Protein–RNA interactions for Protein: Q12240

YDR215C, Uncharacterized protein YDR215C, yeastyeast

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDR215CQ12240 MSH6YDR097C 3729 nt1.94□□□□□ -2.1
YDR215CQ12240 TUS1YLR425W 3924 nt1.94□□□□□ -2.1
YDR215CQ12240 FAR11YNL127W 2862 nt1.93□□□□□ -2.1
YDR215CQ12240 CHS1YNL192W 3396 nt1.93□□□□□ -2.1
YDR215CQ12240 SKI7YOR076C 2244 nt1.93□□□□□ -2.1
YDR215CQ12240 RTT101YJL047C 2529 nt1.92□□□□□ -2.1
YDR215CQ12240 BNI1YNL271C 5862 nt1.91□□□□□ -2.1
YDR215CQ12240 BRE1YDL074C 2103 nt1.91□□□□□ -2.1
YDR215CQ12240 RPL41AYDL184C 78 nt1.91□□□□□ -2.1
YDR215CQ12240 KRE33YNL132W 3171 nt1.91□□□□□ -2.1
YDR215CQ12240 YLR422WYLR422W 5799 nt1.9□□□□□ -2.1
YDR215CQ12240 TOR2YKL203C 7425 nt1.9□□□□□ -2.1
YDR215CQ12240 PDR11YIL013C 4236 nt1.9□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 YLR419WYLR419W 4308 nt1.89□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 SCD5YOR329C 2619 nt1.89□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 CSF1YLR087C 8877 nt1.88□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 SSD1YDR293C 3753 nt1.88□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.88□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt1.88□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 KIP1YBL063W 3336 nt1.88□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 YOL098CYOL098C 3114 nt1.86□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt1.86□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 snR14snR14 160 nt1.86□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 GEA2YEL022W 4380 nt1.86□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 EST1YLR233C 2100 nt1.85□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 EMC5YIL027C 426 nt1.85□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 snR38snR38 95 nt1.85□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 AI1Q0050 2505 nt1.85□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt1.84□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 YML054C-AYML054C-A 159 nt1.84□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt1.84□□□□□ -2.11
YDR215CQ12240 UBR2YLR024C 5619 nt1.83□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 SAC3YDR159W 3906 nt1.83□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 PRP16YKR086W 3216 nt1.82□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 STO1YMR125W 2586 nt1.82□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.82□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 SMC4YLR086W 4257 nt1.82□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 PET127YOR017W 2403 nt1.82□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 MSB1YOR188W 3414 nt1.81□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 MYO4YAL029C 4416 nt1.8□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 ROM2YLR371W 4071 nt1.8□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 YOR093CYOR093C 4947 nt1.8□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 PKH3YDR466W 2697 nt1.8□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 YMR045CYMR045C 5268 nt1.8□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 HER1YOR227W 3741 nt1.79□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 snR69snR69 101 nt1.79□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 FIG2YCR089W 4830 nt1.79□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 TFC3YAL001C 3483 nt1.78□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 SPP41YDR464W 4308 nt1.78□□□□□ -2.12
YDR215CQ12240 INO80YGL150C 4470 nt1.77□□□□□ -2.13
YDR215CQ12240 NIP1YMR309C 2439 nt1.77□□□□□ -2.13
YDR215CQ12240 SXM1YDR395W 2835 nt1.76□□□□□ -2.13
YDR215CQ12240 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.76□□□□□ -2.13
YDR215CQ12240 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.76□□□□□ -2.13
YDR215CQ12240 KAP122YGL016W 3246 nt1.76□□□□□ -2.13
YDR215CQ12240 FKS1YLR342W 5631 nt1.76□□□□□ -2.13
YDR215CQ12240 PMD1YER132C 5262 nt1.76□□□□□ -2.13
YDR215CQ12240 RDS3YPR094W 324 nt1.75□□□□□ -2.13
YDR215CQ12240 TDA9YML081W 3756 nt1.75□□□□□ -2.13
YDR215CQ12240 CSE1YGL238W 2883 nt1.73□□□□□ -2.13
YDR215CQ12240 SEC8YPR055W 3198 nt1.73□□□□□ -2.13
YDR215CQ12240 DGR1YNL130C-A 147 nt1.73□□□□□ -2.13
YDR215CQ12240 USO1YDL058W 5373 nt1.72□□□□□ -2.13
YDR215CQ12240 ULP2YIL031W 3105 nt1.71□□□□□ -2.14
YDR215CQ12240 APL3YBL037W 3078 nt1.71□□□□□ -2.14
YDR215CQ12240 YSP1YHR155W 3687 nt1.69□□□□□ -2.14
YDR215CQ12240 UTP22YGR090W 3714 nt1.69□□□□□ -2.14
YDR215CQ12240 PET111YMR257C 2403 nt1.68□□□□□ -2.14
YDR215CQ12240 DNF3YMR162C 4971 nt1.68□□□□□ -2.14
YDR215CQ12240 UBP2YOR124C 3819 nt1.67□□□□□ -2.14
YDR215CQ12240 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.67□□□□□ -2.14
YDR215CQ12240 HUG1YML058W-A 207 nt1.67□□□□□ -2.14
YDR215CQ12240 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.66□□□□□ -2.14
YDR215CQ12240 SEC31YDL195W 3822 nt1.65□□□□□ -2.14
YDR215CQ12240 SKI3YPR189W 4299 nt1.65□□□□□ -2.14
YDR215CQ12240 IRC20YLR247C 4671 nt1.65□□□□□ -2.15
YDR215CQ12240 SEC3YER008C 4011 nt1.64□□□□□ -2.15
YDR215CQ12240 MSH3YCR092C 3057 nt1.63□□□□□ -2.15
YDR215CQ12240 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.63□□□□□ -2.15
YDR215CQ12240 MON2YNL297C 4911 nt1.62□□□□□ -2.15
YDR215CQ12240 PAU12YGR294W 363 nt1.61□□□□□ -2.15
YDR215CQ12240 KCS1YDR017C 3153 nt1.6□□□□□ -2.15
YDR215CQ12240 EST2YLR318W 2655 nt1.6□□□□□ -2.15
YDR215CQ12240 FAB1YFR019W 6837 nt1.6□□□□□ -2.15
YDR215CQ12240 NEO1YIL048W 3456 nt1.6□□□□□ -2.15
YDR215CQ12240 SIP4YJL089W 2490 nt1.58□□□□□ -2.16
YDR215CQ12240 YCS4YLR272C 3531 nt1.58□□□□□ -2.16
YDR215CQ12240 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.58□□□□□ -2.16
YDR215CQ12240 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.58□□□□□ -2.16
YDR215CQ12240 NST1YNL091W 3723 nt1.58□□□□□ -2.16
YDR215CQ12240 BUL2YML111W 2763 nt1.56□□□□□ -2.16
YDR215CQ12240 SWI4YER111C 3282 nt1.56□□□□□ -2.16
YDR215CQ12240 CDC25YLR310C 4770 nt1.56□□□□□ -2.16
YDR215CQ12240 ATG9YDL149W 2994 nt1.55□□□□□ -2.16
YDR215CQ12240 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.54□□□□□ -2.16
YDR215CQ12240 TMA7YLR262C-A 195 nt1.54□□□□□ -2.16
YDR215CQ12240 MSN5YDR335W 3675 nt1.54□□□□□ -2.16
YDR215CQ12240 FYV8YGR196C 2454 nt1.54□□□□□ -2.16
YDR215CQ12240 NUP145YGL092W 3954 nt1.52□□□□□ -2.17
YDR215CQ12240 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms