Protein–RNA interactions for Protein: P53897

IGO1, mRNA stability protein IGO1, yeastyeast

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IGO1P53897 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt0.96□□□□□ -2.26
IGO1P53897 PMP2YEL017C-A 132 nt0.96□□□□□ -2.26
IGO1P53897 CMC4YMR194C-B 222 nt0.96□□□□□ -2.26
IGO1P53897 snR14snR14 160 nt0.96□□□□□ -2.26
IGO1P53897 SLI15YBR156C 2097 nt0.95□□□□□ -2.26
IGO1P53897 ENV11YGR071C 2583 nt0.95□□□□□ -2.26
IGO1P53897 YDR521WYDR521W 336 nt0.95□□□□□ -2.26
IGO1P53897 YJL022WYJL022W 309 nt0.95□□□□□ -2.26
IGO1P53897 YNL211CYNL211C 261 nt0.95□□□□□ -2.26
IGO1P53897 PRP5YBR237W 2550 nt0.95□□□□□ -2.26
IGO1P53897 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt0.94□□□□□ -2.26
IGO1P53897 YBL109WYBL109W 336 nt0.94□□□□□ -2.26
IGO1P53897 SLX4YLR135W 2247 nt0.93□□□□□ -2.26
IGO1P53897 YDL206WYDL206W 2289 nt0.92□□□□□ -2.26
IGO1P53897 TFB5YDR079C-A 219 nt0.92□□□□□ -2.26
IGO1P53897 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.92□□□□□ -2.26
IGO1P53897 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.92□□□□□ -2.26
IGO1P53897 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.91□□□□□ -2.26
IGO1P53897 NUP120YKL057C 3114 nt0.91□□□□□ -2.26
IGO1P53897 YDR544CYDR544C 429 nt0.9□□□□□ -2.27
IGO1P53897 APL1YJR005W 2103 nt0.9□□□□□ -2.27
IGO1P53897 YBR099CYBR099C 384 nt0.9□□□□□ -2.27
IGO1P53897 SNU13YEL026W 381 nt0.89□□□□□ -2.27
IGO1P53897 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.89□□□□□ -2.27
IGO1P53897 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.89□□□□□ -2.27
IGO1P53897 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.89□□□□□ -2.27
IGO1P53897 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.89□□□□□ -2.27
IGO1P53897 EST2YLR318W 2655 nt0.89□□□□□ -2.27
IGO1P53897 ULP2YIL031W 3105 nt0.89□□□□□ -2.27
IGO1P53897 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.88□□□□□ -2.27
IGO1P53897 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.88□□□□□ -2.27
IGO1P53897 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.87□□□□□ -2.27
IGO1P53897 CHS6YJL099W 2241 nt0.87□□□□□ -2.27
IGO1P53897 MSN5YDR335W 3675 nt0.87□□□□□ -2.27
IGO1P53897 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.87□□□□□ -2.27
IGO1P53897 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.87□□□□□ -2.27
IGO1P53897 STO1YMR125W 2586 nt0.86□□□□□ -2.27
IGO1P53897 YGL182CYGL182C 324 nt0.86□□□□□ -2.27
IGO1P53897 YBR178WYBR178W 375 nt0.86□□□□□ -2.27
IGO1P53897 SOM1YEL059C-A 225 nt0.85□□□□□ -2.27
IGO1P53897 NST1YNL091W 3723 nt0.85□□□□□ -2.27
IGO1P53897 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.84□□□□□ -2.27
IGO1P53897 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.84□□□□□ -2.27
IGO1P53897 KAP122YGL016W 3246 nt0.83□□□□□ -2.28
IGO1P53897 YLR282CYLR282C 342 nt0.83□□□□□ -2.28
IGO1P53897 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.83□□□□□ -2.28
IGO1P53897 YMR326CYMR326C 309 nt0.83□□□□□ -2.28
IGO1P53897 snR39BsnR39B 96 nt0.83□□□□□ -2.28
IGO1P53897 MMS4YBR098W 2076 nt0.83□□□□□ -2.28
