Protein–RNA interactions for Protein: Q08683

APC5, Anaphase-promoting complex subunit 5, yeastyeast

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APC5Q08683 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.74□□□□□ -2.29
APC5Q08683 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.74□□□□□ -2.29
APC5Q08683 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.73□□□□□ -2.29
APC5Q08683 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.73□□□□□ -2.29
APC5Q08683 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.73□□□□□ -2.29
APC5Q08683 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
APC5Q08683 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
APC5Q08683 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.73□□□□□ -2.29
APC5Q08683 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
APC5Q08683 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
APC5Q08683 TAR1YLR154W-C 375 nt0.73□□□□□ -2.29
APC5Q08683 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.73□□□□□ -2.29
APC5Q08683 SSS1YDR086C 243 nt0.72□□□□□ -2.29
APC5Q08683 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.72□□□□□ -2.29
APC5Q08683 SPO21YOL091W 1830 nt0.72□□□□□ -2.29
APC5Q08683 ASE1YOR058C 2658 nt0.71□□□□□ -2.29
APC5Q08683 YDR048CYDR048C 315 nt0.71□□□□□ -2.3
APC5Q08683 YPL225WYPL225W 441 nt0.71□□□□□ -2.3
APC5Q08683 PAA1YDR071C 576 nt0.7□□□□□ -2.3
APC5Q08683 SEC1YDR164C 2175 nt0.7□□□□□ -2.3
APC5Q08683 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.69□□□□□ -2.3
APC5Q08683 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.68□□□□□ -2.3
APC5Q08683 YMR321CYMR321C 318 nt0.68□□□□□ -2.3
APC5Q08683 YAF9YNL107W 681 nt0.68□□□□□ -2.3
APC5Q08683 YNL211CYNL211C 261 nt0.68□□□□□ -2.3
APC5Q08683 LTE1YAL024C 4308 nt0.67□□□□□ -2.3
APC5Q08683 ULP2YIL031W 3105 nt0.66□□□□□ -2.3
APC5Q08683 RPL26BYGR034W 384 nt0.66□□□□□ -2.3
APC5Q08683 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.66□□□□□ -2.3
APC5Q08683 SGF11YPL047W 300 nt0.66□□□□□ -2.3
APC5Q08683 CHS6YJL099W 2241 nt0.66□□□□□ -2.3
APC5Q08683 PAU12YGR294W 363 nt0.65□□□□□ -2.31
APC5Q08683 NPR2YEL062W 1848 nt0.65□□□□□ -2.31
APC5Q08683 YDR102CYDR102C 333 nt0.64□□□□□ -2.31
APC5Q08683 QCR9YGR183C 201 nt0.63□□□□□ -2.31
APC5Q08683 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.63□□□□□ -2.31
APC5Q08683 YPR197CYPR197C 564 nt0.63□□□□□ -2.31
APC5Q08683 COG8YML071C 1824 nt0.63□□□□□ -2.31
APC5Q08683 YML002WYML002W 2214 nt0.61□□□□□ -2.31
APC5Q08683 HTL1YCR020W-B 237 nt0.61□□□□□ -2.31
APC5Q08683 FYV10YIL097W 1551 nt0.6□□□□□ -2.31
APC5Q08683 SEC8YPR055W 3198 nt0.6□□□□□ -2.31
APC5Q08683 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.59□□□□□ -2.31
APC5Q08683 RPS27BYHR021C 249 nt0.59□□□□□ -2.31
APC5Q08683 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.59□□□□□ -2.31
APC5Q08683 YOR218CYOR218C 420 nt0.59□□□□□ -2.31
APC5Q08683 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.59□□□□□ -2.31
APC5Q08683 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.59□□□□□ -2.31
