Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Vps8Q0P5W1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Vps8Q0P5W1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Vps8Q0P5W1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Vps8Q0P5W1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Vps8Q0P5W1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Vps8Q0P5W1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Vps8Q0P5W1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Vps8Q0P5W1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Vps8Q0P5W1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Vps8Q0P5W1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Vps8Q0P5W1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Vps8Q0P5W1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Vps8Q0P5W1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Vps8Q0P5W1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Vps8Q0P5W1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Vps8Q0P5W1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Vps8Q0P5W1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Vps8Q0P5W1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Vps8Q0P5W1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Vps8Q0P5W1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Vps8Q0P5W1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Vps8Q0P5W1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Vps8Q0P5W1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Vps8Q0P5W1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Vps8Q0P5W1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Vps8Q0P5W1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Vps8Q0P5W1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Vps8Q0P5W1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Vps8Q0P5W1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Vps8Q0P5W1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Vps8Q0P5W1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Vps8Q0P5W1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Vps8Q0P5W1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Vps8Q0P5W1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Vps8Q0P5W1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Vps8Q0P5W1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Vps8Q0P5W1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Vps8Q0P5W1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Vps8Q0P5W1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Vps8Q0P5W1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Vps8Q0P5W1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Vps8Q0P5W1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Vps8Q0P5W1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Vps8Q0P5W1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Vps8Q0P5W1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Vps8Q0P5W1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Vps8Q0P5W1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Vps8Q0P5W1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Vps8Q0P5W1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Vps8Q0P5W1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Vps8Q0P5W1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Vps8Q0P5W1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Vps8Q0P5W1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Vps8Q0P5W1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Vps8Q0P5W1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Vps8Q0P5W1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Vps8Q0P5W1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Vps8Q0P5W1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Vps8Q0P5W1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Vps8Q0P5W1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Vps8Q0P5W1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Vps8Q0P5W1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Vps8Q0P5W1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Vps8Q0P5W1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Vps8Q0P5W1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Vps8Q0P5W1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Vps8Q0P5W1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Vps8Q0P5W1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Vps8Q0P5W1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Vps8Q0P5W1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Vps8Q0P5W1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Vps8Q0P5W1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Vps8Q0P5W1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Vps8Q0P5W1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Vps8Q0P5W1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Vps8Q0P5W1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Vps8Q0P5W1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Vps8Q0P5W1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Vps8Q0P5W1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Vps8Q0P5W1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Vps8Q0P5W1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Vps8Q0P5W1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Vps8Q0P5W1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Vps8Q0P5W1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Vps8Q0P5W1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Vps8Q0P5W1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Vps8Q0P5W1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Vps8Q0P5W1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Vps8Q0P5W1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Vps8Q0P5W1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Vps8Q0P5W1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Vps8Q0P5W1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Vps8Q0P5W1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Vps8Q0P5W1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Vps8Q0P5W1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Vps8Q0P5W1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Vps8Q0P5W1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Vps8Q0P5W1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.45■■■■□ 3.26
Vps8Q0P5W1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179 ms