Protein–RNA interactions for Protein: P48164

RPS7B, 40S ribosomal protein S7-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS7BP48164 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.29□□□□□ -2.2
RPS7BP48164 RPL33BYOR234C 324 nt1.29□□□□□ -2.2
RPS7BP48164 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.29□□□□□ -2.2
RPS7BP48164 RRT15YLR162W-A 189 nt1.28□□□□□ -2.2
RPS7BP48164 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.27□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 snR55snR55 98 nt1.26□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 YLL020CYLL020C 306 nt1.26□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.26□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.26□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 YPR092WYPR092W 306 nt1.26□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 BUD3YCL014W 4911 nt1.26□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 NUP157YER105C 4176 nt1.26□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 EAF1YDR359C 2949 nt1.25□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 AHC1YOR023C 1701 nt1.25□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 RSM22YKL155C 1887 nt1.24□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 RPS30BYOR182C 192 nt1.24□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 WAR1YML076C 2835 nt1.23□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 MDS3YGL197W 4464 nt1.23□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 YDR366CYDR366C 399 nt1.23□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 STB6YKL072W 2301 nt1.23□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.22□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.22□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 SGF11YPL047W 300 nt1.22□□□□□ -2.21
RPS7BP48164 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.21□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 OLI1Q0130 231 nt1.2□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 ECM12YHR021W-A 456 nt1.2□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 ABF2YMR072W 552 nt1.2□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 RAD9YDR217C 3930 nt1.2□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 KAP120YPL125W 3099 nt1.19□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 CDC39YCR093W 6327 nt1.19□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 SMC1YFL008W 3678 nt1.18□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 PAA1YDR071C 576 nt1.18□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 PAU12YGR294W 363 nt1.18□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.18□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 PAU24YBR301W 363 nt1.18□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 APL1YJR005W 2103 nt1.18□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.17□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 NOP9YJL010C 2001 nt1.16□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 snR74snR74 88 nt1.16□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.16□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 CMC4YMR194C-B 222 nt1.16□□□□□ -2.22
RPS7BP48164 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.15□□□□□ -2.23
RPS7BP48164 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.15□□□□□ -2.23
RPS7BP48164 YKU70YMR284W 1809 nt1.15□□□□□ -2.23
RPS7BP48164 ISD11YER048W-A 285 nt1.14□□□□□ -2.23
RPS7BP48164 YGL041CYGL041C 204 nt1.14□□□□□ -2.23
RPS7BP48164 YNL211CYNL211C 261 nt1.14□□□□□ -2.23
RPS7BP48164 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.14□□□□□ -2.23
RPS7BP48164 NST1YNL091W 3723 nt1.13□□□□□ -2.23
RPS7BP48164 snR80snR80 171 nt1.11□□□□□ -2.23
RPS7BP48164 PAM16YJL104W 450 nt1.11□□□□□ -2.23
RPS7BP48164 YPL044CYPL044C 549 nt1.11□□□□□ -2.23
RPS7BP48164 YDL196WYDL196W 330 nt1.1□□□□□ -2.23
RPS7BP48164 NPR2YEL062W 1848 nt1.1□□□□□ -2.23
RPS7BP48164 RPL26BYGR034W 384 nt1.09□□□□□ -2.23
RPS7BP48164 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt1.09□□□□□ -2.23
RPS7BP48164 YJR029WYJR029W 5268 nt1.09□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.09□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 PRP16YKR086W 3216 nt1.08□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 QCR9YGR183C 201 nt1.08□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 SPT7YBR081C 3999 nt1.07□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 VAM6YDL077C 3150 nt1.06□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 ASE1YOR058C 2658 nt1.06□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 SPG3YDR504C 384 nt1.06□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 YOR302WYOR302W 78 nt1.06□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 GEA2YEL022W 4380 nt1.06□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 BEM2YER155C 6504 nt1.06□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.04□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.04□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.04□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.04□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.04□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.04□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.04□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 HAL9YOL089C 3093 nt1.03□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.03□□□□□ -2.24
RPS7BP48164 ULI1YFR026C 510 nt1.02□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 COX12YLR038C 252 nt1.02□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 SEC8YPR055W 3198 nt1.02□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 PMP1YCR024C-A 123 nt1.01□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 APQ12YIL040W 417 nt1.01□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 BLI1YKL061W 342 nt1.01□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.01□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 snR190snR190 190 nt1□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 COY1YKL179C 2040 nt0.99□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 YDL073WYDL073W 2955 nt0.99□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 SCC2YDR180W 4482 nt0.99□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.99□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.99□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 COX5BYIL111W 456 nt0.99□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 YLR282CYLR282C 342 nt0.99□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.98□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 JLP2YMR132C 627 nt0.98□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 BFR2YDR299W 1605 nt0.97□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 YOR345CYOR345C 351 nt0.97□□□□□ -2.25
RPS7BP48164 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.96□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.3 ms