Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

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Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9.1□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9.1□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt9.1□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt9.1□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt9.1□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt9.1□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 PHB2YGR231C 933 nt9.1□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 LEU2YCL018W 1095 nt9.1□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 NAM8YHR086W 1572 nt9.1□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 FSH2YMR222C 672 nt9.09□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 ADH3YMR083W 1128 nt9.08□□□□□ -0.96
SLX4Q12098 IPL1YPL209C 1104 nt9.07□□□□□ -0.96
SLX4Q12098 TPN1YGL186C 1740 nt9.06□□□□□ -0.96
SLX4Q12098 CYT1YOR065W 930 nt9.06□□□□□ -0.96
SLX4Q12098 snR31snR31 225 nt9.06□□□□□ -0.96
SLX4Q12098 RIM2YBR192W 1134 nt9.06□□□□□ -0.96
SLX4Q12098 RPN14YGL004C 1254 nt9.05□□□□□ -0.96
SLX4Q12098 DPL1YDR294C 1770 nt9.04□□□□□ -0.96
SLX4Q12098 SAN1YDR143C 1833 nt9.04□□□□□ -0.96
SLX4Q12098 FLX1YIL134W 936 nt9.04□□□□□ -0.96
SLX4Q12098 SLG1YOR008C 1137 nt9.04□□□□□ -0.96
SLX4Q12098 TIM44YIL022W 1296 nt9.03□□□□□ -0.96
SLX4Q12098 KGD2YDR148C 1392 nt9.02□□□□□ -0.97
SLX4Q12098 YKR012CYKR012C 378 nt9.02□□□□□ -0.97
SLX4Q12098 REX2YLR059C 810 nt9.02□□□□□ -0.97
SLX4Q12098 RPC31YNL151C 756 nt9.02□□□□□ -0.97
SLX4Q12098 FRA1YLL029W 2250 nt9.01□□□□□ -0.97
SLX4Q12098 YOR072WYOR072W 315 nt9.01□□□□□ -0.97
SLX4Q12098 SDS24YBR214W 1584 nt9.01□□□□□ -0.97
SLX4Q12098 TOM71YHR117W 1920 nt9.01□□□□□ -0.97
SLX4Q12098 SRP54YPR088C 1626 nt8.99□□□□□ -0.97
SLX4Q12098 VBA3YCL069W 1377 nt8.99□□□□□ -0.97
SLX4Q12098 MDL2YPL270W 2322 nt8.98□□□□□ -0.97
SLX4Q12098 MOB1YIL106W 945 nt8.98□□□□□ -0.97
SLX4Q12098 MDM35YKL053C-A 261 nt8.98□□□□□ -0.97
SLX4Q12098 KRR1YCL059C 951 nt8.97□□□□□ -0.97
SLX4Q12098 YCR025CYCR025C 411 nt8.96□□□□□ -0.98
SLX4Q12098 CBK1YNL161W 2271 nt8.96□□□□□ -0.98
SLX4Q12098 DMA2YNL116W 1569 nt8.94□□□□□ -0.98
SLX4Q12098 AAC3YBR085W 924 nt8.93□□□□□ -0.98
SLX4Q12098 LYS20YDL182W 1287 nt8.92□□□□□ -0.98
SLX4Q12098 MLS1YNL117W 1665 nt8.91□□□□□ -0.98
SLX4Q12098 SWM1YDR260C 513 nt8.9□□□□□ -0.98
SLX4Q12098 SBP1YHL034C 885 nt8.9□□□□□ -0.98
SLX4Q12098 CYC3YAL039C 810 nt8.9□□□□□ -0.98
SLX4Q12098 YPL041CYPL041C 624 nt8.9□□□□□ -0.98
SLX4Q12098 LEU4YNL104C 1860 nt8.89□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 ENO1YGR254W 1314 nt8.89□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 SER2YGR208W 930 nt8.89□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 THI3YDL080C 1830 nt8.89□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 MEX67YPL169C 1800 nt8.89□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 YPT11YNL304W 1254 nt8.88□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 SAM50YNL026W 1455 nt8.88□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 GAS1YMR307W 1680 nt8.88□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 HXT10YFL011W 1641 nt8.87□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 ALR1YOL130W 2580 nt8.87□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 YCP4YCR004C 744 nt8.87□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 YFR020WYFR020W 699 nt8.87□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.87□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 NSG2YNL156C 900 nt8.87□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 YHR218WYHR218W 1812 nt8.87□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 PTC6YCR079W 1329 nt8.86□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 SRP102YKL154W 735 nt8.86□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 YLR280CYLR280C 351 nt8.85□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 ERO1YML130C 1692 nt8.84□□□□□ -0.99
SLX4Q12098 GPM1YKL152C 744 nt8.83□□□□□ -1
SLX4Q12098 LPD1YFL018C 1500 nt8.83□□□□□ -1
SLX4Q12098 GGA2YHR108W 1758 nt8.82□□□□□ -1
SLX4Q12098 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.82□□□□□ -1
SLX4Q12098 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.82□□□□□ -1
SLX4Q12098 HTS1YPR033C 1641 nt8.81□□□□□ -1
SLX4Q12098 MGM101YJR144W 810 nt8.81□□□□□ -1
SLX4Q12098 AGP3YFL055W 1677 nt8.81□□□□□ -1
SLX4Q12098 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.8□□□□□ -1
SLX4Q12098 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.8□□□□□ -1
SLX4Q12098 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.8□□□□□ -1
SLX4Q12098 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.8□□□□□ -1
SLX4Q12098 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.8□□□□□ -1
SLX4Q12098 YDR467CYDR467C 327 nt8.8□□□□□ -1
SLX4Q12098 YGR210CYGR210C 1236 nt8.8□□□□□ -1
SLX4Q12098 YHR131CYHR131C 2553 nt8.79□□□□□ -1
SLX4Q12098 UFD1YGR048W 1086 nt8.78□□□□□ -1
SLX4Q12098 NPP2YEL016C 1482 nt8.77□□□□□ -1.01
SLX4Q12098 RSM7YJR113C 744 nt8.75□□□□□ -1.01
SLX4Q12098 THI6YPL214C 1623 nt8.74□□□□□ -1.01
SLX4Q12098 INH1YDL181W 258 nt8.74□□□□□ -1.01
SLX4Q12098 YPL108WYPL108W 507 nt8.74□□□□□ -1.01
SLX4Q12098 YIA6YIL006W 1122 nt8.73□□□□□ -1.01
SLX4Q12098 YBL095WYBL095W 813 nt8.73□□□□□ -1.01
SLX4Q12098 RTG2YGL252C 1767 nt8.72□□□□□ -1.01
SLX4Q12098 YLR173WYLR173W 1827 nt8.72□□□□□ -1.01
SLX4Q12098 YMR007WYMR007W 381 nt8.7□□□□□ -1.02
SLX4Q12098 RIB1YBL033C 1038 nt8.69□□□□□ -1.02
SLX4Q12098 FCY1YPR062W 477 nt8.69□□□□□ -1.02
SLX4Q12098 RNA170RNA170 169 nt8.68□□□□□ -1.02
SLX4Q12098 TMS1YDR105C 1422 nt8.67□□□□□ -1.02
SLX4Q12098 YJL160CYJL160C 864 nt8.67□□□□□ -1.02
SLX4Q12098 ERG6YML008C 1152 nt8.67□□□□□ -1.02
SLX4Q12098 YMR166CYMR166C 1107 nt8.67□□□□□ -1.02
SLX4Q12098 MET22YOL064C 1074 nt8.67□□□□□ -1.02
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