Protein–RNA interactions for Protein: P40489

XBP1, Transcriptional repressor XBP1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
XBP1P40489 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.46□□□□□ -1.22
XBP1P40489 MOB1YIL106W 945 nt7.46□□□□□ -1.22
XBP1P40489 ADH3YMR083W 1128 nt7.46□□□□□ -1.22
XBP1P40489 VMA11YPL234C 495 nt7.46□□□□□ -1.22
XBP1P40489 MET8YBR213W 825 nt7.46□□□□□ -1.22
XBP1P40489 LEU2YCL018W 1095 nt7.46□□□□□ -1.22
XBP1P40489 GAL2YLR081W 1725 nt7.46□□□□□ -1.22
XBP1P40489 TPC1YGR096W 945 nt7.45□□□□□ -1.22
XBP1P40489 PCP1YGR101W 1041 nt7.45□□□□□ -1.22
XBP1P40489 SER2YGR208W 930 nt7.44□□□□□ -1.22
XBP1P40489 PHB2YGR231C 933 nt7.44□□□□□ -1.22
XBP1P40489 YNR064CYNR064C 873 nt7.44□□□□□ -1.22
XBP1P40489 SNX3YOR357C 489 nt7.44□□□□□ -1.22
XBP1P40489 ARO7YPR060C 771 nt7.44□□□□□ -1.22
XBP1P40489 HTS1YPR033C 1641 nt7.43□□□□□ -1.22
XBP1P40489 HXK1YFR053C 1458 nt7.43□□□□□ -1.22
XBP1P40489 YKR012CYKR012C 378 nt7.42□□□□□ -1.22
XBP1P40489 RPC31YNL151C 756 nt7.42□□□□□ -1.22
XBP1P40489 ALD5YER073W 1563 nt7.42□□□□□ -1.22
XBP1P40489 HEM14YER014W 1620 nt7.41□□□□□ -1.22
XBP1P40489 AGP3YFL055W 1677 nt7.41□□□□□ -1.22
XBP1P40489 SAC7YDR389W 1965 nt7.41□□□□□ -1.22
XBP1P40489 YOR072WYOR072W 315 nt7.41□□□□□ -1.22
XBP1P40489 INH1YDL181W 258 nt7.4□□□□□ -1.22
XBP1P40489 RIM2YBR192W 1134 nt7.4□□□□□ -1.22
XBP1P40489 SRP102YKL154W 735 nt7.39□□□□□ -1.23
XBP1P40489 BUD20YLR074C 501 nt7.39□□□□□ -1.23
XBP1P40489 ENO1YGR254W 1314 nt7.38□□□□□ -1.23
XBP1P40489 KRR1YCL059C 951 nt7.38□□□□□ -1.23
XBP1P40489 KEL3YPL263C 1956 nt7.37□□□□□ -1.23
XBP1P40489 ELO1YJL196C 933 nt7.37□□□□□ -1.23
XBP1P40489 NAM8YHR086W 1572 nt7.37□□□□□ -1.23
XBP1P40489 SDS24YBR214W 1584 nt7.36□□□□□ -1.23
XBP1P40489 LEU4YNL104C 1860 nt7.36□□□□□ -1.23
XBP1P40489 NBA1YOL070C 1506 nt7.36□□□□□ -1.23
XBP1P40489 DPL1YDR294C 1770 nt7.36□□□□□ -1.23
XBP1P40489 snR31snR31 225 nt7.35□□□□□ -1.23
XBP1P40489 ERO1YML130C 1692 nt7.33□□□□□ -1.24
XBP1P40489 YGR210CYGR210C 1236 nt7.33□□□□□ -1.24
XBP1P40489 YLR280CYLR280C 351 nt7.33□□□□□ -1.24
XBP1P40489 YDR467CYDR467C 327 nt7.32□□□□□ -1.24
XBP1P40489 REX2YLR059C 810 nt7.32□□□□□ -1.24
XBP1P40489 SWT21YNL187W 1074 nt7.32□□□□□ -1.24
XBP1P40489 YMR265CYMR265C 1386 nt7.32□□□□□ -1.24
XBP1P40489 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.31□□□□□ -1.24
XBP1P40489 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.31□□□□□ -1.24
XBP1P40489 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.31□□□□□ -1.24
XBP1P40489 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.31□□□□□ -1.24
XBP1P40489 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.31□□□□□ -1.24
XBP1P40489 RPN14YGL004C 1254 nt7.31□□□□□ -1.24
XBP1P40489 FCY1YPR062W 477 nt7.31□□□□□ -1.24
XBP1P40489 YOR343CYOR343C 327 nt7.3□□□□□ -1.24
XBP1P40489 VBA3YCL069W 1377 nt7.3□□□□□ -1.24
