Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 MYO1YHR023W 5787 nt1.51□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 APL3YBL037W 3078 nt1.51□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt1.5□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 YLR282CYLR282C 342 nt1.5□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.5□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 SWI4YER111C 3282 nt1.49□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 RAD9YDR217C 3930 nt1.48□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 NOP9YJL010C 2001 nt1.48□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 COX5BYIL111W 456 nt1.47□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 YLL020CYLL020C 306 nt1.47□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 CDC25YLR310C 4770 nt1.46□□□□□ -2.18
CLF1Q12309 WAR1YML076C 2835 nt1.45□□□□□ -2.18
CLF1Q12309 CLU1YMR012W 3834 nt1.45□□□□□ -2.18
CLF1Q12309 SEC3YER008C 4011 nt1.44□□□□□ -2.18
CLF1Q12309 CHS6YJL099W 2241 nt1.44□□□□□ -2.18
CLF1Q12309 TAH1YCR060W 336 nt1.44□□□□□ -2.18
CLF1Q12309 snR39BsnR39B 96 nt1.44□□□□□ -2.18
CLF1Q12309 NUP145YGL092W 3954 nt1.44□□□□□ -2.18
CLF1Q12309 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.43□□□□□ -2.18
CLF1Q12309 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.43□□□□□ -2.18
CLF1Q12309 UTP8YGR128C 2142 nt1.42□□□□□ -2.18
CLF1Q12309 YLR041WYLR041W 321 nt1.42□□□□□ -2.18
CLF1Q12309 SMC1YFL008W 3678 nt1.42□□□□□ -2.18
CLF1Q12309 snR190snR190 190 nt1.41□□□□□ -2.18
CLF1Q12309 FYV10YIL097W 1551 nt1.41□□□□□ -2.18
CLF1Q12309 YML002WYML002W 2214 nt1.4□□□□□ -2.18
CLF1Q12309 BUD3YCL014W 4911 nt1.4□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 OST4YDL232W 111 nt1.39□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.39□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.39□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 UBP3YER151C 2739 nt1.39□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 SIP4YJL089W 2490 nt1.38□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.38□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 STF2YGR008C 255 nt1.38□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 QCR9YGR183C 201 nt1.38□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.38□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 YDR544CYDR544C 429 nt1.37□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.37□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 COG6YNL041C 2520 nt1.37□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.37□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 NST1YNL091W 3723 nt1.36□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 YBL109WYBL109W 336 nt1.36□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 SPT7YBR081C 3999 nt1.36□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 YBR099CYBR099C 384 nt1.36□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.35□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 RPL26BYGR034W 384 nt1.34□□□□□ -2.19
CLF1Q12309 PMP2YEL017C-A 132 nt1.33□□□□□ -2.2
CLF1Q12309 HUG1YML058W-A 207 nt1.33□□□□□ -2.2
CLF1Q12309 ROM2YLR371W 4071 nt1.32□□□□□ -2.2
CLF1Q12309 SOM1YEL059C-A 225 nt1.32□□□□□ -2.2
CLF1Q12309 YPR117WYPR117W 7470 nt1.31□□□□□ -2.2
CLF1Q12309 KAP120YPL125W 3099 nt1.31□□□□□ -2.2
CLF1Q12309 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt1.3□□□□□ -2.2
CLF1Q12309 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.3□□□□□ -2.2
CLF1Q12309 YLR232WYLR232W 348 nt1.3□□□□□ -2.2
CLF1Q12309 RCO1YMR075W 2055 nt1.29□□□□□ -2.2
CLF1Q12309 TFB5YDR079C-A 219 nt1.29□□□□□ -2.2
CLF1Q12309 YDR210WYDR210W 228 nt1.28□□□□□ -2.2
CLF1Q12309 SEC1YDR164C 2175 nt1.25□□□□□ -2.21
CLF1Q12309 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.24□□□□□ -2.21
CLF1Q12309 YBR178WYBR178W 375 nt1.24□□□□□ -2.21
CLF1Q12309 PRP16YKR086W 3216 nt1.24□□□□□ -2.21
CLF1Q12309 YDL073WYDL073W 2955 nt1.23□□□□□ -2.21
CLF1Q12309 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.22□□□□□ -2.21
CLF1Q12309 BEM2YER155C 6504 nt1.22□□□□□ -2.21
CLF1Q12309 SEC8YPR055W 3198 nt1.21□□□□□ -2.22
CLF1Q12309 RKR1YMR247C 4689 nt1.19□□□□□ -2.22
CLF1Q12309 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.18□□□□□ -2.22
CLF1Q12309 YJR029WYJR029W 5268 nt1.18□□□□□ -2.22
CLF1Q12309 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.18□□□□□ -2.22
CLF1Q12309 VAM6YDL077C 3150 nt1.18□□□□□ -2.22
CLF1Q12309 snR61snR61 90 nt1.17□□□□□ -2.22
CLF1Q12309 SCC2YDR180W 4482 nt1.17□□□□□ -2.22
CLF1Q12309 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.16□□□□□ -2.22
CLF1Q12309 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.16□□□□□ -2.22
CLF1Q12309 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.16□□□□□ -2.22
CLF1Q12309 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.16□□□□□ -2.22
CLF1Q12309 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.16□□□□□ -2.22
CLF1Q12309 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.16□□□□□ -2.22
CLF1Q12309 YMR326CYMR326C 309 nt1.15□□□□□ -2.23
CLF1Q12309 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.12□□□□□ -2.23
CLF1Q12309 BIR1YJR089W 2865 nt1.12□□□□□ -2.23
CLF1Q12309 DOP1YDR141C 5097 nt1.12□□□□□ -2.23
CLF1Q12309 NNF2YGR089W 2811 nt1.11□□□□□ -2.23
CLF1Q12309 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt1.1□□□□□ -2.23
CLF1Q12309 YHR217CYHR217C 462 nt1.1□□□□□ -2.23
CLF1Q12309 UTP20YBL004W 7482 nt1.07□□□□□ -2.24
CLF1Q12309 YNL266WYNL266W 420 nt1.06□□□□□ -2.24
CLF1Q12309 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1.06□□□□□ -2.24
CLF1Q12309 BEM3YPL115C 3387 nt1.06□□□□□ -2.24
CLF1Q12309 YSP1YHR155W 3687 nt1.04□□□□□ -2.24
CLF1Q12309 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.02□□□□□ -2.25
CLF1Q12309 snR81snR81 201 nt1.01□□□□□ -2.25
CLF1Q12309 PAU24YBR301W 363 nt1.01□□□□□ -2.25
CLF1Q12309 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.01□□□□□ -2.25
CLF1Q12309 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1□□□□□ -2.25
CLF1Q12309 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.99□□□□□ -2.25
CLF1Q12309 GLG1YKR058W 1851 nt0.99□□□□□ -2.25
CLF1Q12309 ULP2YIL031W 3105 nt0.99□□□□□ -2.25
CLF1Q12309 SBH1YER087C-B 249 nt0.98□□□□□ -2.25
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