Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 FUB1YCR076C 753 nt8.66□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 YJL055WYJL055W 738 nt8.66□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 TOP3YLR234W 1971 nt8.66□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 RTG2YGL252C 1767 nt8.66□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.65□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.65□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.65□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.65□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 ATP10YLR393W 840 nt8.65□□□□□ -1.02
SEC39Q12745 AAT1YKL106W 1356 nt8.64□□□□□ -1.03
SEC39Q12745 YMR210WYMR210W 1350 nt8.64□□□□□ -1.03
SEC39Q12745 BNI5YNL166C 1347 nt8.64□□□□□ -1.03
SEC39Q12745 CTF3YLR381W 2202 nt8.64□□□□□ -1.03
SEC39Q12745 PAR32YDL173W 888 nt8.62□□□□□ -1.03
SEC39Q12745 RIB7YBR153W 735 nt8.62□□□□□ -1.03
SEC39Q12745 NDE1YMR145C 1683 nt8.62□□□□□ -1.03
SEC39Q12745 BEM1YBR200W 1656 nt8.6□□□□□ -1.03
SEC39Q12745 SOL2YCR073W-A 948 nt8.6□□□□□ -1.03
SEC39Q12745 NUC1YJL208C 990 nt8.6□□□□□ -1.03
SEC39Q12745 SPE4YLR146C 903 nt8.6□□□□□ -1.03
SEC39Q12745 YBL095WYBL095W 813 nt8.6□□□□□ -1.03
SEC39Q12745 MSC1YML128C 1542 nt8.59□□□□□ -1.03
SEC39Q12745 YJR114WYJR114W 393 nt8.59□□□□□ -1.03
SEC39Q12745 ECM10YEL030W 1935 nt8.58□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 YJL118WYJL118W 660 nt8.58□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 ERG6YML008C 1152 nt8.58□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 RIB1YBL033C 1038 nt8.58□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 PMT7YDR307W 1989 nt8.58□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 GCD11YER025W 1584 nt8.57□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 CSM1YCR086W 573 nt8.57□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 SLG1YOR008C 1137 nt8.57□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 GSF2YML048W 1212 nt8.56□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 YPL264CYPL264C 1062 nt8.56□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.56□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 RPT5YOR117W 1305 nt8.55□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 YMR253CYMR253C 1245 nt8.55□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 GAL3YDR009W 1563 nt8.54□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 YDR455CYDR455C 309 nt8.54□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 YDR306CYDR306C 1437 nt8.54□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 YLR072WYLR072W 2082 nt8.53□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 YMR265CYMR265C 1386 nt8.53□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 GPM1YKL152C 744 nt8.53□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 MHF1YOL086W-A 273 nt8.53□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 ERR3YMR323W 1314 nt8.53□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 ERR1YOR393W 1314 nt8.53□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 ERR2YPL281C 1314 nt8.53□□□□□ -1.04
SEC39Q12745 YMC2YBR104W 990 nt8.52□□□□□ -1.05
SEC39Q12745 YLR173WYLR173W 1827 nt8.52□□□□□ -1.05
SEC39Q12745 YIA6YIL006W 1122 nt8.51□□□□□ -1.05
SEC39Q12745 POT1YIL160C 1254 nt8.51□□□□□ -1.05
SEC39Q12745 LEA1YPL213W 717 nt8.5□□□□□ -1.05
SEC39Q12745 RAS2YNL098C 969 nt8.49□□□□□ -1.05
SEC39Q12745 ATO2YNR002C 849 nt8.49□□□□□ -1.05
SEC39Q12745 SAC7YDR389W 1965 nt8.49□□□□□ -1.05
SEC39Q12745 ELO1YJL196C 933 nt8.48□□□□□ -1.05
SEC39Q12745 YIL108WYIL108W 2091 nt8.48□□□□□ -1.05
SEC39Q12745 SOD2YHR008C 702 nt8.47□□□□□ -1.05
SEC39Q12745 TUB4YLR212C 1422 nt8.46□□□□□ -1.05
SEC39Q12745 ERG13YML126C 1476 nt8.46□□□□□ -1.05
SEC39Q12745 HAP5YOR358W 729 nt8.46□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 AFG2YLR397C 2343 nt8.45□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 YPR126CYPR126C 309 nt8.45□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 YER152CYER152C 1332 nt8.45□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 RPN14YGL004C 1254 nt8.44□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 HXT9YJL219W 1704 nt8.43□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 AQR1YNL065W 1761 nt8.43□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 SAM3YPL274W 1764 nt8.43□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt8.43□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 IML3YBR107C 738 nt8.43□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 YNL040WYNL040W 1371 nt8.43□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 MAS2YHR024C 1449 nt8.43□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 SNZ1YMR096W 894 nt8.42□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 NME1NME1 340 nt8.42□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 YCP4YCR004C 744 nt8.41□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 OYE2YHR179W 1203 nt8.41□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 SUV3YPL029W 2214 nt8.41□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 CTI6YPL181W 1521 nt8.4□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 SAM50YNL026W 1455 nt8.4□□□□□ -1.06
SEC39Q12745 ABP1YCR088W 1779 nt8.39□□□□□ -1.07
SEC39Q12745 POB3YML069W 1659 nt8.37□□□□□ -1.07
SEC39Q12745 RRT6YGL146C 936 nt8.37□□□□□ -1.07
SEC39Q12745 EAF3YPR023C 1206 nt8.37□□□□□ -1.07
SEC39Q12745 CCR4YAL021C 2514 nt8.36□□□□□ -1.07
SEC39Q12745 GNP1YDR508C 1992 nt8.36□□□□□ -1.07
SEC39Q12745 snR86snR86 1004 nt8.36□□□□□ -1.07
SEC39Q12745 MRS4YKR052C 915 nt8.36□□□□□ -1.07
SEC39Q12745 THI3YDL080C 1830 nt8.36□□□□□ -1.07
SEC39Q12745 WSC4YHL028W 1818 nt8.36□□□□□ -1.07
SEC39Q12745 HXT13YEL069C 1695 nt8.35□□□□□ -1.07
SEC39Q12745 TPS1YBR126C 1488 nt8.35□□□□□ -1.07
SEC39Q12745 APS2YJR058C 444 nt8.35□□□□□ -1.07
SEC39Q12745 YNR064CYNR064C 873 nt8.35□□□□□ -1.07
SEC39Q12745 CRC1YOR100C 984 nt8.33□□□□□ -1.08
SEC39Q12745 NDE2YDL085W 1638 nt8.32□□□□□ -1.08
SEC39Q12745 YIL177CYIL177C 5277 nt8.31□□□□□ -1.08
SEC39Q12745 HIS3YOR202W 663 nt8.31□□□□□ -1.08
SEC39Q12745 KEL3YPL263C 1956 nt8.31□□□□□ -1.08
SEC39Q12745 GGA2YHR108W 1758 nt8.3□□□□□ -1.08
SEC39Q12745 IGD1YFR017C 588 nt8.3□□□□□ -1.08
SEC39Q12745 NIF3YGL221C 867 nt8.3□□□□□ -1.08
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