XBP1P40489 MEX67YPL169C 1800 nt7.29□□□□□ -1.24
XBP1P40489 HRA1HRA1 564 nt7.29□□□□□ -1.24
XBP1P40489 HAP5YOR358W 729 nt7.29□□□□□ -1.24
XBP1P40489 NPP2YEL016C 1482 nt7.29□□□□□ -1.24
XBP1P40489 YRF1-2YER190W 5046 nt7.28□□□□□ -1.24
XBP1P40489 RPL12BYDR418W 498 nt7.28□□□□□ -1.24
XBP1P40489 SRP54YPR088C 1626 nt7.27□□□□□ -1.25
XBP1P40489 YPT11YNL304W 1254 nt7.27□□□□□ -1.25
XBP1P40489 MCM5YLR274W 2328 nt7.27□□□□□ -1.25
XBP1P40489 MET1YKR069W 1782 nt7.26□□□□□ -1.25
XBP1P40489 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.26□□□□□ -1.25
XBP1P40489 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.26□□□□□ -1.25
XBP1P40489 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.26□□□□□ -1.25
XBP1P40489 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.26□□□□□ -1.25
XBP1P40489 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.26□□□□□ -1.25
XBP1P40489 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.26□□□□□ -1.25
XBP1P40489 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.26□□□□□ -1.25
XBP1P40489 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.26□□□□□ -1.25
XBP1P40489 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.26□□□□□ -1.25
XBP1P40489 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.26□□□□□ -1.25
XBP1P40489 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.26□□□□□ -1.25
XBP1P40489 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.26□□□□□ -1.25
XBP1P40489 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.26□□□□□ -1.25
XBP1P40489 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.26□□□□□ -1.25
XBP1P40489 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.26□□□□□ -1.25
XBP1P40489 YPL108WYPL108W 507 nt7.26□□□□□ -1.25
XBP1P40489 GRH1YDR517W 1119 nt7.25□□□□□ -1.25
XBP1P40489 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.25□□□□□ -1.25
XBP1P40489 MIM1YOL026C 342 nt7.25□□□□□ -1.25
XBP1P40489 SUV3YPL029W 2214 nt7.25□□□□□ -1.25
XBP1P40489 SFL1YOR140W 2301 nt7.24□□□□□ -1.25
XBP1P40489 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.23□□□□□ -1.25
XBP1P40489 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.23□□□□□ -1.25
XBP1P40489 YKL053WYKL053W 375 nt7.22□□□□□ -1.25
XBP1P40489 YFR020WYFR020W 699 nt7.21□□□□□ -1.26
XBP1P40489 RSM7YJR113C 744 nt7.21□□□□□ -1.26
XBP1P40489 EMC3YKL207W 762 nt7.21□□□□□ -1.26
XBP1P40489 CRC1YOR100C 984 nt7.21□□□□□ -1.26
XBP1P40489 FET5YFL041W 1869 nt7.2□□□□□ -1.26
XBP1P40489 GPM1YKL152C 744 nt7.2□□□□□ -1.26
XBP1P40489 YBL095WYBL095W 813 nt7.2□□□□□ -1.26
XBP1P40489 YMC2YBR104W 990 nt7.2□□□□□ -1.26
XBP1P40489 TRP2YER090W 1524 nt7.2□□□□□ -1.26
XBP1P40489 MTO1YGL236C 2010 nt7.2□□□□□ -1.26
XBP1P40489 FRA1YLL029W 2250 nt7.2□□□□□ -1.26
XBP1P40489 RSC4YKR008W 1878 nt7.19□□□□□ -1.26
XBP1P40489 MRP1YDR347W 966 nt7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.5 ms