Protein–RNA interactions for Protein: Q12387

MDM20, N-terminal acetyltransferase B complex subunit MDM20, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDM20Q12387 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.76□□□□□ -2.13
MDM20Q12387 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.76□□□□□ -2.13
MDM20Q12387 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.75□□□□□ -2.13
MDM20Q12387 YLR419WYLR419W 4308 nt1.75□□□□□ -2.13
MDM20Q12387 YJR039WYJR039W 3366 nt1.75□□□□□ -2.13
MDM20Q12387 SLI15YBR156C 2097 nt1.75□□□□□ -2.13
MDM20Q12387 PKH2YOL100W 3246 nt1.74□□□□□ -2.13
MDM20Q12387 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.74□□□□□ -2.13
MDM20Q12387 NUT1YGL151W 3399 nt1.74□□□□□ -2.13
MDM20Q12387 PBY1YBR094W 2262 nt1.74□□□□□ -2.13
MDM20Q12387 SEC63YOR254C 1992 nt1.74□□□□□ -2.13
MDM20Q12387 VPS15YBR097W 4365 nt1.72□□□□□ -2.13
MDM20Q12387 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.72□□□□□ -2.13
MDM20Q12387 YPL044CYPL044C 549 nt1.72□□□□□ -2.13
MDM20Q12387 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.72□□□□□ -2.13
MDM20Q12387 FRK1YPL141C 2598 nt1.72□□□□□ -2.13
MDM20Q12387 MDS3YGL197W 4464 nt1.71□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 SNU13YEL026W 381 nt1.71□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 COX12YLR038C 252 nt1.71□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 YNL205CYNL205C 423 nt1.71□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 LHS1YKL073W 2646 nt1.71□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 LAA1YJL207C 6045 nt1.71□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 PAU12YGR294W 363 nt1.7□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 YLR422WYLR422W 5799 nt1.7□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 RPS30BYOR182C 192 nt1.7□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 SPO24YPR036W-A 204 nt1.7□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 PAU24YBR301W 363 nt1.7□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 MEC1YBR136W 7107 nt1.7□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 PKH3YDR466W 2697 nt1.69□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 KCS1YDR017C 3153 nt1.69□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 POL5YEL055C 3069 nt1.68□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 snR85snR85 171 nt1.68□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 PAA1YDR071C 576 nt1.68□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 snR48snR48 113 nt1.68□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 ALY2YJL084C 3141 nt1.68□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 BPH1YCR032W 6504 nt1.67□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 EMC5YIL027C 426 nt1.66□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 YCS4YLR272C 3531 nt1.65□□□□□ -2.14
MDM20Q12387 PIK1YNL267W 3201 nt1.65□□□□□ -2.15
MDM20Q12387 TTI1YKL033W 3117 nt1.64□□□□□ -2.15
MDM20Q12387 YDL206WYDL206W 2289 nt1.64□□□□□ -2.15
MDM20Q12387 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.64□□□□□ -2.15
MDM20Q12387 IML1YJR138W 4755 nt1.64□□□□□ -2.15
MDM20Q12387 APL1YJR005W 2103 nt1.64□□□□□ -2.15
MDM20Q12387 PAN2YGL094C 3348 nt1.63□□□□□ -2.15
MDM20Q12387 SKI3YPR189W 4299 nt1.62□□□□□ -2.15
MDM20Q12387 YOR102WYOR102W 351 nt1.62□□□□□ -2.15
MDM20Q12387 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.61□□□□□ -2.15
MDM20Q12387 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.61□□□□□ -2.15
MDM20Q12387 RAD50YNL250W 3939 nt1.6□□□□□ -2.15
MDM20Q12387 CLU1YMR012W 3834 nt1.6□□□□□ -2.15
MDM20Q12387 IRA1YBR140C 9279 nt1.6□□□□□ -2.15
MDM20Q12387 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.59□□□□□ -2.15
MDM20Q12387 UFD2YDL190C 2886 nt1.59□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 SLX4YLR135W 2247 nt1.57□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.57□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 YJL022WYJL022W 309 nt1.57□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 YNL211CYNL211C 261 nt1.57□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 snR14snR14 160 nt1.57□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 YAR009CYAR009C 3591 nt1.57□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 MON2YNL297C 4911 nt1.56□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.56□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 YOR019WYOR019W 2193 nt1.56□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 MMS4YBR098W 2076 nt1.55□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 KAP122YGL016W 3246 nt1.55□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 TRM732YMR259C 4263 nt1.55□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.54□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.54□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 PRP5YBR237W 2550 nt1.54□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 SMC4YLR086W 4257 nt1.54□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.53□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 YLL054CYLL054C 2532 nt1.53□□□□□ -2.16
MDM20Q12387 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.52□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.52□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.51□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.51□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.51□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.51□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.51□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.51□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.51□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 PET127YOR017W 2403 nt1.51□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 BFR2YDR299W 1605 nt1.51□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 EAF1YDR359C 2949 nt1.5□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 RSM22YKL155C 1887 nt1.5□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.49□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 BST1YFL025C 3090 nt1.48□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 SET3YKR029C 2256 nt1.48□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 SPC110YDR356W 2835 nt1.47□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 YGL182CYGL182C 324 nt1.47□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 QCR9YGR183C 201 nt1.47□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 COX5BYIL111W 456 nt1.47□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 FYV8YGR196C 2454 nt1.47□□□□□ -2.17
MDM20Q12387 STB6YKL072W 2301 nt1.46□□□□□ -2.18
MDM20Q12387 YLL020CYLL020C 306 nt1.46□□□□□ -2.18
MDM20Q12387 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.46□□□□□ -2.18
MDM20Q12387 STO1YMR125W 2586 nt1.46□□□□□ -2.18
MDM20Q12387 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.45□□□□□ -2.18
MDM20Q12387 CMC4YMR194C-B 222 nt1.45□□□□□ -2.18
MDM20Q12387 NUP157YER105C 4176 nt1.44□□□□□ -2.18
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