Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.95□□□□□ -2.26
HEF3P53978 BFR2YDR299W 1605 nt0.94□□□□□ -2.26
HEF3P53978 PRP16YKR086W 3216 nt0.94□□□□□ -2.26
HEF3P53978 YOR345CYOR345C 351 nt0.94□□□□□ -2.26
HEF3P53978 ASE1YOR058C 2658 nt0.94□□□□□ -2.26
HEF3P53978 COY1YKL179C 2040 nt0.93□□□□□ -2.26
HEF3P53978 PMP1YCR024C-A 123 nt0.93□□□□□ -2.26
HEF3P53978 JLP2YMR132C 627 nt0.91□□□□□ -2.26
HEF3P53978 snR190snR190 190 nt0.91□□□□□ -2.26
HEF3P53978 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.9□□□□□ -2.27
HEF3P53978 YLR282CYLR282C 342 nt0.9□□□□□ -2.27
HEF3P53978 ULI1YFR026C 510 nt0.89□□□□□ -2.27
HEF3P53978 COX12YLR038C 252 nt0.89□□□□□ -2.27
HEF3P53978 SEC8YPR055W 3198 nt0.89□□□□□ -2.27
HEF3P53978 RKR1YMR247C 4689 nt0.88□□□□□ -2.27
HEF3P53978 BLI1YKL061W 342 nt0.88□□□□□ -2.27
HEF3P53978 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.88□□□□□ -2.27
HEF3P53978 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.87□□□□□ -2.27
HEF3P53978 YOL014WYOL014W 375 nt0.87□□□□□ -2.27
HEF3P53978 SEC1YDR164C 2175 nt0.87□□□□□ -2.27
HEF3P53978 COX5BYIL111W 456 nt0.86□□□□□ -2.27
HEF3P53978 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.86□□□□□ -2.27
HEF3P53978 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.85□□□□□ -2.27
HEF3P53978 SPG3YDR504C 384 nt0.85□□□□□ -2.27
HEF3P53978 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.85□□□□□ -2.27
HEF3P53978 YML002WYML002W 2214 nt0.84□□□□□ -2.27
HEF3P53978 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.83□□□□□ -2.28
HEF3P53978 YEL014CYEL014C 306 nt0.82□□□□□ -2.28
HEF3P53978 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.82□□□□□ -2.28
HEF3P53978 APQ12YIL040W 417 nt0.82□□□□□ -2.28
HEF3P53978 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.81□□□□□ -2.28
HEF3P53978 FYV10YIL097W 1551 nt0.8□□□□□ -2.28
HEF3P53978 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.8□□□□□ -2.28
HEF3P53978 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.8□□□□□ -2.28
HEF3P53978 CHS6YJL099W 2241 nt0.8□□□□□ -2.28
HEF3P53978 HAL9YOL089C 3093 nt0.8□□□□□ -2.28
HEF3P53978 YNL198CYNL198C 303 nt0.79□□□□□ -2.28
HEF3P53978 LTE1YAL024C 4308 nt0.79□□□□□ -2.28
HEF3P53978 snR52snR52 92 nt0.78□□□□□ -2.28
HEF3P53978 PRP5YBR237W 2550 nt0.77□□□□□ -2.29
HEF3P53978 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.77□□□□□ -2.29
HEF3P53978 YLR041WYLR041W 321 nt0.77□□□□□ -2.29
HEF3P53978 UTP8YGR128C 2142 nt0.76□□□□□ -2.29
HEF3P53978 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.76□□□□□ -2.29
HEF3P53978 BIR1YJR089W 2865 nt0.76□□□□□ -2.29
HEF3P53978 FMP27YLR454W 7887 nt0.75□□□□□ -2.29
HEF3P53978 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.75□□□□□ -2.29
HEF3P53978 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.75□□□□□ -2.29
HEF3P53978 ULP2YIL031W 3105 nt0.74□□□□□ -2.29
HEF3P53978 OST4YDL232W 111 nt0.73□□□□□ -2.29
