Protein–RNA interactions for Protein: Q06070

YLR407W, Uncharacterized protein YLR407W, yeastyeast

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR407WQ06070 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.34□□□□□ -2.19
YLR407WQ06070 YOR102WYOR102W 351 nt1.32□□□□□ -2.2
YLR407WQ06070 HKR1YDR420W 5409 nt1.31□□□□□ -2.2
YLR407WQ06070 YGR130CYGR130C 2451 nt1.31□□□□□ -2.2
YLR407WQ06070 YGR164WYGR164W 336 nt1.31□□□□□ -2.2
YLR407WQ06070 YLR041WYLR041W 321 nt1.31□□□□□ -2.2
YLR407WQ06070 YNL170WYNL170W 396 nt1.31□□□□□ -2.2
YLR407WQ06070 ASE1YOR058C 2658 nt1.31□□□□□ -2.2
YLR407WQ06070 BEM2YER155C 6504 nt1.3□□□□□ -2.2
YLR407WQ06070 SEC8YPR055W 3198 nt1.29□□□□□ -2.2
YLR407WQ06070 SIP4YJL089W 2490 nt1.29□□□□□ -2.2
YLR407WQ06070 SEC21YNL287W 2808 nt1.29□□□□□ -2.2
YLR407WQ06070 YGL182CYGL182C 324 nt1.29□□□□□ -2.2
YLR407WQ06070 snR48snR48 113 nt1.29□□□□□ -2.2
YLR407WQ06070 FYV10YIL097W 1551 nt1.29□□□□□ -2.2
YLR407WQ06070 YBL053WYBL053W 375 nt1.28□□□□□ -2.2
YLR407WQ06070 KAP120YPL125W 3099 nt1.27□□□□□ -2.21
YLR407WQ06070 SDH6YDR379C-A 240 nt1.27□□□□□ -2.21
YLR407WQ06070 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.25□□□□□ -2.21
YLR407WQ06070 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.25□□□□□ -2.21
YLR407WQ06070 TAH1YCR060W 336 nt1.24□□□□□ -2.21
YLR407WQ06070 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.24□□□□□ -2.21
YLR407WQ06070 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.23□□□□□ -2.21
YLR407WQ06070 CHS6YJL099W 2241 nt1.22□□□□□ -2.21
YLR407WQ06070 RAD9YDR217C 3930 nt1.21□□□□□ -2.21
YLR407WQ06070 SPT7YBR081C 3999 nt1.21□□□□□ -2.22
YLR407WQ06070 YLR232WYLR232W 348 nt1.21□□□□□ -2.22
YLR407WQ06070 PRP16YKR086W 3216 nt1.21□□□□□ -2.22
YLR407WQ06070 DOP1YDR141C 5097 nt1.21□□□□□ -2.22
YLR407WQ06070 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.2□□□□□ -2.22
YLR407WQ06070 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.2□□□□□ -2.22
YLR407WQ06070 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.2□□□□□ -2.22
YLR407WQ06070 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.18□□□□□ -2.22
YLR407WQ06070 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.17□□□□□ -2.22
YLR407WQ06070 SCC2YDR180W 4482 nt1.15□□□□□ -2.23
YLR407WQ06070 BEM3YPL115C 3387 nt1.14□□□□□ -2.23
YLR407WQ06070 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.13□□□□□ -2.23
YLR407WQ06070 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.12□□□□□ -2.23
YLR407WQ06070 RPM2YML091C 3609 nt1.12□□□□□ -2.23
YLR407WQ06070 UBP3YER151C 2739 nt1.12□□□□□ -2.23
YLR407WQ06070 VAM6YDL077C 3150 nt1.12□□□□□ -2.23
YLR407WQ06070 YSP1YHR155W 3687 nt1.11□□□□□ -2.23
YLR407WQ06070 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.09□□□□□ -2.23
YLR407WQ06070 YDR544CYDR544C 429 nt1.09□□□□□ -2.23
YLR407WQ06070 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.09□□□□□ -2.23
YLR407WQ06070 QCR9YGR183C 201 nt1.08□□□□□ -2.24
YLR407WQ06070 YDL073WYDL073W 2955 nt1.08□□□□□ -2.24
YLR407WQ06070 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.07□□□□□ -2.24
YLR407WQ06070 NST1YNL091W 3723 nt1.05□□□□□ -2.24
YLR407WQ06070 OST4YDL232W 111 nt1.05□□□□□ -2.24
