Protein–RNA interactions for Protein: Q12303

YPS3, Aspartic proteinase yapsin-3, yeastyeast

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPS3Q12303 MCM10YIL150C 1716 nt1.06□□□□□ -2.24
YPS3Q12303 YOR345CYOR345C 351 nt1.05□□□□□ -2.24
YPS3Q12303 YGR151CYGR151C 336 nt1.04□□□□□ -2.24
YPS3Q12303 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.04□□□□□ -2.24
YPS3Q12303 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.04□□□□□ -2.24
YPS3Q12303 SLX4YLR135W 2247 nt1.04□□□□□ -2.24
YPS3Q12303 ECM12YHR021W-A 456 nt1.03□□□□□ -2.24
YPS3Q12303 YNL338WYNL338W 159 nt1.03□□□□□ -2.24
YPS3Q12303 snR14snR14 160 nt1.03□□□□□ -2.24
YPS3Q12303 COG4YPR105C 2586 nt1.03□□□□□ -2.24
YPS3Q12303 YJR029WYJR029W 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 PKH2YOL100W 3246 nt1.02□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 YEL014CYEL014C 306 nt1.02□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 CUL3YGR003W 2235 nt1.02□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 YCS4YLR272C 3531 nt1.02□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 NUP188YML103C 4968 nt1.02□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 NUT1YGL151W 3399 nt1.02□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 YLL054CYLL054C 2532 nt1.01□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 PRP39YML046W 1890 nt1.01□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.01□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.01□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.01□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.01□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.01□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.01□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.01□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.01□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 YLL020CYLL020C 306 nt1.01□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 RPL33BYOR234C 324 nt1.01□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 PTP2YOR208W 2253 nt1.01□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 SLI15YBR156C 2097 nt1.01□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 SLD3YGL113W 2007 nt1□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 YDL196WYDL196W 330 nt1□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 YIR044CYIR044C 186 nt1□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 snR52snR52 92 nt1□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 PIP2YOR363C 2991 nt1□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 TRS65YGR166W 1683 nt1□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 NUP157YER105C 4176 nt1□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 ULI1YFR026C 510 nt0.99□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 snR46snR46 197 nt0.99□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 SWI4YER111C 3282 nt0.99□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 FIG4YNL325C 2640 nt0.98□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.98□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 SPT7YBR081C 3999 nt0.98□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 YDL206WYDL206W 2289 nt0.98□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 IFH1YLR223C 3258 nt0.97□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 PMP1YCR024C-A 123 nt0.97□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 AIM44YPL158C 2277 nt0.97□□□□□ -2.25
YPS3Q12303 COY1YKL179C 2040 nt0.95□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.95□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.95□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 APL1YJR005W 2103 nt0.95□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 NUP145YGL092W 3954 nt0.94□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.94□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 SEC3YER008C 4011 nt0.93□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 APL3YBL037W 3078 nt0.93□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 EAF1YDR359C 2949 nt0.93□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 PAA1YDR071C 576 nt0.93□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 COX12YLR038C 252 nt0.93□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 RPS30BYOR182C 192 nt0.93□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 IML1YJR138W 4755 nt0.93□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 YPR117WYPR117W 7470 nt0.93□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 VAM6YDL077C 3150 nt0.92□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 STB6YKL072W 2301 nt0.92□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 YAR009CYAR009C 3591 nt0.92□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 NST1YNL091W 3723 nt0.91□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.91□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 YBL053WYBL053W 375 nt0.91□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 YNL211CYNL211C 261 nt0.91□□□□□ -2.26
YPS3Q12303 ALY2YJL084C 3141 nt0.9□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 SIP4YJL089W 2490 nt0.9□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 STO1YMR125W 2586 nt0.9□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 GEA2YEL022W 4380 nt0.9□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 MMS4YBR098W 2076 nt0.9□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 CDC39YCR093W 6327 nt0.9□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 SET3YKR029C 2256 nt0.9□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 YGR130CYGR130C 2451 nt0.9□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 HAL9YOL089C 3093 nt0.9□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 CLU1YMR012W 3834 nt0.89□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.89□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.89□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 YPL044CYPL044C 549 nt0.89□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.89□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 Q0092Q0092 141 nt0.88□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.88□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.88□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 YEL073CYEL073C 324 nt0.87□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.87□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 BEM2YER155C 6504 nt0.86□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.86□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.86□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 PAN2YGL094C 3348 nt0.86□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 TTI1YKL033W 3117 nt0.85□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 ATP8Q0080 147 nt0.85□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 WAR1YML076C 2835 nt0.84□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.84□□□□□ -2.27
YPS3Q12303 CMC4YMR194C-B 222 nt0.84□□□□□ -2.27
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