Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM1Q08AH1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM1Q08AH1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSM1Q08AH1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSM1Q08AH1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSM1Q08AH1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSM1Q08AH1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSM1Q08AH1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSM1Q08AH1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSM1Q08AH1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSM1Q08AH1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSM1Q08AH1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSM1Q08AH1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSM1Q08AH1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSM1Q08AH1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSM1Q08AH1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSM1Q08AH1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSM1Q08AH1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSM1Q08AH1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSM1Q08AH1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSM1Q08AH1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms