Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 CRC1YOR100C 984 nt8.49□□□□□ -1.05
YPQ1Q12010 SPT20YOL148C 1815 nt8.49□□□□□ -1.05
YPQ1Q12010 MUP1YGR055W 1725 nt8.48□□□□□ -1.05
YPQ1Q12010 SAN1YDR143C 1833 nt8.47□□□□□ -1.05
YPQ1Q12010 MRP1YDR347W 966 nt8.46□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 YOR268CYOR268C 399 nt8.46□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 RIM2YBR192W 1134 nt8.46□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 GID8YMR135C 1368 nt8.46□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 YHR219WYHR219W 1875 nt8.45□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 RPN14YGL004C 1254 nt8.45□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 LSR1LSR1 1175 nt8.45□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 YPT11YNL304W 1254 nt8.44□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 LSP1YPL004C 1026 nt8.44□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 VMA11YPL234C 495 nt8.44□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 PET18YCR020C 648 nt8.42□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 KES1YPL145C 1305 nt8.42□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 MRS6YOR370C 1812 nt8.41□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 YMR166CYMR166C 1107 nt8.41□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 KGD2YDR148C 1392 nt8.4□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 YKL133CYKL133C 1392 nt8.4□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.4□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.4□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.4□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.4□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.4□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt8.4□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt8.4□□□□□ -1.06
YPQ1Q12010 COQ8YGL119W 1506 nt8.39□□□□□ -1.07
YPQ1Q12010 KAE1YKR038C 1161 nt8.39□□□□□ -1.07
YPQ1Q12010 SNX3YOR357C 489 nt8.39□□□□□ -1.07
YPQ1Q12010 MFG1YDL233W 1377 nt8.38□□□□□ -1.07
YPQ1Q12010 GDH1YOR375C 1365 nt8.38□□□□□ -1.07
YPQ1Q12010 EDC2YER035W 438 nt8.38□□□□□ -1.07
YPQ1Q12010 PTC6YCR079W 1329 nt8.37□□□□□ -1.07
YPQ1Q12010 ADA2YDR448W 1305 nt8.37□□□□□ -1.07
YPQ1Q12010 UTR5YEL035C 501 nt8.37□□□□□ -1.07
YPQ1Q12010 RSM7YJR113C 744 nt8.37□□□□□ -1.07
YPQ1Q12010 SGA1YIL099W 1650 nt8.37□□□□□ -1.07
YPQ1Q12010 GAS1YMR307W 1680 nt8.37□□□□□ -1.07
YPQ1Q12010 HOL1YNR055C 1761 nt8.35□□□□□ -1.07
YPQ1Q12010 RPD3YNL330C 1302 nt8.34□□□□□ -1.07
YPQ1Q12010 MFT1YML062C 1179 nt8.34□□□□□ -1.07
YPQ1Q12010 ZAP1YJL056C 2643 nt8.33□□□□□ -1.08
YPQ1Q12010 RRT14YIL127C 621 nt8.33□□□□□ -1.08
YPQ1Q12010 YJR149WYJR149W 1215 nt8.33□□□□□ -1.08
YPQ1Q12010 CAK1YFL029C 1107 nt8.32□□□□□ -1.08
YPQ1Q12010 SBP1YHL034C 885 nt8.32□□□□□ -1.08
YPQ1Q12010 YER156CYER156C 1017 nt8.31□□□□□ -1.08
YPQ1Q12010 TAD2YJL035C 753 nt8.31□□□□□ -1.08
YPQ1Q12010 ELP4YPL101W 1371 nt8.3□□□□□ -1.08
YPQ1Q12010 YMR206WYMR206W 942 nt8.29□□□□□ -1.08
YPQ1Q12010 OCH1YGL038C 1443 nt8.29□□□□□ -1.08
YPQ1Q12010 YLR460CYLR460C 1131 nt8.28□□□□□ -1.08
YPQ1Q12010 CMP2YML057W 1815 nt8.27□□□□□ -1.09
YPQ1Q12010 TOS1YBR162C 1368 nt8.27□□□□□ -1.09
YPQ1Q12010 MET22YOL064C 1074 nt8.27□□□□□ -1.09
YPQ1Q12010 HOG1YLR113W 1308 nt8.26□□□□□ -1.09
YPQ1Q12010 RPS6AYPL090C 711 nt8.25□□□□□ -1.09
YPQ1Q12010 RPS6BYBR181C 711 nt8.25□□□□□ -1.09
YPQ1Q12010 CHS7YHR142W 951 nt8.24□□□□□ -1.09
YPQ1Q12010 ADE1YAR015W 921 nt8.24□□□□□ -1.09
YPQ1Q12010 BXI1YNL305C 894 nt8.24□□□□□ -1.09
YPQ1Q12010 RPC31YNL151C 756 nt8.22□□□□□ -1.09
YPQ1Q12010 BSP1YPR171W 1731 nt8.22□□□□□ -1.09
YPQ1Q12010 UGP1YKL035W 1500 nt8.22□□□□□ -1.09
YPQ1Q12010 BAP3YDR046C 1815 nt8.22□□□□□ -1.09
YPQ1Q12010 YPR084WYPR084W 1371 nt8.22□□□□□ -1.09
YPQ1Q12010 PDC6YGR087C 1692 nt8.21□□□□□ -1.09
YPQ1Q12010 SSL2YIL143C 2532 nt8.21□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 KRR1YCL059C 951 nt8.21□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 CWP2YKL096W-A 279 nt8.21□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 YJL043WYJL043W 774 nt8.2□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 TDH1YJL052W 999 nt8.19□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 FUS3YBL016W 1062 nt8.19□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 RNA170RNA170 169 nt8.19□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 PRE5YMR314W 705 nt8.19□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 OLA1YBR025C 1185 nt8.19□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 DPL1YDR294C 1770 nt8.19□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 THI3YDL080C 1830 nt8.18□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 HIS2YFR025C 1008 nt8.18□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.18□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 PET494YNR045W 1470 nt8.18□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 GGA2YHR108W 1758 nt8.17□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 SDH8YBR269C 417 nt8.17□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 ATP2YJR121W 1536 nt8.17□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 YPL247CYPL247C 1572 nt8.16□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 NUP53YMR153W 1428 nt8.15□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 HSL7YBR133C 2484 nt8.15□□□□□ -1.1
YPQ1Q12010 YPT31YER031C 672 nt8.13□□□□□ -1.11
YPQ1Q12010 ODC1YPL134C 933 nt8.13□□□□□ -1.11
YPQ1Q12010 GPM1YKL152C 744 nt8.12□□□□□ -1.11
YPQ1Q12010 YIL168WYIL168W 384 nt8.11□□□□□ -1.11
YPQ1Q12010 YIR035CYIR035C 765 nt8.1□□□□□ -1.11
YPQ1Q12010 RHO1YPR165W 630 nt8.1□□□□□ -1.11
YPQ1Q12010 HEL2YDR266C 1920 nt8.06□□□□□ -1.12
YPQ1Q12010 YDR467CYDR467C 327 nt8.06□□□□□ -1.12
YPQ1Q12010 AAC3YBR085W 924 nt8.06□□□□□ -1.12
YPQ1Q12010 TMS1YDR105C 1422 nt8.05□□□□□ -1.12
YPQ1Q12010 LEU4YNL104C 1860 nt8.05□□□□□ -1.12
YPQ1Q12010 THI73YLR004C 1572 nt8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.4 ms