Protein–RNA interactions for Protein: Q12347

HRT3, F-box protein HRT3, yeastyeast

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRT3Q12347 HXT10YFL011W 1641 nt8.76□□□□□ -1.01
HRT3Q12347 ENO1YGR254W 1314 nt8.75□□□□□ -1.01
HRT3Q12347 VBA3YCL069W 1377 nt8.74□□□□□ -1.01
HRT3Q12347 REX2YLR059C 810 nt8.74□□□□□ -1.01
HRT3Q12347 ERO1YML130C 1692 nt8.73□□□□□ -1.01
HRT3Q12347 YGR210CYGR210C 1236 nt8.73□□□□□ -1.01
HRT3Q12347 MET1YKR069W 1782 nt8.73□□□□□ -1.01
HRT3Q12347 SUV3YPL029W 2214 nt8.73□□□□□ -1.01
HRT3Q12347 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.72□□□□□ -1.01
HRT3Q12347 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.72□□□□□ -1.01
HRT3Q12347 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.72□□□□□ -1.01
HRT3Q12347 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.72□□□□□ -1.01
HRT3Q12347 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.72□□□□□ -1.01
HRT3Q12347 VMA11YPL234C 495 nt8.72□□□□□ -1.01
HRT3Q12347 YLR280CYLR280C 351 nt8.71□□□□□ -1.02
HRT3Q12347 snR31snR31 225 nt8.7□□□□□ -1.02
HRT3Q12347 YMR265CYMR265C 1386 nt8.7□□□□□ -1.02
HRT3Q12347 YRF1-2YER190W 5046 nt8.69□□□□□ -1.02
HRT3Q12347 YKL053WYKL053W 375 nt8.69□□□□□ -1.02
HRT3Q12347 HAP5YOR358W 729 nt8.69□□□□□ -1.02
HRT3Q12347 PAU21YOR394W 495 nt8.68□□□□□ -1.02
HRT3Q12347 PAU22YPL282C 495 nt8.68□□□□□ -1.02
HRT3Q12347 YOR343CYOR343C 327 nt8.67□□□□□ -1.02
HRT3Q12347 SNX3YOR357C 489 nt8.67□□□□□ -1.02
HRT3Q12347 SRP54YPR088C 1626 nt8.67□□□□□ -1.02
HRT3Q12347 RPC31YNL151C 756 nt8.66□□□□□ -1.02
HRT3Q12347 CRC1YOR100C 984 nt8.66□□□□□ -1.02
HRT3Q12347 YPL108WYPL108W 507 nt8.66□□□□□ -1.02
HRT3Q12347 FCY1YPR062W 477 nt8.66□□□□□ -1.02
HRT3Q12347 GID7YCL039W 2238 nt8.66□□□□□ -1.02
HRT3Q12347 KRR1YCL059C 951 nt8.65□□□□□ -1.02
HRT3Q12347 AGP3YFL055W 1677 nt8.65□□□□□ -1.03
HRT3Q12347 RPN14YGL004C 1254 nt8.64□□□□□ -1.03
HRT3Q12347 RIM2YBR192W 1134 nt8.64□□□□□ -1.03
HRT3Q12347 YFR020WYFR020W 699 nt8.63□□□□□ -1.03
HRT3Q12347 SAN1YDR143C 1833 nt8.63□□□□□ -1.03
HRT3Q12347 SFP1YLR403W 2052 nt8.63□□□□□ -1.03
HRT3Q12347 INH1YDL181W 258 nt8.62□□□□□ -1.03
HRT3Q12347 YJL160CYJL160C 864 nt8.62□□□□□ -1.03
HRT3Q12347 HXK1YFR053C 1458 nt8.62□□□□□ -1.03
HRT3Q12347 RPL12BYDR418W 498 nt8.61□□□□□ -1.03
HRT3Q12347 GRH1YDR517W 1119 nt8.61□□□□□ -1.03
HRT3Q12347 HRA1HRA1 564 nt8.61□□□□□ -1.03
HRT3Q12347 YPT11YNL304W 1254 nt8.61□□□□□ -1.03
HRT3Q12347 ALD5YER073W 1563 nt8.61□□□□□ -1.03
HRT3Q12347 EMC3YKL207W 762 nt8.6□□□□□ -1.03
HRT3Q12347 DPL1YDR294C 1770 nt8.59□□□□□ -1.03
HRT3Q12347 YOR072WYOR072W 315 nt8.59□□□□□ -1.03
HRT3Q12347 NPP1YCR026C 2229 nt8.58□□□□□ -1.04
HRT3Q12347 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.58□□□□□ -1.04
HRT3Q12347 NBA1YOL070C 1506 nt8.58□□□□□ -1.04
HRT3Q12347 LEU4YNL104C 1860 nt8.57□□□□□ -1.04
HRT3Q12347 TPO4YOR273C 1980 nt8.56□□□□□ -1.04
HRT3Q12347 KGD2YDR148C 1392 nt8.56□□□□□ -1.04
HRT3Q12347 YMR210WYMR210W 1350 nt8.56□□□□□ -1.04
HRT3Q12347 MRP1YDR347W 966 nt8.53□□□□□ -1.04
HRT3Q12347 YMR166CYMR166C 1107 nt8.53□□□□□ -1.04
HRT3Q12347 GAS1YMR307W 1680 nt8.52□□□□□ -1.05
HRT3Q12347 HMG2YLR450W 3138 nt8.51□□□□□ -1.05
HRT3Q12347 YDR467CYDR467C 327 nt8.51□□□□□ -1.05
HRT3Q12347 RSM7YJR113C 744 nt8.51□□□□□ -1.05
HRT3Q12347 LSP1YPL004C 1026 nt8.51□□□□□ -1.05
HRT3Q12347 PTC6YCR079W 1329 nt8.51□□□□□ -1.05
HRT3Q12347 PET18YCR020C 648 nt8.5□□□□□ -1.05
HRT3Q12347 SBP1YHL034C 885 nt8.5□□□□□ -1.05
HRT3Q12347 NPP2YEL016C 1482 nt8.47□□□□□ -1.05
HRT3Q12347 YOR268CYOR268C 399 nt8.46□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 ADA2YDR448W 1305 nt8.46□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 GDH1YOR375C 1365 nt8.46□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 EDC2YER035W 438 nt8.45□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 RRT14YIL127C 621 nt8.45□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 MEX67YPL169C 1800 nt8.45□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.44□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.44□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 YER156CYER156C 1017 nt8.44□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 CAK1YFL029C 1107 nt8.44□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 UTR5YEL035C 501 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt8.43□□□□□ -1.06
HRT3Q12347 YLR460CYLR460C 1131 nt8.42□□□□□ -1.06
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