HEF3P53978 YJL182CYJL182C 318 nt0.73□□□□□ -2.29
HEF3P53978 PRP42YDR235W 1635 nt0.73□□□□□ -2.29
HEF3P53978 YJL150WYJL150W 303 nt0.72□□□□□ -2.29
HEF3P53978 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.71□□□□□ -2.3
HEF3P53978 TRS65YGR166W 1683 nt0.71□□□□□ -2.3
HEF3P53978 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.7□□□□□ -2.3
HEF3P53978 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.7□□□□□ -2.3
HEF3P53978 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.69□□□□□ -2.3
HEF3P53978 SNU13YEL026W 381 nt0.68□□□□□ -2.3
HEF3P53978 BEM3YPL115C 3387 nt0.68□□□□□ -2.3
HEF3P53978 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.68□□□□□ -2.3
HEF3P53978 snR46snR46 197 nt0.68□□□□□ -2.3
HEF3P53978 PRP39YML046W 1890 nt0.67□□□□□ -2.3
HEF3P53978 YSP1YHR155W 3687 nt0.67□□□□□ -2.3
HEF3P53978 YDR544CYDR544C 429 nt0.67□□□□□ -2.3
HEF3P53978 AI1Q0050 2505 nt0.67□□□□□ -2.3
HEF3P53978 YLR232WYLR232W 348 nt0.65□□□□□ -2.31
HEF3P53978 TAH1YCR060W 336 nt0.64□□□□□ -2.31
HEF3P53978 YEL073CYEL073C 324 nt0.63□□□□□ -2.31
HEF3P53978 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.63□□□□□ -2.31
HEF3P53978 YBL053WYBL053W 375 nt0.63□□□□□ -2.31
HEF3P53978 PET111YMR257C 2403 nt0.63□□□□□ -2.31
HEF3P53978 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.62□□□□□ -2.31
HEF3P53978 UTP10YJL109C 5310 nt0.61□□□□□ -2.31
HEF3P53978 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.61□□□□□ -2.31
HEF3P53978 YNL338WYNL338W 159 nt0.61□□□□□ -2.31
HEF3P53978 IQG1YPL242C 4488 nt0.61□□□□□ -2.31
HEF3P53978 NNF2YGR089W 2811 nt0.61□□□□□ -2.31
HEF3P53978 YGL182CYGL182C 324 nt0.6□□□□□ -2.31
HEF3P53978 YGR151CYGR151C 336 nt0.6□□□□□ -2.31
HEF3P53978 YNL337WYNL337W 255 nt0.58□□□□□ -2.32
HEF3P53978 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.57□□□□□ -2.32
HEF3P53978 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.56□□□□□ -2.32
HEF3P53978 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.56□□□□□ -2.32
HEF3P53978 THO2YNL139C 4794 nt0.52□□□□□ -2.33
HEF3P53978 NIP1YMR309C 2439 nt0.52□□□□□ -2.33
HEF3P53978 MLP1YKR095W 5628 nt0.51□□□□□ -2.33
HEF3P53978 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.51□□□□□ -2.33
HEF3P53978 SDH6YDR379C-A 240 nt0.51□□□□□ -2.33
HEF3P53978 SBH1YER087C-B 249 nt0.51□□□□□ -2.33
HEF3P53978 RPS26AYGL189C 360 nt0.51□□□□□ -2.33
HEF3P53978 GLG1YKR058W 1851 nt0.5□□□□□ -2.33
HEF3P53978 YOR170WYOR170W 306 nt0.5□□□□□ -2.33
HEF3P53978 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.5□□□□□ -2.33
HEF3P53978 COG6YNL041C 2520 nt0.5□□□□□ -2.33
HEF3P53978 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.49□□□□□ -2.33
HEF3P53978 ORC3YLL004W 1851 nt0.49□□□□□ -2.33
HEF3P53978 MLP2YIL149C 5040 nt0.49□□□□□ -2.33
HEF3P53978 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.48□□□□□ -2.33
HEF3P53978 BUL2YML111W 2763 nt0.47□□□□□ -2.33
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