Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 MET18YIL128W 3099 nt2.66□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.66□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 MLH3YPL164C 2148 nt2.65□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 YER078W-AYER078W-A 165 nt2.65□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 LCL1YPL056C 306 nt2.65□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 PKH2YOL100W 3246 nt2.65□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 MYO4YAL029C 4416 nt2.65□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 ECM29YHL030W 5607 nt2.65□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 STH1YIL126W 4080 nt2.64□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 TBS1YBR150C 3285 nt2.64□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 DCP2YNL118C 2913 nt2.64□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 TRM3YDL112W 4311 nt2.64□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 NUM1YDR150W 8247 nt2.63□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 RPM2YML091C 3609 nt2.63□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt2.63□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 YLR232WYLR232W 348 nt2.63□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 SLH1YGR271W 5904 nt2.63□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 SVL3YPL032C 2478 nt2.62□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt2.62□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 HUG1YML058W-A 207 nt2.61□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 FLO11YIR019C 4104 nt2.61□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 YML002WYML002W 2214 nt2.61□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 IRC20YLR247C 4671 nt2.61□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 YDL073WYDL073W 2955 nt2.6□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt2.6□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 AXL1YPR122W 3627 nt2.6□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 MSB1YOR188W 3414 nt2.59□□□□□ -1.99
SRF1Q12516 NOP9YJL010C 2001 nt2.59□□□□□ -2
SRF1Q12516 NUP157YER105C 4176 nt2.59□□□□□ -2
SRF1Q12516 SLI15YBR156C 2097 nt2.58□□□□□ -2
SRF1Q12516 ESL2YKR096W 3588 nt2.58□□□□□ -2
SRF1Q12516 YEF3YLR249W 3135 nt2.57□□□□□ -2
SRF1Q12516 snR47snR47 99 nt2.57□□□□□ -2
SRF1Q12516 PSD2YGR170W 3417 nt2.57□□□□□ -2
SRF1Q12516 YLR041WYLR041W 321 nt2.56□□□□□ -2
SRF1Q12516 YPR097WYPR097W 3222 nt2.56□□□□□ -2
SRF1Q12516 ADR1YDR216W 3972 nt2.56□□□□□ -2
SRF1Q12516 YDR209CYDR209C 414 nt2.55□□□□□ -2
SRF1Q12516 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.55□□□□□ -2
SRF1Q12516 FRK1YPL141C 2598 nt2.55□□□□□ -2
SRF1Q12516 snR50snR50 90 nt2.55□□□□□ -2
SRF1Q12516 BNR1YIL159W 4128 nt2.55□□□□□ -2
SRF1Q12516 ESL1YIL151C 3357 nt2.55□□□□□ -2
SRF1Q12516 UBP3YER151C 2739 nt2.54□□□□□ -2
SRF1Q12516 GYP5YPL249C 2685 nt2.54□□□□□ -2
SRF1Q12516 RGA1YOR127W 3024 nt2.54□□□□□ -2
SRF1Q12516 TIM9YEL020W-A 264 nt2.53□□□□□ -2
SRF1Q12516 TRL1YJL087C 2484 nt2.52□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 SSD1YDR293C 3753 nt2.52□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt2.52□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt2.52□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 AGC1YPR021C 2709 nt2.51□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 ALY2YJL084C 3141 nt2.51□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 BUD2YKL092C 3315 nt2.51□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt2.5□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 FAB1YFR019W 6837 nt2.49□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 CDC60YPL160W 3273 nt2.49□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 snR75snR75 89 nt2.49□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 PNC1YGL037C 651 nt2.49□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 YOR055WYOR055W 435 nt2.49□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 YLR278CYLR278C 4026 nt2.49□□□□□ -2.01
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SRF1Q12516 RTT101YJL047C 2529 nt2.48□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 UBR1YGR184C 5853 nt2.47□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 SEC16YPL085W 6588 nt2.47□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.47□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 COA6YMR244C-A 315 nt2.47□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 UTP22YGR090W 3714 nt2.47□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 CCH1YGR217W 6120 nt2.47□□□□□ -2.01
SRF1Q12516 SEY1YOR165W 2331 nt2.46□□□□□ -2.02
SRF1Q12516 TDA9YML081W 3756 nt2.46□□□□□ -2.02
SRF1Q12516 WAR1YML076C 2835 nt2.45□□□□□ -2.02
SRF1Q12516 PEP1YBL017C 4740 nt2.44□□□□□ -2.02
SRF1Q12516 AZF1YOR113W 2745 nt2.43□□□□□ -2.02
SRF1Q12516 PAN2YGL094C 3348 nt2.43□□□□□ -2.02
SRF1Q12516 NUP192YJL039C 5052 nt2.42□□□□□ -2.02
SRF1Q12516 NUT1YGL151W 3399 nt2.42□□□□□ -2.02
SRF1Q12516 PET309YLR067C 2898 nt2.42□□□□□ -2.02
SRF1Q12516 MMS4YBR098W 2076 nt2.42□□□□□ -2.02
SRF1Q12516 SEC21YNL287W 2808 nt2.42□□□□□ -2.02
SRF1Q12516 SYH1YPL105C 2550 nt2.41□□□□□ -2.02
SRF1Q12516 RAV1YJR033C 4074 nt2.41□□□□□ -2.02
SRF1Q12516 CTR9YOL145C 3234 nt2.41□□□□□ -2.02
SRF1Q12516 SEC10YLR166C 2616 nt2.4□□□□□ -2.02
SRF1Q12516 MYO2YOR326W 4725 nt2.4□□□□□ -2.02
SRF1Q12516 GCN2YDR283C 4980 nt2.4□□□□□ -2.03
SRF1Q12516 YKL225WYKL225W 348 nt2.39□□□□□ -2.03
SRF1Q12516 SRB8YCR081W 4284 nt2.39□□□□□ -2.03
SRF1Q12516 SAC3YDR159W 3906 nt2.37□□□□□ -2.03
SRF1Q12516 ROM2YLR371W 4071 nt2.37□□□□□ -2.03
SRF1Q12516 UFD4YKL010C 4452 nt2.36□□□□□ -2.03
SRF1Q12516 BNI1YNL271C 5862 nt2.36□□□□□ -2.03
SRF1Q12516 SMC1YFL008W 3678 nt2.36□□□□□ -2.03
SRF1Q12516 HSL1YKL101W 4557 nt2.35□□□□□ -2.03
SRF1Q12516 RPL26BYGR034W 384 nt2.35□□□□□ -2.03
SRF1Q12516 HIR3YJR140C 4947 nt2.34□□□□□ -2.03
SRF1Q12516 NNF2YGR089W 2811 nt2.34□□□□□ -2.03
SRF1Q12516 TRA1YHR099W 11235 nt2.34□□□□□ -2.03
SRF1Q12516 SEC31YDL195W 3822 nt2.34□□□□□ -2.03
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