Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 YLL054CYLL054C 2532 nt1.26□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 APL1YJR005W 2103 nt1.25□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 SWI4YER111C 3282 nt1.25□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 FIG4YNL325C 2640 nt1.25□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 NPR2YEL062W 1848 nt1.25□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.25□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.25□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 CDC39YCR093W 6327 nt1.25□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 MMS4YBR098W 2076 nt1.25□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 SIP4YJL089W 2490 nt1.25□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 snR55snR55 98 nt1.24□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.24□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 STO1YMR125W 2586 nt1.24□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 YAR009CYAR009C 3591 nt1.23□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 ECM12YHR021W-A 456 nt1.23□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.23□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 PAN2YGL094C 3348 nt1.23□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 MCM10YIL150C 1716 nt1.23□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 SGF11YPL047W 300 nt1.22□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 MSN5YDR335W 3675 nt1.21□□□□□ -2.22
LSP1Q12230 REV3YPL167C 4515 nt1.21□□□□□ -2.22
LSP1Q12230 AIM44YPL158C 2277 nt1.21□□□□□ -2.22
LSP1Q12230 RRT15YLR162W-A 189 nt1.21□□□□□ -2.22
LSP1Q12230 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.19□□□□□ -2.22
LSP1Q12230 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.19□□□□□ -2.22
LSP1Q12230 YLL020CYLL020C 306 nt1.19□□□□□ -2.22
LSP1Q12230 YOR302WYOR302W 78 nt1.19□□□□□ -2.22
LSP1Q12230 ROM2YLR371W 4071 nt1.19□□□□□ -2.22
LSP1Q12230 STB6YKL072W 2301 nt1.18□□□□□ -2.22
LSP1Q12230 EAF1YDR359C 2949 nt1.18□□□□□ -2.22
LSP1Q12230 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.17□□□□□ -2.22
LSP1Q12230 TTI1YKL033W 3117 nt1.16□□□□□ -2.22
LSP1Q12230 OLI1Q0130 231 nt1.16□□□□□ -2.22
LSP1Q12230 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.15□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 NUP145YGL092W 3954 nt1.15□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.14□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.14□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.14□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.14□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 WAR1YML076C 2835 nt1.14□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 GEA2YEL022W 4380 nt1.14□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 YKU70YMR284W 1809 nt1.13□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.13□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.13□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.13□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.13□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.13□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.13□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 YNL211CYNL211C 261 nt1.13□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 YDL196WYDL196W 330 nt1.12□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 SPG3YDR504C 384 nt1.11□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 SEC3YER008C 4011 nt1.11□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 NUP157YER105C 4176 nt1.11□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 JLP2YMR132C 627 nt1.1□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 ASE1YOR058C 2658 nt1.09□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 CMC4YMR194C-B 222 nt1.09□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 YOR345CYOR345C 351 nt1.09□□□□□ -2.23
LSP1Q12230 BUD3YCL014W 4911 nt1.08□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.08□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.08□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 YGR130CYGR130C 2451 nt1.08□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 NOP9YJL010C 2001 nt1.08□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 PAA1YDR071C 576 nt1.07□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 APQ12YIL040W 417 nt1.07□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 KAP120YPL125W 3099 nt1.06□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.06□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.06□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 PAU24YBR301W 363 nt1.06□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.05□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 ISD11YER048W-A 285 nt1.05□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.05□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 SMC1YFL008W 3678 nt1.05□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 PAM16YJL104W 450 nt1.04□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 BLI1YKL061W 342 nt1.04□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 RPS30BYOR182C 192 nt1.03□□□□□ -2.24
LSP1Q12230 YPL044CYPL044C 549 nt1.02□□□□□ -2.25
LSP1Q12230 ULI1YFR026C 510 nt1.01□□□□□ -2.25
LSP1Q12230 COX12YLR038C 252 nt1.01□□□□□ -2.25
LSP1Q12230 COY1YKL179C 2040 nt1□□□□□ -2.25
LSP1Q12230 CLU1YMR012W 3834 nt1□□□□□ -2.25
LSP1Q12230 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.99□□□□□ -2.25
LSP1Q12230 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.99□□□□□ -2.25
LSP1Q12230 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.99□□□□□ -2.25
LSP1Q12230 BFR2YDR299W 1605 nt0.98□□□□□ -2.25
LSP1Q12230 ANS1YHR126C 480 nt0.98□□□□□ -2.25
LSP1Q12230 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.98□□□□□ -2.25
LSP1Q12230 HAL9YOL089C 3093 nt0.98□□□□□ -2.25
LSP1Q12230 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.97□□□□□ -2.25
LSP1Q12230 RPL26BYGR034W 384 nt0.97□□□□□ -2.25
LSP1Q12230 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.96□□□□□ -2.26
LSP1Q12230 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.96□□□□□ -2.26
LSP1Q12230 YDL073WYDL073W 2955 nt0.96□□□□□ -2.26
LSP1Q12230 YLR282CYLR282C 342 nt0.95□□□□□ -2.26
LSP1Q12230 snR190snR190 190 nt0.95□□□□□ -2.26
LSP1Q12230 PRP16YKR086W 3216 nt0.94□□□□□ -2.26
LSP1Q12230 RKR1YMR247C 4689 nt0.94□□□□□ -2.26
LSP1Q12230 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.94□□□□□ -2.26
LSP1Q12230 PMP1YCR024C-A 123 nt0.93□□□□□ -2.26
LSP1Q12230 YEL014CYEL014C 306 nt0.92□□□□□ -2.26
LSP1Q12230 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.7 ms