Protein–RNA interactions for Protein: Q12749

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, yeastyeast

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC6Q12749 YKR012CYKR012C 378 nt9.36□□□□□ -0.91
SMC6Q12749 YCR025CYCR025C 411 nt9.35□□□□□ -0.91
SMC6Q12749 MDM35YKL053C-A 261 nt9.35□□□□□ -0.91
SMC6Q12749 TIM44YIL022W 1296 nt9.34□□□□□ -0.91
SMC6Q12749 MOB1YIL106W 945 nt9.34□□□□□ -0.91
SMC6Q12749 CWP2YKL096W-A 279 nt9.34□□□□□ -0.91
SMC6Q12749 HXT10YFL011W 1641 nt9.34□□□□□ -0.91
SMC6Q12749 MAS1YLR163C 1389 nt9.33□□□□□ -0.92
SMC6Q12749 REX2YLR059C 810 nt9.32□□□□□ -0.92
SMC6Q12749 KRR1YCL059C 951 nt9.31□□□□□ -0.92
SMC6Q12749 SDS24YBR214W 1584 nt9.31□□□□□ -0.92
SMC6Q12749 SRP54YPR088C 1626 nt9.31□□□□□ -0.92
SMC6Q12749 RIM2YBR192W 1134 nt9.29□□□□□ -0.92
SMC6Q12749 HEM14YER014W 1620 nt9.29□□□□□ -0.92
SMC6Q12749 DTR1YBR180W 1719 nt9.28□□□□□ -0.92
SMC6Q12749 CYC3YAL039C 810 nt9.28□□□□□ -0.92
SMC6Q12749 SAN1YDR143C 1833 nt9.28□□□□□ -0.92
SMC6Q12749 KGD2YDR148C 1392 nt9.27□□□□□ -0.93
SMC6Q12749 ILV2YMR108W 2064 nt9.27□□□□□ -0.93
SMC6Q12749 RPC31YNL151C 756 nt9.27□□□□□ -0.93
SMC6Q12749 VBA3YCL069W 1377 nt9.26□□□□□ -0.93
SMC6Q12749 ENO1YGR254W 1314 nt9.26□□□□□ -0.93
SMC6Q12749 MCM5YLR274W 2328 nt9.26□□□□□ -0.93
SMC6Q12749 YCP4YCR004C 744 nt9.25□□□□□ -0.93
SMC6Q12749 SAM50YNL026W 1455 nt9.25□□□□□ -0.93
SMC6Q12749 MEX67YPL169C 1800 nt9.24□□□□□ -0.93
SMC6Q12749 NBA1YOL070C 1506 nt9.24□□□□□ -0.93
SMC6Q12749 LYS20YDL182W 1287 nt9.23□□□□□ -0.93
SMC6Q12749 DPL1YDR294C 1770 nt9.22□□□□□ -0.93
SMC6Q12749 SER2YGR208W 930 nt9.22□□□□□ -0.93
SMC6Q12749 YPT11YNL304W 1254 nt9.22□□□□□ -0.93
SMC6Q12749 SBP1YHL034C 885 nt9.2□□□□□ -0.94
SMC6Q12749 SRP102YKL154W 735 nt9.2□□□□□ -0.94
SMC6Q12749 AGP3YFL055W 1677 nt9.2□□□□□ -0.94
SMC6Q12749 YLR280CYLR280C 351 nt9.19□□□□□ -0.94
SMC6Q12749 RFC1YOR217W 2586 nt9.18□□□□□ -0.94
SMC6Q12749 SWM1YDR260C 513 nt9.18□□□□□ -0.94
SMC6Q12749 GAS1YMR307W 1680 nt9.18□□□□□ -0.94
SMC6Q12749 HTS1YPR033C 1641 nt9.17□□□□□ -0.94
SMC6Q12749 ERO1YML130C 1692 nt9.16□□□□□ -0.94
SMC6Q12749 MDL2YPL270W 2322 nt9.16□□□□□ -0.94
SMC6Q12749 PTC6YCR079W 1329 nt9.16□□□□□ -0.94
SMC6Q12749 YFR020WYFR020W 699 nt9.16□□□□□ -0.94
SMC6Q12749 YIA6YIL006W 1122 nt9.15□□□□□ -0.94
SMC6Q12749 RIB1YBL033C 1038 nt9.13□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 RSC4YKR008W 1878 nt9.13□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 YGR210CYGR210C 1236 nt9.12□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 RSM7YJR113C 744 nt9.12□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 LEU4YNL104C 1860 nt9.11□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 TGA1tA(UGC)A 73 nt9.11□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt9.11□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt9.11□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt9.11□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt9.11□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 GGA2YHR108W 1758 nt9.11□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 MTO1YGL236C 2010 nt9.1□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 YMR007WYMR007W 381 nt9.1□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 THI3YDL080C 1830 nt9.1□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 YDR467CYDR467C 327 nt9.09□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 SOD2YHR008C 702 nt9.09□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 GPM1YKL152C 744 nt9.09□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.09□□□□□ -0.95
SMC6Q12749 GTB1YDR221W 2109 nt9.08□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 MIM1YOL026C 342 nt9.08□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 FCY1YPR062W 477 nt9.07□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 INH1YDL181W 258 nt9.05□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 ERG6YML008C 1152 nt9.05□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 RCR1YBR005W 642 nt9.05□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 YPL108WYPL108W 507 nt9.05□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 GAL2YLR081W 1725 nt9.03□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.03□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.03□□□□□ -0.96
SMC6Q12749 HBS1YKR084C 1836 nt9.01□□□□□ -0.97
SMC6Q12749 YDR306CYDR306C 1437 nt9.01□□□□□ -0.97
SMC6Q12749 YLR460CYLR460C 1131 nt9.01□□□□□ -0.97
SMC6Q12749 YBL095WYBL095W 813 nt9.01□□□□□ -0.97
SMC6Q12749 YMR166CYMR166C 1107 nt8.99□□□□□ -0.97
SMC6Q12749 UFD1YGR048W 1086 nt8.98□□□□□ -0.97
SMC6Q12749 LSP1YPL004C 1026 nt8.98□□□□□ -0.97
SMC6Q12749 YMC2YBR104W 990 nt8.98□□□□□ -0.97
SMC6Q12749 FET5YFL041W 1869 nt8.98□□□□□ -0.97
SMC6Q12749 AAC3YBR085W 924 nt8.97□□□□□ -0.97
SMC6Q12749 FIT1YDR534C 1587 nt8.97□□□□□ -0.97
SMC6Q12749 NPP2YEL016C 1482 nt8.96□□□□□ -0.97
SMC6Q12749 CHS7YHR142W 951 nt8.96□□□□□ -0.98
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