IGO1P53897 YMR160WYMR160W 2451 nt0.83□□□□□ -2.28
IGO1P53897 HAL9YOL089C 3093 nt0.83□□□□□ -2.28
IGO1P53897 WAR1YML076C 2835 nt0.83□□□□□ -2.28
IGO1P53897 IFH1YLR223C 3258 nt0.83□□□□□ -2.28
IGO1P53897 NUP188YML103C 4968 nt0.82□□□□□ -2.28
IGO1P53897 FYV10YIL097W 1551 nt0.82□□□□□ -2.28
IGO1P53897 BFR2YDR299W 1605 nt0.82□□□□□ -2.28
IGO1P53897 OST4YDL232W 111 nt0.81□□□□□ -2.28
IGO1P53897 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.8□□□□□ -2.28
IGO1P53897 YML002WYML002W 2214 nt0.8□□□□□ -2.28
IGO1P53897 SET3YKR029C 2256 nt0.8□□□□□ -2.28
IGO1P53897 STB6YKL072W 2301 nt0.8□□□□□ -2.28
IGO1P53897 BUL2YML111W 2763 nt0.79□□□□□ -2.28
IGO1P53897 SEC3YER008C 4011 nt0.79□□□□□ -2.28
IGO1P53897 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.79□□□□□ -2.28
IGO1P53897 EMC5YIL027C 426 nt0.79□□□□□ -2.28
IGO1P53897 PRP16YKR086W 3216 nt0.78□□□□□ -2.28
IGO1P53897 YDR210WYDR210W 228 nt0.78□□□□□ -2.28
IGO1P53897 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.78□□□□□ -2.28
IGO1P53897 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.78□□□□□ -2.28
IGO1P53897 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.78□□□□□ -2.28
IGO1P53897 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.78□□□□□ -2.28
IGO1P53897 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.78□□□□□ -2.28
IGO1P53897 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.78□□□□□ -2.28
IGO1P53897 snR190snR190 190 nt0.78□□□□□ -2.28
IGO1P53897 BEM3YPL115C 3387 nt0.77□□□□□ -2.29
IGO1P53897 AZF1YOR113W 2745 nt0.77□□□□□ -2.29
IGO1P53897 YLL020CYLL020C 306 nt0.77□□□□□ -2.29
IGO1P53897 snR61snR61 90 nt0.76□□□□□ -2.29
IGO1P53897 COX5BYIL111W 456 nt0.76□□□□□ -2.29
IGO1P53897 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.76□□□□□ -2.29
IGO1P53897 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.76□□□□□ -2.29
IGO1P53897 YLR232WYLR232W 348 nt0.76□□□□□ -2.29
IGO1P53897 NOP9YJL010C 2001 nt0.76□□□□□ -2.29
IGO1P53897 YHR217CYHR217C 462 nt0.74□□□□□ -2.29
IGO1P53897 THO2YNL139C 4794 nt0.74□□□□□ -2.29
IGO1P53897 RCO1YMR075W 2055 nt0.73□□□□□ -2.29
IGO1P53897 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.73□□□□□ -2.29
IGO1P53897 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.72□□□□□ -2.29
IGO1P53897 NUT1YGL151W 3399 nt0.72□□□□□ -2.29
IGO1P53897 RPL26BYGR034W 384 nt0.71□□□□□ -2.3
IGO1P53897 CDC39YCR093W 6327 nt0.7□□□□□ -2.3
IGO1P53897 YLR041WYLR041W 321 nt0.7□□□□□ -2.3
IGO1P53897 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt0.69□□□□□ -2.3
IGO1P53897 RKR1YMR247C 4689 nt0.69□□□□□ -2.3
IGO1P53897 COG6YNL041C 2520 nt0.68□□□□□ -2.3
IGO1P53897 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.68□□□□□ -2.3
IGO1P53897 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.68□□□□□ -2.3
IGO1P53897 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.68□□□□□ -2.3
IGO1P53897 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.68□□□□□ -2.3
IGO1P53897 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.68□□□□□ -2.3
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