Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 SLI15YBR156C 2097 nt1.54□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 SXM1YDR395W 2835 nt1.53□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 TRM3YDL112W 4311 nt1.53□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 RPS30BYOR182C 192 nt1.53□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 BST1YFL025C 3090 nt1.53□□□□□ -2.17
UBX3Q12229 PBY1YBR094W 2262 nt1.52□□□□□ -2.17
UBX3Q12229 SBE22YHR103W 2559 nt1.52□□□□□ -2.17
UBX3Q12229 SFB2YNL049C 2631 nt1.51□□□□□ -2.17
UBX3Q12229 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.51□□□□□ -2.17
UBX3Q12229 YNL205CYNL205C 423 nt1.5□□□□□ -2.17
UBX3Q12229 snR48snR48 113 nt1.5□□□□□ -2.17
UBX3Q12229 NUP157YER105C 4176 nt1.5□□□□□ -2.17
UBX3Q12229 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.49□□□□□ -2.17
UBX3Q12229 YPL044CYPL044C 549 nt1.49□□□□□ -2.17
UBX3Q12229 YLR422WYLR422W 5799 nt1.49□□□□□ -2.17
UBX3Q12229 PAA1YDR071C 576 nt1.48□□□□□ -2.17
UBX3Q12229 FIG2YCR089W 4830 nt1.48□□□□□ -2.17
UBX3Q12229 MEC1YBR136W 7107 nt1.48□□□□□ -2.17
UBX3Q12229 RAD50YNL250W 3939 nt1.47□□□□□ -2.17
UBX3Q12229 COX12YLR038C 252 nt1.47□□□□□ -2.17
UBX3Q12229 IRA1YBR140C 9279 nt1.47□□□□□ -2.17
UBX3Q12229 EMC5YIL027C 426 nt1.46□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 snR14snR14 160 nt1.46□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 SMC4YLR086W 4257 nt1.46□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 PMD1YER132C 5262 nt1.46□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 YDL206WYDL206W 2289 nt1.46□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 NUT1YGL151W 3399 nt1.45□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 YJL022WYJL022W 309 nt1.44□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 BRR2YER172C 6492 nt1.43□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 snR85snR85 171 nt1.43□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 CDC31YOR257W 486 nt1.43□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 CAT8YMR280C 4302 nt1.43□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 KAP122YGL016W 3246 nt1.43□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 CHS1YNL192W 3396 nt1.42□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.42□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.42□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 SPC110YDR356W 2835 nt1.41□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 TTI1YKL033W 3117 nt1.41□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 EST2YLR318W 2655 nt1.41□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 SLX4YLR135W 2247 nt1.41□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 UFD2YDL190C 2886 nt1.41□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 CCH1YGR217W 6120 nt1.4□□□□□ -2.18
UBX3Q12229 TRM732YMR259C 4263 nt1.4□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 SNU13YEL026W 381 nt1.4□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 YOR102WYOR102W 351 nt1.4□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.4□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 SSK2YNR031C 4740 nt1.4□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 POL5YEL055C 3069 nt1.39□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 APL1YJR005W 2103 nt1.39□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.39□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.39□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 YNL211CYNL211C 261 nt1.39□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.38□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 ALY2YJL084C 3141 nt1.38□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 YLL054CYLL054C 2532 nt1.38□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 KIP1YBL063W 3336 nt1.38□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 MSN5YDR335W 3675 nt1.37□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 SEC21YNL287W 2808 nt1.37□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 AZF1YOR113W 2745 nt1.37□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 YAR009CYAR009C 3591 nt1.36□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.36□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.36□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.36□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 CDC25YLR310C 4770 nt1.35□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.35□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 PIK1YNL267W 3201 nt1.35□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 PET127YOR017W 2403 nt1.35□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 PRP5YBR237W 2550 nt1.34□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 NUP192YJL039C 5052 nt1.34□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.34□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 MMS4YBR098W 2076 nt1.34□□□□□ -2.19
UBX3Q12229 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.33□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 YCS4YLR272C 3531 nt1.32□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.32□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 PAN2YGL094C 3348 nt1.32□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 SET3YKR029C 2256 nt1.32□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 HKR1YDR420W 5409 nt1.31□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 STO1YMR125W 2586 nt1.31□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 RSM22YKL155C 1887 nt1.31□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 GEA2YEL022W 4380 nt1.3□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 ANS1YHR126C 480 nt1.3□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.29□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.29□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.29□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.29□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.29□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.29□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.29□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 YGL182CYGL182C 324 nt1.29□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 NUP188YML103C 4968 nt1.28□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 FYV8YGR196C 2454 nt1.28□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 EAF1YDR359C 2949 nt1.28□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 CLU1YMR012W 3834 nt1.28□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 CMC4YMR194C-B 222 nt1.28□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 BFR2YDR299W 1605 nt1.28□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 STB6YKL072W 2301 nt1.28□□□□□ -2.2
UBX3Q12229 SEC3YER008C 4011 nt1.27□□□□□ -2.21
UBX3Q12229 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt1.27□□□□□ -2.21
UBX3Q12229 YLR282CYLR282C 342 nt1.27□□□□□ -2.21
UBX3Q12229 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.26□□□□□ -2.21
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