YLR407WQ06070 PAU24YBR301W 363 nt1.05□□□□□ -2.24
YLR407WQ06070 COG6YNL041C 2520 nt1.05□□□□□ -2.24
YLR407WQ06070 snR39BsnR39B 96 nt1.03□□□□□ -2.24
YLR407WQ06070 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.03□□□□□ -2.24
YLR407WQ06070 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1□□□□□ -2.25
YLR407WQ06070 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.99□□□□□ -2.25
YLR407WQ06070 YDR210WYDR210W 228 nt0.98□□□□□ -2.25
YLR407WQ06070 ULP2YIL031W 3105 nt0.98□□□□□ -2.25
YLR407WQ06070 GLG1YKR058W 1851 nt0.98□□□□□ -2.25
YLR407WQ06070 SOM1YEL059C-A 225 nt0.97□□□□□ -2.25
YLR407WQ06070 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.97□□□□□ -2.25
YLR407WQ06070 BUD3YCL014W 4911 nt0.97□□□□□ -2.25
YLR407WQ06070 RKR1YMR247C 4689 nt0.96□□□□□ -2.26
YLR407WQ06070 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.95□□□□□ -2.26
YLR407WQ06070 SEC1YDR164C 2175 nt0.95□□□□□ -2.26
YLR407WQ06070 YJR029WYJR029W 5268 nt0.95□□□□□ -2.26
YLR407WQ06070 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.95□□□□□ -2.26
YLR407WQ06070 LTE1YAL024C 4308 nt0.94□□□□□ -2.26
YLR407WQ06070 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.94□□□□□ -2.26
YLR407WQ06070 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
YLR407WQ06070 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
YLR407WQ06070 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
YLR407WQ06070 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.92□□□□□ -2.26
YLR407WQ06070 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
YLR407WQ06070 NNF2YGR089W 2811 nt0.92□□□□□ -2.26
YLR407WQ06070 Q0143Q0143 153 nt0.91□□□□□ -2.26
YLR407WQ06070 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.91□□□□□ -2.26
YLR407WQ06070 YBR099CYBR099C 384 nt0.9□□□□□ -2.27
YLR407WQ06070 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.89□□□□□ -2.27
YLR407WQ06070 STF2YGR008C 255 nt0.88□□□□□ -2.27
YLR407WQ06070 YNL205CYNL205C 423 nt0.87□□□□□ -2.27
YLR407WQ06070 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR407WQ06070 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR407WQ06070 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR407WQ06070 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR407WQ06070 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR407WQ06070 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR407WQ06070 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR407WQ06070 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR407WQ06070 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR407WQ06070 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR407WQ06070 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR407WQ06070 CSE1YGL238W 2883 nt0.82□□□□□ -2.28
YLR407WQ06070 PET111YMR257C 2403 nt0.82□□□□□ -2.28
YLR407WQ06070 HUG1YML058W-A 207 nt0.82□□□□□ -2.28
YLR407WQ06070 NIP1YMR309C 2439 nt0.81□□□□□ -2.28
YLR407WQ06070 BIR1YJR089W 2865 nt0.81□□□□□ -2.28
YLR407WQ06070 snR85snR85 171 nt0.79□□□□□ -2.28
YLR407WQ06070 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.78□□□□□ -2.28
YLR407WQ06070 BUL2YML111W 2763 nt0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 1231.8 ms