Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 YCS4YLR272C 3531 nt2.24□□□□□ -2.05
CSE4P36012 BIR1YJR089W 2865 nt2.24□□□□□ -2.05
CSE4P36012 YLR422WYLR422W 5799 nt2.23□□□□□ -2.05
CSE4P36012 CFT1YDR301W 4074 nt2.23□□□□□ -2.05
CSE4P36012 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt2.22□□□□□ -2.05
CSE4P36012 YNL266WYNL266W 420 nt2.22□□□□□ -2.05
CSE4P36012 MON2YNL297C 4911 nt2.22□□□□□ -2.05
CSE4P36012 YOR093CYOR093C 4947 nt2.21□□□□□ -2.06
CSE4P36012 RPL26BYGR034W 384 nt2.21□□□□□ -2.06
CSE4P36012 WAR1YML076C 2835 nt2.2□□□□□ -2.06
CSE4P36012 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt2.2□□□□□ -2.06
CSE4P36012 SEC1YDR164C 2175 nt2.19□□□□□ -2.06
CSE4P36012 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt2.18□□□□□ -2.06
CSE4P36012 ASE1YOR058C 2658 nt2.18□□□□□ -2.06
CSE4P36012 GEA2YEL022W 4380 nt2.17□□□□□ -2.06
CSE4P36012 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.16□□□□□ -2.06
CSE4P36012 RAD9YDR217C 3930 nt2.13□□□□□ -2.07
CSE4P36012 CHS1YNL192W 3396 nt2.12□□□□□ -2.07
CSE4P36012 snR62snR62 100 nt2.11□□□□□ -2.07
CSE4P36012 TMA7YLR262C-A 195 nt2.11□□□□□ -2.07
CSE4P36012 SWI4YER111C 3282 nt2.1□□□□□ -2.07
CSE4P36012 ROM2YLR371W 4071 nt2.1□□□□□ -2.07
CSE4P36012 APL3YBL037W 3078 nt2.1□□□□□ -2.07
CSE4P36012 PMD1YER132C 5262 nt2.1□□□□□ -2.07
CSE4P36012 TRM732YMR259C 4263 nt2.08□□□□□ -2.08
CSE4P36012 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt2.08□□□□□ -2.08
CSE4P36012 SEC3YER008C 4011 nt2.08□□□□□ -2.08
CSE4P36012 RPM2YML091C 3609 nt2.07□□□□□ -2.08
CSE4P36012 CAT8YMR280C 4302 nt2.06□□□□□ -2.08
CSE4P36012 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt2.06□□□□□ -2.08
CSE4P36012 BRR2YER172C 6492 nt2.05□□□□□ -2.08
CSE4P36012 DNF3YMR162C 4971 nt2.05□□□□□ -2.08
CSE4P36012 YDL073WYDL073W 2955 nt2.03□□□□□ -2.08
CSE4P36012 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt2.02□□□□□ -2.09
CSE4P36012 NUP145YGL092W 3954 nt2.01□□□□□ -2.09
CSE4P36012 CDC25YLR310C 4770 nt2.01□□□□□ -2.09
CSE4P36012 NUP188YML103C 4968 nt2□□□□□ -2.09
CSE4P36012 SEC8YPR055W 3198 nt2□□□□□ -2.09
CSE4P36012 PKH3YDR466W 2697 nt1.99□□□□□ -2.09
CSE4P36012 BST1YFL025C 3090 nt1.99□□□□□ -2.09
CSE4P36012 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.99□□□□□ -2.09
CSE4P36012 PRP16YKR086W 3216 nt1.98□□□□□ -2.09
CSE4P36012 BEM3YPL115C 3387 nt1.98□□□□□ -2.09
CSE4P36012 VPS15YBR097W 4365 nt1.96□□□□□ -2.1
CSE4P36012 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.95□□□□□ -2.1
CSE4P36012 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.95□□□□□ -2.1
CSE4P36012 HUG1YML058W-A 207 nt1.95□□□□□ -2.1
CSE4P36012 AZF1YOR113W 2745 nt1.94□□□□□ -2.1
CSE4P36012 RPS26AYGL189C 360 nt1.93□□□□□ -2.1
CSE4P36012 MSH3YCR092C 3057 nt1.93□□□□□ -2.1
CSE4P36012 UBP3YER151C 2739 nt1.93□□□□□ -2.1
CSE4P36012 NNF2YGR089W 2811 nt1.92□□□□□ -2.1
CSE4P36012 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.92□□□□□ -2.1
CSE4P36012 CDC39YCR093W 6327 nt1.91□□□□□ -2.1
