Protein–RNA interactions for Protein: P22217

TRX1, Thioredoxin-1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRX1P22217 STE5YDR103W 2754 nt-0.06□□□□□ -2.42
TRX1P22217 SNU13YEL026W 381 nt-0.06□□□□□ -2.42
TRX1P22217 SOV1YMR066W 2697 nt-0.07□□□□□ -2.42
TRX1P22217 snR45snR45 172 nt-0.08□□□□□ -2.42
TRX1P22217 YDR366CYDR366C 399 nt-0.09□□□□□ -2.42
TRX1P22217 YEL073CYEL073C 324 nt-0.09□□□□□ -2.42
TRX1P22217 YDR157WYDR157W 402 nt-0.11□□□□□ -2.43
TRX1P22217 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-0.11□□□□□ -2.43
TRX1P22217 snR60snR60 104 nt-0.13□□□□□ -2.43
TRX1P22217 YGR069WYGR069W 336 nt-0.13□□□□□ -2.43
TRX1P22217 RPM2YML091C 3609 nt-0.14□□□□□ -2.43
TRX1P22217 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-0.15□□□□□ -2.43
TRX1P22217 YIL032CYIL032C 357 nt-0.16□□□□□ -2.44
TRX1P22217 THO2YNL139C 4794 nt-0.16□□□□□ -2.44
TRX1P22217 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-0.17□□□□□ -2.44
TRX1P22217 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.17□□□□□ -2.44
TRX1P22217 YDR102CYDR102C 333 nt-0.19□□□□□ -2.44
TRX1P22217 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-0.19□□□□□ -2.44
TRX1P22217 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-0.19□□□□□ -2.44
TRX1P22217 YLR232WYLR232W 348 nt-0.2□□□□□ -2.44
TRX1P22217 YNL028WYNL028W 318 nt-0.2□□□□□ -2.44
TRX1P22217 GLG1YKR058W 1851 nt-0.22□□□□□ -2.44
TRX1P22217 VAR1Q0140 1197 nt-0.22□□□□□ -2.44
TRX1P22217 Q0144Q0144 330 nt-0.23□□□□□ -2.45
TRX1P22217 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.24□□□□□ -2.45
TRX1P22217 YAF9YNL107W 681 nt-0.25□□□□□ -2.45
TRX1P22217 snR8snR8 190 nt-0.26□□□□□ -2.45
TRX1P22217 YER053C-AYER053C-A 114 nt-0.26□□□□□ -2.45
TRX1P22217 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-0.27□□□□□ -2.45
TRX1P22217 YBR099CYBR099C 384 nt-0.27□□□□□ -2.45
TRX1P22217 YGL149WYGL149W 306 nt-0.28□□□□□ -2.45
TRX1P22217 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-0.28□□□□□ -2.45
TRX1P22217 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-0.28□□□□□ -2.45
TRX1P22217 snR128snR128 126 nt-0.29□□□□□ -2.46
TRX1P22217 HMRA1YCR097W 381 nt-0.3□□□□□ -2.46
TRX1P22217 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-0.3□□□□□ -2.46
TRX1P22217 ATP6Q0085 780 nt-0.32□□□□□ -2.46
TRX1P22217 YOR015WYOR015W 360 nt-0.32□□□□□ -2.46
TRX1P22217 PRP39YML046W 1890 nt-0.35□□□□□ -2.47
TRX1P22217 UTP8YGR128C 2142 nt-0.36□□□□□ -2.47
TRX1P22217 YPR012WYPR012W 255 nt-0.36□□□□□ -2.47
TRX1P22217 YPR197CYPR197C 564 nt-0.37□□□□□ -2.47
TRX1P22217 snR36snR36 182 nt-0.37□□□□□ -2.47
TRX1P22217 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.38□□□□□ -2.47
TRX1P22217 SDH6YDR379C-A 240 nt-0.38□□□□□ -2.47
TRX1P22217 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.39□□□□□ -2.47
TRX1P22217 CSE1YGL238W 2883 nt-0.39□□□□□ -2.47
TRX1P22217 RAD61YDR014W 1944 nt-0.39□□□□□ -2.47
TRX1P22217 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.41□□□□□ -2.47
TRX1P22217 YFL019CYFL019C 354 nt-0.41□□□□□ -2.48
TRX1P22217 APQ12YIL040W 417 nt-0.41□□□□□ -2.48
