478698 1507 ntTSL 210.1□□□□□ -0.797e-7■■■■□ 23.3
SRSF9Q13242 HNRNPH3-210ENST00000490442 1521 ntTSL 210.1□□□□□ -0.797e-7■■■■□ 23.3
SRSF9Q13242 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.937e-7■■■■□ 23.3
SRSF9Q13242 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.167e-7■■■■□ 23.3
SRSF9Q13242 DLC1-206ENST00000509922 455 ntTSL 46.23□□□□□ -1.417e-7■■■■□ 23.3
SRSF9Q13242 DLC1-204ENST00000503161 562 ntTSL 46.15□□□□□ -1.427e-7■■■■□ 23.3
SRSF9Q13242 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.447e-7■■■■□ 23.3
SRSF9Q13242 DLC1-205ENST00000506171 560 ntTSL 43.94□□□□□ -1.787e-7■■■■□ 23.3
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SRSF9Q13242 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.741e-6■■■■□ 23.3
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SRSF9Q13242 RAB11FIP3-207ENST00000461009 514 ntTSL 28.13□□□□□ -1.113e-6■■■■□ 23.3
SRSF9Q13242 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.468e-7■■■■□ 23.2
SRSF9Q13242 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.698e-7■■■■□ 23.2
SRSF9Q13242 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.798e-7■■■■□ 23.2
SRSF9Q13242 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC11.88□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 23.1
SRSF9Q13242 NCL-210ENST00000494618 910 ntTSL 24.28□□□□□ -1.722e-43■■■■□ 23
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SRSF9Q13242 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 22.9
SRSF9Q13242 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 311.71□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 22.9
SRSF9Q13242 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 511.71□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 22.9
SRSF9Q13242 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 22.9
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SRSF9Q13242 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 56.79□□□□□ -1.322e-6■■■■□ 22.9
SRSF9Q13242 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 35.56□□□□□ -1.522e-6■■■■□ 22.9
SRSF9Q13242 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.817e-8■■■■□ 22.9
SRSF9Q13242 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 EHBP1-204ENST00000405482 1311 ntTSL 213.92□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 22.8
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SRSF9Q13242 ENPP1-203ENST00000486853 732 ntTSL 218.35■□□□□ 0.531e-7■■■■□ 22.8
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SRSF9Q13242 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.041e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.024e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 LRRFIP1-205ENST00000420665 570 ntTSL 314.78□□□□□ -0.044e-7■■■■□ 22.8
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SRSF9Q13242 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.24e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.234e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.264e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.264e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.264e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.334e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.354e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 DAPK1-215ENST00000495182 626 ntTSL 512.8□□□□□ -0.364e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.444e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 DAPK1-206ENST00000469067 2499 ntTSL 212.2□□□□□ -0.464e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 DAPK1-208ENST00000470267 579 ntTSL 212.17□□□□□ -0.464e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.474e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.54e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.524e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.544e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.64e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.654e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 LRRFIP1-215ENST00000498053 593 ntTSL 310.82□□□□□ -0.684e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.694e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 SLC35E2B-201ENST00000480991 2860 ntTSL 210.7□□□□□ -0.74e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 WASHC2C-205ENST00000420848 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.23□□□□□ -0.774e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.844e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 DAPK1-217ENST00000496522 579 ntTSL 29.77□□□□□ -0.854e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 DAPK1-213ENST00000491893 4186 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.864e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 DAPK1-219ENST00000622514 5772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.884e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 DAPK1-209ENST00000472284 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.894e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 DAPK1-210ENST00000472344 548 ntTSL 58.96□□□□□ -0.984e-7■■■■□ 22.8
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