Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms