Protein–RNA interactions for Protein: P47044

YJL055W, LOG family protein YJL055W, yeastyeast

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL055WP47044 NHP2YDL208W 471 nt0.68□□□□□ -2.3
YJL055WP47044 STF2YGR008C 255 nt0.68□□□□□ -2.3
YJL055WP47044 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.68□□□□□ -2.3
YJL055WP47044 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.67□□□□□ -2.3
YJL055WP47044 YOR218CYOR218C 420 nt0.67□□□□□ -2.3
YJL055WP47044 FYV10YIL097W 1551 nt0.66□□□□□ -2.3
YJL055WP47044 SEC8YPR055W 3198 nt0.66□□□□□ -2.3
YJL055WP47044 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.65□□□□□ -2.31
YJL055WP47044 HUG1YML058W-A 207 nt0.65□□□□□ -2.31
YJL055WP47044 SSS1YDR086C 243 nt0.64□□□□□ -2.31
YJL055WP47044 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.63□□□□□ -2.31
YJL055WP47044 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.63□□□□□ -2.31
YJL055WP47044 YML002WYML002W 2214 nt0.62□□□□□ -2.31
YJL055WP47044 UTP20YBL004W 7482 nt0.62□□□□□ -2.31
YJL055WP47044 YDR048CYDR048C 315 nt0.62□□□□□ -2.31
YJL055WP47044 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.62□□□□□ -2.31
YJL055WP47044 SGF11YPL047W 300 nt0.62□□□□□ -2.31
YJL055WP47044 YPR012WYPR012W 255 nt0.62□□□□□ -2.31
YJL055WP47044 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.61□□□□□ -2.31
YJL055WP47044 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.61□□□□□ -2.31
YJL055WP47044 PRP5YBR237W 2550 nt0.61□□□□□ -2.31
YJL055WP47044 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.6□□□□□ -2.31
YJL055WP47044 RPS30BYOR182C 192 nt0.59□□□□□ -2.31
YJL055WP47044 COG8YML071C 1824 nt0.59□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 FMP27YLR454W 7887 nt0.59□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.58□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 COX5BYIL111W 456 nt0.57□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 INA22YIR024C 651 nt0.57□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 RPS27BYHR021C 249 nt0.56□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.56□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.56□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.55□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 snR190snR190 190 nt0.55□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 HTL1YCR020W-B 237 nt0.54□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.54□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 OST4YDL232W 111 nt0.54□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 YDR102CYDR102C 333 nt0.54□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 YMR160WYMR160W 2451 nt0.54□□□□□ -2.32
YJL055WP47044 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.51□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.51□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 UTP10YJL109C 5310 nt0.51□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 CSE2YNR010W 450 nt0.51□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 PRP42YDR235W 1635 nt0.5□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.5□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.5□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 PET111YMR257C 2403 nt0.48□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 PAU12YGR294W 363 nt0.48□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 YAF9YNL107W 681 nt0.48□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 YPR197CYPR197C 564 nt0.48□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 VIK1YPL253C 1944 nt0.48□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YJL055WP47044 ESP1YGR098C 4893 nt0.45□□□□□ -2.34
YJL055WP47044 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.45□□□□□ -2.34
YJL055WP47044 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.44□□□□□ -2.34
YJL055WP47044 YLR282CYLR282C 342 nt0.44□□□□□ -2.34
YJL055WP47044 YOR345CYOR345C 351 nt0.44□□□□□ -2.34
YJL055WP47044 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.43□□□□□ -2.34
YJL055WP47044 snR60snR60 104 nt0.43□□□□□ -2.34
YJL055WP47044 ATP6Q0085 780 nt0.43□□□□□ -2.34
YJL055WP47044 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.43□□□□□ -2.34
YJL055WP47044 YIL032CYIL032C 357 nt0.43□□□□□ -2.34
YJL055WP47044 YKL136WYKL136W 399 nt0.43□□□□□ -2.34
YJL055WP47044 ABF2YMR072W 552 nt0.43□□□□□ -2.34
YJL055WP47044 ULP2YIL031W 3105 nt0.42□□□□□ -2.34
YJL055WP47044 YCR022CYCR022C 345 nt0.42□□□□□ -2.34
YJL055WP47044 SBH1YER087C-B 249 nt0.42□□□□□ -2.34
YJL055WP47044 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.41□□□□□ -2.34
YJL055WP47044 ULI1YFR026C 510 nt0.4□□□□□ -2.35
YJL055WP47044 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.39□□□□□ -2.35
YJL055WP47044 YFL063WYFL063W 456 nt0.39□□□□□ -2.35
YJL055WP47044 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.39□□□□□ -2.35
YJL055WP47044 COY1YKL179C 2040 nt0.38□□□□□ -2.35
YJL055WP47044 BIR1YJR089W 2865 nt0.37□□□□□ -2.35
YJL055WP47044 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.37□□□□□ -2.35
YJL055WP47044 YGL149WYGL149W 306 nt0.37□□□□□ -2.35
YJL055WP47044 YLR041WYLR041W 321 nt0.36□□□□□ -2.35
YJL055WP47044 YNL028WYNL028W 318 nt0.36□□□□□ -2.35
YJL055WP47044 snR36snR36 182 nt0.36□□□□□ -2.35
YJL055WP47044 NNF2YGR089W 2811 nt0.35□□□□□ -2.35
YJL055WP47044 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.35□□□□□ -2.35
YJL055WP47044 STE5YDR103W 2754 nt0.35□□□□□ -2.35
YJL055WP47044 BUL2YML111W 2763 nt0.34□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 68.4 ms