TRX1P22217 EST1YLR233C 2100 nt-0.42□□□□□ -2.48
TRX1P22217 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-0.42□□□□□ -2.48
TRX1P22217 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-0.44□□□□□ -2.48
TRX1P22217 RPL39YJL189W 156 nt-0.44□□□□□ -2.48
TRX1P22217 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.45□□□□□ -2.48
TRX1P22217 snR74snR74 88 nt-0.45□□□□□ -2.48
TRX1P22217 YGL052WYGL052W 306 nt-0.46□□□□□ -2.48
TRX1P22217 YGR164WYGR164W 336 nt-0.47□□□□□ -2.48
TRX1P22217 SBH2YER019C-A 267 nt-0.48□□□□□ -2.49
TRX1P22217 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.49□□□□□ -2.49
TRX1P22217 YFL032WYFL032W 321 nt-0.49□□□□□ -2.49
TRX1P22217 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-0.49□□□□□ -2.49
TRX1P22217 TAH1YCR060W 336 nt-0.5□□□□□ -2.49
TRX1P22217 COG6YNL041C 2520 nt-0.51□□□□□ -2.49
TRX1P22217 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.54□□□□□ -2.5
TRX1P22217 YDR210WYDR210W 228 nt-0.56□□□□□ -2.5
TRX1P22217 YKL118WYKL118W 312 nt-0.56□□□□□ -2.5
TRX1P22217 YER097WYER097W 330 nt-0.58□□□□□ -2.5
TRX1P22217 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-0.59□□□□□ -2.5
TRX1P22217 YDR413CYDR413C 576 nt-0.6□□□□□ -2.51
TRX1P22217 YDR544CYDR544C 429 nt-0.6□□□□□ -2.51
TRX1P22217 GIM4YEL003W 336 nt-0.6□□□□□ -2.51
TRX1P22217 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-0.6□□□□□ -2.51
TRX1P22217 URB1YKL014C 5295 nt-0.6□□□□□ -2.51
TRX1P22217 snR46snR46 197 nt-0.63□□□□□ -2.51
TRX1P22217 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.64□□□□□ -2.51
TRX1P22217 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-0.65□□□□□ -2.51
TRX1P22217 SEC10YLR166C 2616 nt-0.68□□□□□ -2.52
TRX1P22217 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-0.69□□□□□ -2.52
TRX1P22217 YGL182CYGL182C 324 nt-0.7□□□□□ -2.52
TRX1P22217 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-0.71□□□□□ -2.52
TRX1P22217 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.71□□□□□ -2.52
TRX1P22217 YML099W-AYML099W-A 330 nt-0.71□□□□□ -2.52
TRX1P22217 YER181CYER181C 324 nt-0.72□□□□□ -2.52
TRX1P22217 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.75□□□□□ -2.53
TRX1P22217 YGL041CYGL041C 204 nt-0.76□□□□□ -2.53
TRX1P22217 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.8□□□□□ -2.54
TRX1P22217 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-0.8□□□□□ -2.54
TRX1P22217 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.81□□□□□ -2.54
TRX1P22217 MYO1YHR023W 5787 nt-0.84□□□□□ -2.54
TRX1P22217 YOR170WYOR170W 306 nt-0.85□□□□□ -2.55
TRX1P22217 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.87□□□□□ -2.55
TRX1P22217 snR55snR55 98 nt-0.88□□□□□ -2.55
TRX1P22217 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-0.89□□□□□ -2.55
TRX1P22217 snR49snR49 165 nt-0.9□□□□□ -2.55
TRX1P22217 YJL182CYJL182C 318 nt-0.91□□□□□ -2.56
TRX1P22217 snR65snR65 100 nt-0.95□□□□□ -2.56
TRX1P22217 snR69snR69 101 nt-0.95□□□□□ -2.56
TRX1P22217 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.95□□□□□ -2.56
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