APC5Q08683 HAL9YOL089C 3093 nt0.58□□□□□ -2.32
APC5Q08683 snR60snR60 104 nt0.58□□□□□ -2.32
APC5Q08683 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.58□□□□□ -2.32
APC5Q08683 FMP27YLR454W 7887 nt0.57□□□□□ -2.32
APC5Q08683 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.57□□□□□ -2.32
APC5Q08683 BIR1YJR089W 2865 nt0.57□□□□□ -2.32
APC5Q08683 UTP10YJL109C 5310 nt0.57□□□□□ -2.32
APC5Q08683 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.56□□□□□ -2.32
APC5Q08683 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.56□□□□□ -2.32
APC5Q08683 YOL014WYOL014W 375 nt0.56□□□□□ -2.32
APC5Q08683 VIK1YPL253C 1944 nt0.56□□□□□ -2.32
APC5Q08683 PRP5YBR237W 2550 nt0.55□□□□□ -2.32
APC5Q08683 AI1Q0050 2505 nt0.55□□□□□ -2.32
APC5Q08683 CSE2YNR010W 450 nt0.55□□□□□ -2.32
APC5Q08683 snR36snR36 182 nt0.55□□□□□ -2.32
APC5Q08683 STE5YDR103W 2754 nt0.55□□□□□ -2.32
APC5Q08683 IQG1YPL242C 4488 nt0.54□□□□□ -2.32
APC5Q08683 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.54□□□□□ -2.32
APC5Q08683 GIM4YEL003W 336 nt0.54□□□□□ -2.32
APC5Q08683 YIL032CYIL032C 357 nt0.54□□□□□ -2.32
APC5Q08683 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.54□□□□□ -2.32
APC5Q08683 BEM3YPL115C 3387 nt0.54□□□□□ -2.32
APC5Q08683 ATP6Q0085 780 nt0.53□□□□□ -2.32
APC5Q08683 COX5BYIL111W 456 nt0.53□□□□□ -2.32
APC5Q08683 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.53□□□□□ -2.32
APC5Q08683 snR190snR190 190 nt0.53□□□□□ -2.32
APC5Q08683 HMRA1YCR097W 381 nt0.52□□□□□ -2.33
APC5Q08683 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.52□□□□□ -2.33
APC5Q08683 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.51□□□□□ -2.33
APC5Q08683 OST4YDL232W 111 nt0.51□□□□□ -2.33
APC5Q08683 YFL063WYFL063W 456 nt0.51□□□□□ -2.33
APC5Q08683 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt0.51□□□□□ -2.33
APC5Q08683 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.51□□□□□ -2.33
APC5Q08683 YSP1YHR155W 3687 nt0.5□□□□□ -2.33
APC5Q08683 snR56snR56 88 nt0.5□□□□□ -2.33
APC5Q08683 YFL032WYFL032W 321 nt0.5□□□□□ -2.33
APC5Q08683 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.5□□□□□ -2.33
APC5Q08683 PRP42YDR235W 1635 nt0.49□□□□□ -2.33
APC5Q08683 THO2YNL139C 4794 nt0.48□□□□□ -2.33
APC5Q08683 YGL149WYGL149W 306 nt0.48□□□□□ -2.33
APC5Q08683 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.47□□□□□ -2.33
APC5Q08683 YOR015WYOR015W 360 nt0.47□□□□□ -2.33
APC5Q08683 YDR413CYDR413C 576 nt0.46□□□□□ -2.34
APC5Q08683 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.46□□□□□ -2.34
APC5Q08683 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt0.46□□□□□ -2.34
APC5Q08683 YKL136WYKL136W 399 nt0.46□□□□□ -2.34
APC5Q08683 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.45□□□□□ -2.34
APC5Q08683 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.45□□□□□ -2.34
APC5Q08683 YLR282CYLR282C 342 nt0.45□□□□□ -2.34
APC5Q08683 YOR345CYOR345C 351 nt0.45□□□□□ -2.34
APC5Q08683 PET111YMR257C 2403 nt0.45□□□□□ -2.34
APC5Q08683 TRS65YGR166W 1683 nt0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.7 ms