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Protein–RNA interactions for Protein: Q08237
REX4, RNA exonuclease 4, yeast
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289 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
REX4
Q08237
OST4
YDL232W
111 nt
0.7
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
YML002W
YML002W
2214 nt
0.7
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
YDR366C
YDR366C
399 nt
0.69
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
BLI1
YKL061W
342 nt
0.69
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
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YNL097C-B
123 nt
0.69
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
YPR159C-A
YPR159C-A
102 nt
0.69
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
YER053C-A
YER053C-A
114 nt
0.68
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
YIL002W-A
YIL002W-A
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0.67
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
PRP42
YDR235W
1635 nt
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□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
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tT(AGU)B
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□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
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tT(AGU)C
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0.66
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
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tT(AGU)D
73 nt
0.66
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
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tT(AGU)H
73 nt
0.66
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
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tT(AGU)I1
73 nt
0.66
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
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tT(AGU)I2
73 nt
0.66
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
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tT(AGU)J
73 nt
0.66
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
tT(AGU)N1
tT(AGU)N1
73 nt
0.66
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
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tT(AGU)N2
73 nt
0.66
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
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tT(AGU)O1
73 nt
0.66
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
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tT(AGU)O2
73 nt
0.66
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
BEM3
YPL115C
3387 nt
0.66
□□□□□ -2.3
REX4
Q08237
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YCR038W-A
126 nt
0.65
□□□□□ -2.31
REX4
Q08237
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YKL100W-A
90 nt
0.65
□□□□□ -2.31
REX4
Q08237
YBR131C-A
YBR131C-A
90 nt
0.65
□□□□□ -2.31
REX4
Q08237
YSP1
YHR155W
3687 nt
0.64
□□□□□ -2.31
REX4
Q08237
APQ12
YIL040W
417 nt
0.64
□□□□□ -2.31
REX4
Q08237
YJL127W-A
YJL127W-A
117 nt
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□□□□□ -2.31
REX4
Q08237
YMR272W-A
YMR272W-A
114 nt
0.64
□□□□□ -2.31
REX4
Q08237
YHR131W-A
YHR131W-A
246 nt
0.6
□□□□□ -2.31
REX4
Q08237
YMR160W
YMR160W
2451 nt
0.6
□□□□□ -2.31
REX4
Q08237
PRP39
YML046W
1890 nt
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□□□□□ -2.32
REX4
Q08237
BUL2
YML111W
2763 nt
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□□□□□ -2.32
REX4
Q08237
YOR192C-B
YOR192C-B
5313 nt
0.57
□□□□□ -2.32
REX4
Q08237
SNU13
YEL026W
381 nt
0.56
□□□□□ -2.32
REX4
Q08237
PAU12
YGR294W
363 nt
0.55
□□□□□ -2.32
REX4
Q08237
UTP10
YJL109C
5310 nt
0.54
□□□□□ -2.32
REX4
Q08237
TRS65
YGR166W
1683 nt
0.54
□□□□□ -2.32
REX4
Q08237
tF(GAA)B
tF(GAA)B
73 nt
0.52
□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
tF(GAA)F
tF(GAA)F
73 nt
0.52
□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
tF(GAA)G
tF(GAA)G
73 nt
0.52
□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
tF(GAA)H1
tF(GAA)H1
73 nt
0.52
□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
tF(GAA)H2
tF(GAA)H2
73 nt
0.52
□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
tF(GAA)M
tF(GAA)M
73 nt
0.52
□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
tF(GAA)P1
tF(GAA)P1
73 nt
0.52
□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
tF(GAA)P2
tF(GAA)P2
73 nt
0.52
□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
YJL182C
YJL182C
318 nt
0.52
□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
NNF2
YGR089W
2811 nt
0.52
□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
PET111
YMR257C
2403 nt
0.52
□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
snR46
snR46
197 nt
0.51
□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
YEL014C
YEL014C
306 nt
0.5
□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
UTP20
YBL004W
7482 nt
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□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
MYO1
YHR023W
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□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
RPS26A
YGL189C
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0.49
□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
NIP1
YMR309C
2439 nt
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□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
YPL060C-A
YPL060C-A
3315 nt
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□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
ESP1
YGR098C
4893 nt
0.48
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REX4
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YDR371C-A
YDR371C-A
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REX4
Q08237
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□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
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YLR232W
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□□□□□ -2.33
REX4
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YBL039C-A
YBL039C-A
84 nt
0.48
□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
IQG1
YPL242C
4488 nt
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□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
TAH1
YCR060W
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0.47
□□□□□ -2.33
REX4
Q08237
RPM2
YML091C
3609 nt
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□□□□□ -2.34
REX4
Q08237
UTP8
YGR128C
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REX4
Q08237
YKL145W-A
YKL145W-A
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0.45
□□□□□ -2.34
REX4
Q08237
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YLL006W-A
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0.45
□□□□□ -2.34
REX4
Q08237
ORC3
YLL004W
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□□□□□ -2.34
REX4
Q08237
ULP2
YIL031W
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REX4
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YMR158W-B
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□□□□□ -2.34
REX4
Q08237
YGL182C
YGL182C
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□□□□□ -2.34
REX4
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YBR072C-A
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REX4
Q08237
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YLR454W
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REX4
Q08237
MLP1
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Q08237
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YBL100W-B
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REX4
Q08237
SPG3
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Q08237
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Q08237
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YDR544C
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YMR046W-A
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REX4
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YOR381W-A
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YEL073C
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YOL014W
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YOR170W
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YOR314W-A
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Q08237
snR52
snR52
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YDR406W-A
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YJL150W
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□□□□□ -2.36
REX4
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tM(CAU)Q1
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REX4
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YLR342W-A
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REX4
Q08237
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□□□□□ -2.36
REX4
Q08237
BIR1
YJR089W
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0.29
□□□□□ -2.36
REX4
Q08237
snR48
snR48
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0.26
□□□□□ -2.37
REX4
Q08237
YOL013W-A
YOL013W-A
192 nt
0.24
□□□□□ -2.37
REX4
Q08237
YNL054W-B
YNL054W-B
5250 nt
0.23
□□□□□ -2.37
REX4
Q08237
SOV1
YMR066W
2697 nt
0.23
□□□□□ -2.37
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