CSE4P36012 YGR130CYGR130C 2451 nt1.9□□□□□ -2.11
CSE4P36012 SEC10YLR166C 2616 nt1.9□□□□□ -2.11
CSE4P36012 EST2YLR318W 2655 nt1.89□□□□□ -2.11
CSE4P36012 PIK1YNL267W 3201 nt1.89□□□□□ -2.11
CSE4P36012 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt1.88□□□□□ -2.11
CSE4P36012 YSP1YHR155W 3687 nt1.87□□□□□ -2.11
CSE4P36012 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt1.87□□□□□ -2.11
CSE4P36012 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt1.85□□□□□ -2.11
CSE4P36012 MEC1YBR136W 7107 nt1.85□□□□□ -2.11
CSE4P36012 GLG1YKR058W 1851 nt1.83□□□□□ -2.12
CSE4P36012 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt1.82□□□□□ -2.12
CSE4P36012 SAC3YDR159W 3906 nt1.81□□□□□ -2.12
CSE4P36012 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt1.81□□□□□ -2.12
CSE4P36012 ULP2YIL031W 3105 nt1.8□□□□□ -2.12
CSE4P36012 SXM1YDR395W 2835 nt1.79□□□□□ -2.12
CSE4P36012 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.78□□□□□ -2.12
CSE4P36012 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.78□□□□□ -2.12
CSE4P36012 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.78□□□□□ -2.12
CSE4P36012 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.78□□□□□ -2.12
CSE4P36012 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.78□□□□□ -2.12
CSE4P36012 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.78□□□□□ -2.12
CSE4P36012 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.78□□□□□ -2.12
CSE4P36012 MSN5YDR335W 3675 nt1.78□□□□□ -2.12
CSE4P36012 LAA1YJL207C 6045 nt1.78□□□□□ -2.12
CSE4P36012 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.76□□□□□ -2.13
CSE4P36012 CLU1YMR012W 3834 nt1.74□□□□□ -2.13
CSE4P36012 SSK2YNR031C 4740 nt1.74□□□□□ -2.13
CSE4P36012 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.72□□□□□ -2.13
CSE4P36012 IML1YJR138W 4755 nt1.72□□□□□ -2.13
CSE4P36012 FIG2YCR089W 4830 nt1.72□□□□□ -2.13
CSE4P36012 snR47snR47 99 nt1.71□□□□□ -2.14
CSE4P36012 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.7□□□□□ -2.14
CSE4P36012 CCH1YGR217W 6120 nt1.69□□□□□ -2.14
CSE4P36012 EST1YLR233C 2100 nt1.68□□□□□ -2.14
CSE4P36012 ORC3YLL004W 1851 nt1.67□□□□□ -2.14
CSE4P36012 snR69snR69 101 nt1.66□□□□□ -2.14
CSE4P36012 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.66□□□□□ -2.14
CSE4P36012 CSE1YGL238W 2883 nt1.66□□□□□ -2.14
CSE4P36012 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.63□□□□□ -2.15
CSE4P36012 PET127YOR017W 2403 nt1.62□□□□□ -2.15
CSE4P36012 SPT7YBR081C 3999 nt1.62□□□□□ -2.15
CSE4P36012 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.6□□□□□ -2.15
CSE4P36012 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.6□□□□□ -2.15
CSE4P36012 SPC110YDR356W 2835 nt1.6□□□□□ -2.15
CSE4P36012 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.59□□□□□ -2.15
CSE4P36012 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.59□□□□□ -2.15
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