Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHA9Q7RTU4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms