Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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