Protein–RNA interactions for Protein: P32380

SPC110, Spindle pole body component 110, yeastyeast

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Length 944 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC110P32380 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.08□□□□□ -2.24
SPC110P32380 YEL073CYEL073C 324 nt1.07□□□□□ -2.24
SPC110P32380 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.07□□□□□ -2.24
SPC110P32380 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.06□□□□□ -2.24
SPC110P32380 YPL044CYPL044C 549 nt1.06□□□□□ -2.24
SPC110P32380 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.05□□□□□ -2.24
SPC110P32380 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.05□□□□□ -2.24
SPC110P32380 YLR282CYLR282C 342 nt1.03□□□□□ -2.24
SPC110P32380 ASE1YOR058C 2658 nt1.03□□□□□ -2.24
SPC110P32380 KAP120YPL125W 3099 nt1.03□□□□□ -2.24
SPC110P32380 RPL26BYGR034W 384 nt1.02□□□□□ -2.25
SPC110P32380 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.02□□□□□ -2.25
SPC110P32380 COX5BYIL111W 456 nt1.01□□□□□ -2.25
SPC110P32380 snR190snR190 190 nt1□□□□□ -2.25
SPC110P32380 PRP42YDR235W 1635 nt1□□□□□ -2.25
SPC110P32380 PRP5YBR237W 2550 nt0.98□□□□□ -2.25
SPC110P32380 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.98□□□□□ -2.25
SPC110P32380 PAU24YBR301W 363 nt0.98□□□□□ -2.25
SPC110P32380 YML002WYML002W 2214 nt0.98□□□□□ -2.25
SPC110P32380 BFR2YDR299W 1605 nt0.97□□□□□ -2.25
SPC110P32380 UTP8YGR128C 2142 nt0.97□□□□□ -2.25
SPC110P32380 FYV10YIL097W 1551 nt0.96□□□□□ -2.26
SPC110P32380 YBL053WYBL053W 375 nt0.95□□□□□ -2.26
SPC110P32380 UBP3YER151C 2739 nt0.93□□□□□ -2.26
SPC110P32380 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.92□□□□□ -2.26
SPC110P32380 YGL182CYGL182C 324 nt0.92□□□□□ -2.26
SPC110P32380 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.91□□□□□ -2.26
SPC110P32380 TAH1YCR060W 336 nt0.9□□□□□ -2.27
SPC110P32380 YLR041WYLR041W 321 nt0.9□□□□□ -2.27
SPC110P32380 SEC8YPR055W 3198 nt0.9□□□□□ -2.27
SPC110P32380 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.89□□□□□ -2.27
SPC110P32380 RKR1YMR247C 4689 nt0.88□□□□□ -2.27
SPC110P32380 PRP16YKR086W 3216 nt0.88□□□□□ -2.27
SPC110P32380 STF2YGR008C 255 nt0.88□□□□□ -2.27
SPC110P32380 YOR102WYOR102W 351 nt0.88□□□□□ -2.27
SPC110P32380 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.88□□□□□ -2.27
SPC110P32380 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.87□□□□□ -2.27
SPC110P32380 YLR232WYLR232W 348 nt0.86□□□□□ -2.27
SPC110P32380 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.86□□□□□ -2.27
SPC110P32380 YDR544CYDR544C 429 nt0.85□□□□□ -2.27
SPC110P32380 HUG1YML058W-A 207 nt0.85□□□□□ -2.27
SPC110P32380 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.84□□□□□ -2.27
SPC110P32380 YOR170WYOR170W 306 nt0.84□□□□□ -2.27
SPC110P32380 snR48snR48 113 nt0.84□□□□□ -2.27
SPC110P32380 SNU13YEL026W 381 nt0.83□□□□□ -2.28
SPC110P32380 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.83□□□□□ -2.28
SPC110P32380 CHS6YJL099W 2241 nt0.82□□□□□ -2.28
SPC110P32380 Q0092Q0092 141 nt0.8□□□□□ -2.28
SPC110P32380 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.8□□□□□ -2.28
SPC110P32380 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.8□□□□□ -2.28
SPC110P32380 YDL073WYDL073W 2955 nt0.8□□□□□ -2.28
SPC110P32380 SEC1YDR164C 2175 nt0.79□□□□□ -2.28
SPC110P32380 YGR164WYGR164W 336 nt0.79□□□□□ -2.28
SPC110P32380 BEM3YPL115C 3387 nt0.79□□□□□ -2.28
SPC110P32380 MYO1YHR023W 5787 nt0.79□□□□□ -2.28
SPC110P32380 OST4YDL232W 111 nt0.78□□□□□ -2.28
SPC110P32380 ATP8Q0080 147 nt0.78□□□□□ -2.28
SPC110P32380 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.78□□□□□ -2.28
SPC110P32380 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.78□□□□□ -2.28
SPC110P32380 QCR9YGR183C 201 nt0.76□□□□□ -2.29
SPC110P32380 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.75□□□□□ -2.29
SPC110P32380 YNL170WYNL170W 396 nt0.75□□□□□ -2.29
SPC110P32380 YSP1YHR155W 3687 nt0.74□□□□□ -2.29
SPC110P32380 snR39BsnR39B 96 nt0.74□□□□□ -2.29
SPC110P32380 COG6YNL041C 2520 nt0.74□□□□□ -2.29
SPC110P32380 LTE1YAL024C 4308 nt0.73□□□□□ -2.29
SPC110P32380 SDH6YDR379C-A 240 nt0.73□□□□□ -2.29
SPC110P32380 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SPC110P32380 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SPC110P32380 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SPC110P32380 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SPC110P32380 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SPC110P32380 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SPC110P32380 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SPC110P32380 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SPC110P32380 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SPC110P32380 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SPC110P32380 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
SPC110P32380 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.73□□□□□ -2.29
SPC110P32380 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.72□□□□□ -2.29
SPC110P32380 YDR210WYDR210W 228 nt0.71□□□□□ -2.3
SPC110P32380 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.71□□□□□ -2.3
SPC110P32380 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.71□□□□□ -2.3
SPC110P32380 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.7□□□□□ -2.3
SPC110P32380 NNF2YGR089W 2811 nt0.68□□□□□ -2.3
SPC110P32380 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.67□□□□□ -2.3
SPC110P32380 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.66□□□□□ -2.3
SPC110P32380 YMR160WYMR160W 2451 nt0.65□□□□□ -2.31
SPC110P32380 GLG1YKR058W 1851 nt0.64□□□□□ -2.31
SPC110P32380 UTP20YBL004W 7482 nt0.64□□□□□ -2.31
SPC110P32380 UTP10YJL109C 5310 nt0.63□□□□□ -2.31
SPC110P32380 ULP2YIL031W 3105 nt0.62□□□□□ -2.31
SPC110P32380 PET111YMR257C 2403 nt0.62□□□□□ -2.31
SPC110P32380 SOM1YEL059C-A 225 nt0.6□□□□□ -2.31
SPC110P32380 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.6□□□□□ -2.31
SPC110P32380 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.59□□□□□ -2.31
SPC110P32380 NIP1YMR309C 2439 nt0.59□□□□□ -2.32
SPC110P32380 MLP1YKR095W 5628 nt0.59□□□□□ -2.32
SPC110P32380 CSE1YGL238W 2883 nt0.59□□□□□ -2.32
SPC110P32380 PAU12YGR294W 363 nt0.58□□□□□ -2.32
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