Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.12□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 NUP188YML103C 4968 nt1.12□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 AHC1YOR023C 1701 nt1.12□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 SPG3YDR504C 384 nt1.11□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 NUP145YGL092W 3954 nt1.11□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 SLI15YBR156C 2097 nt1.11□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 YLL007CYLL007C 1998 nt1.1□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 SGF11YPL047W 300 nt1.1□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 APL3YBL037W 3078 nt1.09□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 PKH2YOL100W 3246 nt1.09□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 YLL020CYLL020C 306 nt1.09□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 YOR218CYOR218C 420 nt1.09□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 CDC39YCR093W 6327 nt1.08□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 EAF1YDR359C 2949 nt1.08□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 PAU12YGR294W 363 nt1.08□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 APQ12YIL040W 417 nt1.08□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 YIR044CYIR044C 186 nt1.08□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 PAM16YJL104W 450 nt1.08□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 PAU24YBR301W 363 nt1.08□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 CUL3YGR003W 2235 nt1.08□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.07□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 IFH1YLR223C 3258 nt1.07□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 STB6YKL072W 2301 nt1.06□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.06□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 NUP157YER105C 4176 nt1.06□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 YDL206WYDL206W 2289 nt1.06□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 PTP2YOR208W 2253 nt1.05□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 ECM12YHR021W-A 456 nt1.05□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.05□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.05□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 RAD9YDR217C 3930 nt1.05□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 SPT7YBR081C 3999 nt1.05□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 MCM10YIL150C 1716 nt1.04□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.04□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.04□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.04□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 BLI1YKL061W 342 nt1.03□□□□□ -2.24
YPQ1Q12010 SET3YKR029C 2256 nt1.02□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 YKU70YMR284W 1809 nt1.02□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 YOR345CYOR345C 351 nt1.02□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 FIG4YNL325C 2640 nt1.02□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.01□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 STO1YMR125W 2586 nt1.01□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 AIM44YPL158C 2277 nt1□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 YDL196WYDL196W 330 nt1□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 PRP16YKR086W 3216 nt1□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 PAN2YGL094C 3348 nt0.99□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.99□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 QCR9YGR183C 201 nt0.99□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.99□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.99□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 YNL198CYNL198C 303 nt0.99□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 MMS4YBR098W 2076 nt0.98□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.98□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 BEM2YER155C 6504 nt0.98□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.97□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 YNL211CYNL211C 261 nt0.97□□□□□ -2.25
YPQ1Q12010 KAP120YPL125W 3099 nt0.96□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 GEA2YEL022W 4380 nt0.96□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.96□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 OLI1Q0130 231 nt0.96□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 APL1YJR005W 2103 nt0.96□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.96□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.95□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 YJL150WYJL150W 303 nt0.95□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 YPR117WYPR117W 7470 nt0.94□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 PAA1YDR071C 576 nt0.94□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.94□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 VAM6YDL077C 3150 nt0.94□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 ASE1YOR058C 2658 nt0.93□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 BUD3YCL014W 4911 nt0.93□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 YDL073WYDL073W 2955 nt0.93□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 ISD11YER048W-A 285 nt0.93□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 YOR225WYOR225W 330 nt0.93□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 WAR1YML076C 2835 nt0.92□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 ULI1YFR026C 510 nt0.92□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 COX12YLR038C 252 nt0.92□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 YJR029WYJR029W 5268 nt0.92□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.92□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 MYO1YHR023W 5787 nt0.92□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.91□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 YNL337WYNL337W 255 nt0.91□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 UBP3YER151C 2739 nt0.91□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 COY1YKL179C 2040 nt0.91□□□□□ -2.26
YPQ1Q12010 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.9□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.9□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
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