Protein–RNA interactions for Protein: Q06159

ATG39, Autophagy-related protein 39, yeastyeast

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG39Q06159 YPR126CYPR126C 309 nt6.83□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 ITR1YDR497C 1755 nt6.82□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 YIL108WYIL108W 2091 nt6.82□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 RRT8YOL048C 1029 nt6.82□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 snR4snR4 186 nt6.82□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 KRR1YCL059C 951 nt6.81□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 STF1YDL130W-A 261 nt6.81□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 YMR262WYMR262W 942 nt6.81□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 ADE8YDR408C 645 nt6.8□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 CPD1YGR247W 720 nt6.8□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 TAF13YML098W 504 nt6.8□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 IML3YBR107C 738 nt6.8□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 HSV2YGR223C 1347 nt6.78□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 CTI6YPL181W 1521 nt6.78□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 RAD51YER095W 1203 nt6.78□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 GUT1YHL032C 2130 nt6.78□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 VMA11YPL234C 495 nt6.78□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 ADH7YCR105W 1086 nt6.77□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 YJR114WYJR114W 393 nt6.77□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt6.76□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 ATP10YLR393W 840 nt6.76□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 MHF1YOL086W-A 273 nt6.76□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 INH1YDL181W 258 nt6.75□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 SPS100YHR139C 981 nt6.75□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 RPC31YNL151C 756 nt6.75□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 RIM2YBR192W 1134 nt6.75□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 YIL177CYIL177C 5277 nt6.75□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 SAC7YDR389W 1965 nt6.75□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 ITR2YOL103W 1830 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 CHA1YCL064C 1083 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 SLM3YDL033C 1254 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 PAU15YIR041W 375 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 PRC1YMR297W 1599 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt6.73□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 POT1YIL160C 1254 nt6.73□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 TIP1YBR067C 633 nt6.73□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 HXT13YEL069C 1695 nt6.72□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 TVP23YDR084C 600 nt6.72□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 OPI3YJR073C 621 nt6.72□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 YNR064CYNR064C 873 nt6.72□□□□□ -1.33
ATG39Q06159 SNX3YOR357C 489 nt6.71□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 MSB3YNL293W 1902 nt6.71□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 ELO1YJL196C 933 nt6.7□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 YNL040WYNL040W 1371 nt6.69□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 DPL1YDR294C 1770 nt6.69□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 ABZ2YMR289W 1125 nt6.69□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 ATO2YNR002C 849 nt6.69□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 YJL045WYJL045W 1905 nt6.68□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 MET1YKR069W 1782 nt6.68□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 MDH2YOL126C 1134 nt6.68□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 CMK2YOL016C 1344 nt6.68□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 HXT11YOL156W 1704 nt6.67□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 DIA4YHR011W 1341 nt6.67□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 MAS2YHR024C 1449 nt6.67□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 KEL3YPL263C 1956 nt6.66□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 GSF2YML048W 1212 nt6.66□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 ENO2YHR174W 1314 nt6.66□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 LEU4YNL104C 1860 nt6.66□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 PAU5YFL020C 369 nt6.65□□□□□ -1.34
ATG39Q06159 ERR3YMR323W 1314 nt6.65□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 ERR1YOR393W 1314 nt6.65□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 ERR2YPL281C 1314 nt6.65□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 YMR265CYMR265C 1386 nt6.65□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 TUB4YLR212C 1422 nt6.65□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt6.64□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 SPE4YLR146C 903 nt6.64□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 YMR253CYMR253C 1245 nt6.64□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 HAP5YOR358W 729 nt6.64□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 AMF1YOR378W 1548 nt6.64□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 CDC13YDL220C 2775 nt6.63□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 RPN14YGL004C 1254 nt6.63□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 NIF3YGL221C 867 nt6.63□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 APS2YJR058C 444 nt6.63□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 ERG6YML008C 1152 nt6.63□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 TRP2YER090W 1524 nt6.62□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 YER152CYER152C 1332 nt6.62□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 ESS1YJR017C 513 nt6.62□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 BAP3YDR046C 1815 nt6.62□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 NPP2YEL016C 1482 nt6.61□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 YDR306CYDR306C 1437 nt6.61□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 STP3YLR375W 1032 nt6.61□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 PGC1YPL206C 966 nt6.61□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 snR31snR31 225 nt6.61□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 AQR1YNL065W 1761 nt6.61□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 SUV3YPL029W 2214 nt6.61□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 TPC1YGR096W 945 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 SWT21YNL187W 1074 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 KRE1YNL322C 942 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt6.59□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt6.59□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 YDR467CYDR467C 327 nt6.59□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 ADH6YMR318C 1083 nt6.59□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 FCP1YMR277W 2199 nt6.59□□□□□ -1.35
ATG39Q06159 SRM1YGL097W 1449 nt6.59□□□□□ -1.36
ATG39Q06159 PMT7YDR307W 1989 nt6.58□□□□□ -1.36
ATG39Q06159 CRC1YOR100C 984 nt6.58□□□□□ -1.36
ATG39Q06159 CKI1YLR133W 1749 nt6.58□□□□□ -1.36
ATG39Q06159 HEL1YKR017C 1656 nt6.58□□□□□ -1.36
ATG39Q06159 PAR32YDL173W 888 nt6.57□□□□□ -1.36
ATG39Q06159 LEU2YCL018W 1095 nt6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.7 ms