Protein–RNA interactions for Protein: Q12192

RFM1, Repression factor of MSEs protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RFM1Q12192 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.06□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 AHC1YOR023C 1701 nt1.06□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 YKU70YMR284W 1809 nt1.05□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 MSH3YCR092C 3057 nt1.05□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.05□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 YJL120WYJL120W 324 nt1.05□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 YLL020CYLL020C 306 nt1.05□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 CLU1YMR012W 3834 nt1.05□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 PKH2YOL100W 3246 nt1.04□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 YLL054CYLL054C 2532 nt1.04□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.04□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 RPL33BYOR234C 324 nt1.04□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 MDS3YGL197W 4464 nt1.04□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 PTP2YOR208W 2253 nt1.04□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 NST1YNL091W 3723 nt1.03□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 YGR151CYGR151C 336 nt1.03□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 YJL182CYJL182C 318 nt1.03□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.03□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 YGR130CYGR130C 2451 nt1.03□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 COG4YPR105C 2586 nt1.02□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 ULI1YFR026C 510 nt1.02□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 YIR044CYIR044C 186 nt1.02□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.02□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 YLR294CYLR294C 330 nt1.02□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.02□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 SLI15YBR156C 2097 nt1.02□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 PIP2YOR363C 2991 nt1.02□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 YJR029WYJR029W 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 ECM12YHR021W-A 456 nt1.01□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.01□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.01□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 YNL338WYNL338W 159 nt1.01□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 snR14snR14 160 nt1.01□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 snR52snR52 92 nt1.01□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 YJL150WYJL150W 303 nt1□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 YOR345CYOR345C 351 nt1□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 YBR206WYBR206W 324 nt1□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 ROM2YLR371W 4071 nt1□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 SWI4YER111C 3282 nt0.99□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 AIM44YPL158C 2277 nt0.99□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 LAA1YJL207C 6045 nt0.99□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 YDR521WYDR521W 336 nt0.99□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 NUT1YGL151W 3399 nt0.98□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 SLD3YGL113W 2007 nt0.98□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 SEC3YER008C 4011 nt0.98□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 YDL196WYDL196W 330 nt0.97□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.97□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 FIG4YNL325C 2640 nt0.97□□□□□ -2.25
RFM1Q12192 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.96□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 TRS65YGR166W 1683 nt0.96□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 PRP39YML046W 1890 nt0.96□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 YDL206WYDL206W 2289 nt0.96□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 EAF1YDR359C 2949 nt0.95□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 SMC1YFL008W 3678 nt0.95□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 APL1YJR005W 2103 nt0.95□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 VAM6YDL077C 3150 nt0.95□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 TTI1YKL033W 3117 nt0.95□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 STB6YKL072W 2301 nt0.94□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 APL3YBL037W 3078 nt0.94□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.94□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 IFH1YLR223C 3258 nt0.94□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 SIP4YJL089W 2490 nt0.93□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 CDC39YCR093W 6327 nt0.93□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 SPT7YBR081C 3999 nt0.92□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 MMS4YBR098W 2076 nt0.92□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 IML1YJR138W 4755 nt0.91□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 RPS30BYOR182C 192 nt0.91□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 snR46snR46 197 nt0.91□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 GEA2YEL022W 4380 nt0.91□□□□□ -2.26
RFM1Q12192 PMP1YCR024C-A 123 nt0.9□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.9□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 PAA1YDR071C 576 nt0.9□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 DOP1YDR141C 5097 nt0.9□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 COY1YKL179C 2040 nt0.89□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 STO1YMR125W 2586 nt0.89□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.89□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 YAR009CYAR009C 3591 nt0.89□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 YEL073CYEL073C 324 nt0.88□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.88□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.88□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.88□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.88□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 YNL211CYNL211C 261 nt0.88□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 SET3YKR029C 2256 nt0.87□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.87□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 COX12YLR038C 252 nt0.87□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 NUP157YER105C 4176 nt0.86□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 WAR1YML076C 2835 nt0.86□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.85□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 STF2YGR008C 255 nt0.85□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.85□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 YPL044CYPL044C 549 nt0.85□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 ALY2YJL084C 3141 nt0.85□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 BEM2YER155C 6504 nt0.85□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 KAP120YPL125W 3099 nt0.85□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 Q0092Q0092 141 nt0.84□□□□□ -2.27
RFM1Q12192 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.84□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 196.2 ms