Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.22□□□□□ -2.21
CTI6Q08923 NUP157YER105C 4176 nt1.22□□□□□ -2.21
CTI6Q08923 YGR069WYGR069W 336 nt1.22□□□□□ -2.21
CTI6Q08923 YHL042WYHL042W 453 nt1.22□□□□□ -2.21
CTI6Q08923 YJL120WYJL120W 324 nt1.22□□□□□ -2.21
CTI6Q08923 RPS25BYLR333C 327 nt1.22□□□□□ -2.21
CTI6Q08923 YOL014WYOL014W 375 nt1.22□□□□□ -2.21
CTI6Q08923 RAD61YDR014W 1944 nt1.21□□□□□ -2.22
CTI6Q08923 RAD9YDR217C 3930 nt1.21□□□□□ -2.22
CTI6Q08923 SPO21YOL091W 1830 nt1.2□□□□□ -2.22
CTI6Q08923 YMR321CYMR321C 318 nt1.2□□□□□ -2.22
CTI6Q08923 COG8YML071C 1824 nt1.19□□□□□ -2.22
CTI6Q08923 SCC2YDR180W 4482 nt1.19□□□□□ -2.22
CTI6Q08923 YPR117WYPR117W 7470 nt1.18□□□□□ -2.22
CTI6Q08923 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.18□□□□□ -2.22
CTI6Q08923 YBR064WYBR064W 429 nt1.18□□□□□ -2.22
CTI6Q08923 DOP1YDR141C 5097 nt1.18□□□□□ -2.22
CTI6Q08923 SMC1YFL008W 3678 nt1.17□□□□□ -2.22
CTI6Q08923 VIK1YPL253C 1944 nt1.17□□□□□ -2.22
CTI6Q08923 YML099W-AYML099W-A 330 nt1.17□□□□□ -2.22
CTI6Q08923 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.17□□□□□ -2.22
CTI6Q08923 SPT7YBR081C 3999 nt1.16□□□□□ -2.22
CTI6Q08923 NST1YNL091W 3723 nt1.16□□□□□ -2.22
CTI6Q08923 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt1.16□□□□□ -2.22
CTI6Q08923 VAM6YDL077C 3150 nt1.14□□□□□ -2.23
CTI6Q08923 YGL041CYGL041C 204 nt1.14□□□□□ -2.23
CTI6Q08923 RPS27BYHR021C 249 nt1.14□□□□□ -2.23
CTI6Q08923 ECM12YHR021W-A 456 nt1.14□□□□□ -2.23
CTI6Q08923 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.14□□□□□ -2.23
CTI6Q08923 CSE2YNR010W 450 nt1.14□□□□□ -2.23
CTI6Q08923 YCR022CYCR022C 345 nt1.13□□□□□ -2.23
CTI6Q08923 snR74snR74 88 nt1.13□□□□□ -2.23
CTI6Q08923 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.13□□□□□ -2.23
CTI6Q08923 OLI1Q0130 231 nt1.12□□□□□ -2.23
CTI6Q08923 YOR218CYOR218C 420 nt1.12□□□□□ -2.23
CTI6Q08923 YOR282WYOR282W 321 nt1.12□□□□□ -2.23
CTI6Q08923 GEA2YEL022W 4380 nt1.11□□□□□ -2.23
CTI6Q08923 snR80snR80 171 nt1.11□□□□□ -2.23
CTI6Q08923 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.11□□□□□ -2.23
CTI6Q08923 ISD11YER048W-A 285 nt1.09□□□□□ -2.23
CTI6Q08923 YGL052WYGL052W 306 nt1.09□□□□□ -2.23
CTI6Q08923 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.08□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.08□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 YNL028WYNL028W 318 nt1.08□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 IES4YOR189W 351 nt1.08□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 SGF11YPL047W 300 nt1.08□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 KAP120YPL125W 3099 nt1.08□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 MCM10YIL150C 1716 nt1.07□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 YDL196WYDL196W 330 nt1.07□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 NPR2YEL062W 1848 nt1.07□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 CMC4YMR194C-B 222 nt1.06□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 NOP9YJL010C 2001 nt1.06□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 APL1YJR005W 2103 nt1.06□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 PAA1YDR071C 576 nt1.05□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.05□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 YPL044CYPL044C 549 nt1.05□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 YDR366CYDR366C 399 nt1.04□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.04□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 YPR092WYPR092W 306 nt1.04□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt1.03□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 YNL211CYNL211C 261 nt1.03□□□□□ -2.24
CTI6Q08923 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.02□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.02□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.02□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.02□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.02□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 YMR160WYMR160W 2451 nt1.02□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.02□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 snR8snR8 190 nt1.01□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.01□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 snR49snR49 165 nt1.01□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 UTP20YBL004W 7482 nt1.01□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 YOR302WYOR302W 78 nt1□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 RKR1YMR247C 4689 nt1□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 ASE1YOR058C 2658 nt0.99□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.99□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 ABF2YMR072W 552 nt0.99□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 PRP16YKR086W 3216 nt0.98□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 YDL073WYDL073W 2955 nt0.98□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 RPL26BYGR034W 384 nt0.98□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 PMP1YCR024C-A 123 nt0.97□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.97□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 BFR2YDR299W 1605 nt0.97□□□□□ -2.25
CTI6Q08923 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.96□□□□□ -2.26
CTI6Q08923 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.96□□□□□ -2.26
CTI6Q08923 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.96□□□□□ -2.26
CTI6Q08923 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.95□□□□□ -2.26
CTI6Q08923 YOR345CYOR345C 351 nt0.95□□□□□ -2.26
CTI6Q08923 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.94□□□□□ -2.26
CTI6Q08923 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.94□□□□□ -2.26
CTI6Q08923 snR55snR55 98 nt0.92□□□□□ -2.26
CTI6Q08923 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.92□□□□□ -2.26
CTI6Q08923 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt0.92□□□□□ -2.26
CTI6Q08923 SEC1YDR164C 2175 nt0.91□□□□□ -2.26
CTI6Q08923 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.91□□□□□ -2.26
CTI6Q08923 UBP3YER151C 2739 nt0.9□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 SEC8YPR055W 3198 nt0.89□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.89□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.2 ms