Protein–RNA interactions for Protein: P0CF16

YML003W, UPF0507 protein YML003W, yeastyeast

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML003WP0CF16 PRP5YBR237W 2550 nt1.02□□□□□ -2.25
YML003WP0CF16 FYV10YIL097W 1551 nt1.02□□□□□ -2.25
YML003WP0CF16 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.02□□□□□ -2.25
YML003WP0CF16 PRP39YML046W 1890 nt1.01□□□□□ -2.25
YML003WP0CF16 SIP4YJL089W 2490 nt1□□□□□ -2.25
YML003WP0CF16 VAM6YDL077C 3150 nt1□□□□□ -2.25
YML003WP0CF16 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.99□□□□□ -2.25
YML003WP0CF16 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.99□□□□□ -2.25
YML003WP0CF16 TRS65YGR166W 1683 nt0.97□□□□□ -2.25
YML003WP0CF16 YLR041WYLR041W 321 nt0.96□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 YJR029WYJR029W 5268 nt0.96□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.96□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 SCC2YDR180W 4482 nt0.95□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.95□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 UBP3YER151C 2739 nt0.94□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 YNL338WYNL338W 159 nt0.93□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 YOR225WYOR225W 330 nt0.93□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 BEM3YPL115C 3387 nt0.93□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 BUD3YCL014W 4911 nt0.92□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.92□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 YLR232WYLR232W 348 nt0.92□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 YPR117WYPR117W 7470 nt0.91□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 TAH1YCR060W 336 nt0.91□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.91□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.91□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 YGL182CYGL182C 324 nt0.91□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.91□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.91□□□□□ -2.26
YML003WP0CF16 RKR1YMR247C 4689 nt0.9□□□□□ -2.27
YML003WP0CF16 BEM2YER155C 6504 nt0.9□□□□□ -2.27
YML003WP0CF16 SNU13YEL026W 381 nt0.89□□□□□ -2.27
YML003WP0CF16 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.89□□□□□ -2.27
YML003WP0CF16 YDL073WYDL073W 2955 nt0.88□□□□□ -2.27
YML003WP0CF16 CHS6YJL099W 2241 nt0.88□□□□□ -2.27
YML003WP0CF16 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.88□□□□□ -2.27
YML003WP0CF16 YSP1YHR155W 3687 nt0.87□□□□□ -2.27
YML003WP0CF16 OST4YDL232W 111 nt0.86□□□□□ -2.27
YML003WP0CF16 STF2YGR008C 255 nt0.85□□□□□ -2.27
YML003WP0CF16 YOR170WYOR170W 306 nt0.85□□□□□ -2.27
YML003WP0CF16 YDR544CYDR544C 429 nt0.83□□□□□ -2.28
YML003WP0CF16 YLR294CYLR294C 330 nt0.83□□□□□ -2.28
YML003WP0CF16 HUG1YML058W-A 207 nt0.83□□□□□ -2.28
YML003WP0CF16 YOR102WYOR102W 351 nt0.82□□□□□ -2.28
YML003WP0CF16 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.81□□□□□ -2.28
YML003WP0CF16 DOP1YDR141C 5097 nt0.81□□□□□ -2.28
YML003WP0CF16 SEC1YDR164C 2175 nt0.81□□□□□ -2.28
YML003WP0CF16 snR48snR48 113 nt0.79□□□□□ -2.28
YML003WP0CF16 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.78□□□□□ -2.28
YML003WP0CF16 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.77□□□□□ -2.29
YML003WP0CF16 NNF2YGR089W 2811 nt0.75□□□□□ -2.29
YML003WP0CF16 COG6YNL041C 2520 nt0.75□□□□□ -2.29
YML003WP0CF16 LTE1YAL024C 4308 nt0.74□□□□□ -2.29
YML003WP0CF16 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.74□□□□□ -2.29
YML003WP0CF16 PAU24YBR301W 363 nt0.74□□□□□ -2.29
YML003WP0CF16 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.73□□□□□ -2.29
YML003WP0CF16 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.73□□□□□ -2.29
YML003WP0CF16 GLG1YKR058W 1851 nt0.72□□□□□ -2.29
YML003WP0CF16 PET111YMR257C 2403 nt0.72□□□□□ -2.29
YML003WP0CF16 YBL053WYBL053W 375 nt0.72□□□□□ -2.29
YML003WP0CF16 SDH6YDR379C-A 240 nt0.71□□□□□ -2.3
YML003WP0CF16 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.71□□□□□ -2.3
YML003WP0CF16 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.7□□□□□ -2.3
YML003WP0CF16 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.7□□□□□ -2.3
YML003WP0CF16 QCR9YGR183C 201 nt0.7□□□□□ -2.3
YML003WP0CF16 ULP2YIL031W 3105 nt0.7□□□□□ -2.3
YML003WP0CF16 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.69□□□□□ -2.3
YML003WP0CF16 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.68□□□□□ -2.3
YML003WP0CF16 snR39BsnR39B 96 nt0.68□□□□□ -2.3
YML003WP0CF16 YDR210WYDR210W 228 nt0.67□□□□□ -2.3
YML003WP0CF16 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.65□□□□□ -2.31
YML003WP0CF16 CSE1YGL238W 2883 nt0.65□□□□□ -2.31
YML003WP0CF16 RPM2YML091C 3609 nt0.65□□□□□ -2.31
YML003WP0CF16 UTP20YBL004W 7482 nt0.64□□□□□ -2.31
YML003WP0CF16 NIP1YMR309C 2439 nt0.64□□□□□ -2.31
YML003WP0CF16 PAU12YGR294W 363 nt0.63□□□□□ -2.31
YML003WP0CF16 MLP1YKR095W 5628 nt0.62□□□□□ -2.31
YML003WP0CF16 RPS26AYGL189C 360 nt0.62□□□□□ -2.31
YML003WP0CF16 YMR160WYMR160W 2451 nt0.61□□□□□ -2.31
YML003WP0CF16 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.6□□□□□ -2.31
YML003WP0CF16 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.6□□□□□ -2.31
YML003WP0CF16 UTP10YJL109C 5310 nt0.6□□□□□ -2.31
YML003WP0CF16 SBH1YER087C-B 249 nt0.59□□□□□ -2.31
YML003WP0CF16 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.58□□□□□ -2.32
YML003WP0CF16 YGR164WYGR164W 336 nt0.58□□□□□ -2.32
YML003WP0CF16 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YML003WP0CF16 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YML003WP0CF16 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YML003WP0CF16 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YML003WP0CF16 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YML003WP0CF16 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YML003WP0CF16 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YML003WP0CF16 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YML003WP0CF16 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YML003WP0CF16 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YML003WP0CF16 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YML003WP0CF16 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YML003WP0CF16 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YML003WP0CF16 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.57□□□□□ -2.32
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