Protein–RNA interactions for Protein: Q12527

ATG11, Autophagy-related protein 11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG11Q12527 CFT1YDR301W 4074 nt1.84□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.84□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 SPO24YPR036W-A 204 nt1.84□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 TBS1YBR150C 3285 nt1.83□□□□□ -2.12
ATG11Q12527 SAC3YDR159W 3906 nt1.83□□□□□ -2.12
ATG11Q12527 PAA1YDR071C 576 nt1.83□□□□□ -2.12
ATG11Q12527 COX12YLR038C 252 nt1.83□□□□□ -2.12
ATG11Q12527 NUP157YER105C 4176 nt1.81□□□□□ -2.12
ATG11Q12527 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.81□□□□□ -2.12
ATG11Q12527 SNU13YEL026W 381 nt1.8□□□□□ -2.12
ATG11Q12527 YOR102WYOR102W 351 nt1.8□□□□□ -2.12
ATG11Q12527 RAD50YNL250W 3939 nt1.79□□□□□ -2.12
ATG11Q12527 LHS1YKL073W 2646 nt1.79□□□□□ -2.12
ATG11Q12527 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.79□□□□□ -2.12
ATG11Q12527 EMC5YIL027C 426 nt1.79□□□□□ -2.12
ATG11Q12527 VPS15YBR097W 4365 nt1.78□□□□□ -2.12
ATG11Q12527 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.78□□□□□ -2.12
ATG11Q12527 ADR1YDR216W 3972 nt1.78□□□□□ -2.12
ATG11Q12527 YDL206WYDL206W 2289 nt1.78□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.77□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 NUT1YGL151W 3399 nt1.76□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 SMC4YLR086W 4257 nt1.76□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.76□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 CDC31YOR257W 486 nt1.76□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 snR14snR14 160 nt1.76□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 SKI3YPR189W 4299 nt1.76□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 TTI1YKL033W 3117 nt1.75□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 KCS1YDR017C 3153 nt1.75□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.75□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.75□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 PMD1YER132C 5262 nt1.75□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.74□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 APL1YJR005W 2103 nt1.74□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.73□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.73□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 YLL054CYLL054C 2532 nt1.73□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.72□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 YJL022WYJL022W 309 nt1.72□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 YNL211CYNL211C 261 nt1.72□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 SLX4YLR135W 2247 nt1.72□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 YCS4YLR272C 3531 nt1.71□□□□□ -2.13
ATG11Q12527 CHS1YNL192W 3396 nt1.71□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 HUG1YML058W-A 207 nt1.71□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 CAT8YMR280C 4302 nt1.71□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 BRR2YER172C 6492 nt1.71□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.7□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.7□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 UFD2YDL190C 2886 nt1.7□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 PRP5YBR237W 2550 nt1.7□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 PKH3YDR466W 2697 nt1.69□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 STF2YGR008C 255 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 POL5YEL055C 3069 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 ALY2YJL084C 3141 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 YOR019WYOR019W 2193 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.66□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 IRA1YBR140C 9279 nt1.66□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 YAR009CYAR009C 3591 nt1.65□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 SSK2YNR031C 4740 nt1.65□□□□□ -2.14
ATG11Q12527 MMS4YBR098W 2076 nt1.64□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 FIG2YCR089W 4830 nt1.64□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 YLR422WYLR422W 5799 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 TRM732YMR259C 4263 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 KAP122YGL016W 3246 nt1.62□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 MEC1YBR136W 7107 nt1.62□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 YGL182CYGL182C 324 nt1.62□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 MSH3YCR092C 3057 nt1.62□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 PAN2YGL094C 3348 nt1.61□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt1.61□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 YGR130CYGR130C 2451 nt1.6□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 BFR2YDR299W 1605 nt1.6□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 GEA2YEL022W 4380 nt1.6□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 STO1YMR125W 2586 nt1.6□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 SMC1YFL008W 3678 nt1.59□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 SET3YKR029C 2256 nt1.59□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 RSM22YKL155C 1887 nt1.59□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 CMC4YMR194C-B 222 nt1.59□□□□□ -2.15
ATG11Q12527 BST1YFL025C 3090 nt1.59□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 STB6YKL072W 2301 nt1.58□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 UTP8YGR128C 2142 nt1.58□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 CHS6YJL099W 2241 nt1.58□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.57□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 YBL109WYBL109W 336 nt1.57□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 EAF1YDR359C 2949 nt1.56□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt1.56□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 YLR282CYLR282C 342 nt1.56□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.55□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 COX5BYIL111W 456 nt1.55□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 YBR099CYBR099C 384 nt1.55□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 TAH1YCR060W 336 nt1.54□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 YLL020CYLL020C 306 nt1.54□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 CCH1YGR217W 6120 nt1.54□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 NUP188YML103C 4968 nt1.54□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 OST4YDL232W 111 nt1.53□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 PMP2YEL017C-A 132 nt1.53□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 SWI4YER111C 3282 nt1.53□□□□□ -2.16
ATG11Q12527 WAR1YML076C 2835 nt1.53□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 NOP9YJL010C 2001 nt1.52□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 QCR9YGR183C 201 nt1.52□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 snR39BsnR39B 96 nt1.52□□□□□ -2.17
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