Protein–RNA interactions for Protein: P36070

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, yeastyeast

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN3P36070 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.14□□□□□ -2.23
RRN3P36070 NOP9YJL010C 2001 nt1.14□□□□□ -2.23
RRN3P36070 YDL196WYDL196W 330 nt1.13□□□□□ -2.23
RRN3P36070 CMC4YMR194C-B 222 nt1.13□□□□□ -2.23
RRN3P36070 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.13□□□□□ -2.23
RRN3P36070 TTI1YKL033W 3117 nt1.13□□□□□ -2.23
RRN3P36070 YGR069WYGR069W 336 nt1.12□□□□□ -2.23
RRN3P36070 YOR282WYOR282W 321 nt1.12□□□□□ -2.23
RRN3P36070 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.11□□□□□ -2.23
RRN3P36070 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.11□□□□□ -2.23
RRN3P36070 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.11□□□□□ -2.23
RRN3P36070 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.11□□□□□ -2.23
RRN3P36070 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.11□□□□□ -2.23
RRN3P36070 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.11□□□□□ -2.23
RRN3P36070 YNL211CYNL211C 261 nt1.11□□□□□ -2.23
RRN3P36070 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.09□□□□□ -2.23
RRN3P36070 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.09□□□□□ -2.23
RRN3P36070 YOR015WYOR015W 360 nt1.09□□□□□ -2.23
RRN3P36070 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.09□□□□□ -2.23
RRN3P36070 SCC2YDR180W 4482 nt1.08□□□□□ -2.24
RRN3P36070 VAM6YDL077C 3150 nt1.08□□□□□ -2.24
RRN3P36070 SIP4YJL089W 2490 nt1.07□□□□□ -2.24
RRN3P36070 SPT7YBR081C 3999 nt1.07□□□□□ -2.24
RRN3P36070 RPL26BYGR034W 384 nt1.07□□□□□ -2.24
RRN3P36070 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.07□□□□□ -2.24
RRN3P36070 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.07□□□□□ -2.24
RRN3P36070 IML1YJR138W 4755 nt1.07□□□□□ -2.24
RRN3P36070 BEM2YER155C 6504 nt1.06□□□□□ -2.24
RRN3P36070 YJR029WYJR029W 5268 nt1.06□□□□□ -2.24
RRN3P36070 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.06□□□□□ -2.24
RRN3P36070 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.05□□□□□ -2.24
RRN3P36070 YGL052WYGL052W 306 nt1.05□□□□□ -2.24
RRN3P36070 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.05□□□□□ -2.24
RRN3P36070 PMP1YCR024C-A 123 nt1.04□□□□□ -2.24
RRN3P36070 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.03□□□□□ -2.24
RRN3P36070 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.03□□□□□ -2.24
RRN3P36070 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.03□□□□□ -2.24
RRN3P36070 YPR092WYPR092W 306 nt1.03□□□□□ -2.24
RRN3P36070 YDL073WYDL073W 2955 nt1.03□□□□□ -2.24
RRN3P36070 BFR2YDR299W 1605 nt1.02□□□□□ -2.25
RRN3P36070 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.02□□□□□ -2.25
RRN3P36070 ASE1YOR058C 2658 nt1.01□□□□□ -2.25
RRN3P36070 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.01□□□□□ -2.25
RRN3P36070 PRP16YKR086W 3216 nt1□□□□□ -2.25
RRN3P36070 YER181CYER181C 324 nt0.99□□□□□ -2.25
RRN3P36070 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.99□□□□□ -2.25
RRN3P36070 DOP1YDR141C 5097 nt0.99□□□□□ -2.25
RRN3P36070 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.98□□□□□ -2.25
RRN3P36070 YPR117WYPR117W 7470 nt0.97□□□□□ -2.25
RRN3P36070 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.97□□□□□ -2.25
RRN3P36070 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.96□□□□□ -2.26
RRN3P36070 SEC8YPR055W 3198 nt0.96□□□□□ -2.26
RRN3P36070 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.95□□□□□ -2.26
RRN3P36070 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.95□□□□□ -2.26
RRN3P36070 RKR1YMR247C 4689 nt0.95□□□□□ -2.26
RRN3P36070 snR74snR74 88 nt0.94□□□□□ -2.26
RRN3P36070 snR49snR49 165 nt0.94□□□□□ -2.26
RRN3P36070 snR190snR190 190 nt0.93□□□□□ -2.26
RRN3P36070 NPR2YEL062W 1848 nt0.92□□□□□ -2.26
RRN3P36070 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.92□□□□□ -2.26
RRN3P36070 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.91□□□□□ -2.26
RRN3P36070 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.91□□□□□ -2.26
RRN3P36070 PAU24YBR301W 363 nt0.91□□□□□ -2.26
RRN3P36070 STF2YGR008C 255 nt0.89□□□□□ -2.27
RRN3P36070 YLR282CYLR282C 342 nt0.89□□□□□ -2.27
RRN3P36070 HUG1YML058W-A 207 nt0.89□□□□□ -2.27
RRN3P36070 CHS6YJL099W 2241 nt0.89□□□□□ -2.27
RRN3P36070 COY1YKL179C 2040 nt0.88□□□□□ -2.27
RRN3P36070 snR55snR55 98 nt0.88□□□□□ -2.27
RRN3P36070 BLI1YKL061W 342 nt0.87□□□□□ -2.27
RRN3P36070 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.86□□□□□ -2.27
RRN3P36070 COX5BYIL111W 456 nt0.86□□□□□ -2.27
RRN3P36070 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.86□□□□□ -2.27
RRN3P36070 SEC1YDR164C 2175 nt0.86□□□□□ -2.27
RRN3P36070 HAL9YOL089C 3093 nt0.85□□□□□ -2.27
RRN3P36070 UBP3YER151C 2739 nt0.85□□□□□ -2.27
RRN3P36070 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.85□□□□□ -2.27
RRN3P36070 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.85□□□□□ -2.27
RRN3P36070 PAM16YJL104W 450 nt0.85□□□□□ -2.27
RRN3P36070 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.85□□□□□ -2.27
RRN3P36070 LTE1YAL024C 4308 nt0.85□□□□□ -2.27
RRN3P36070 FYV10YIL097W 1551 nt0.84□□□□□ -2.27
RRN3P36070 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.84□□□□□ -2.27
RRN3P36070 PRP5YBR237W 2550 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN3P36070 YKU70YMR284W 1809 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN3P36070 YML002WYML002W 2214 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN3P36070 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN3P36070 RPS30BYOR182C 192 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN3P36070 BUD3YCL014W 4911 nt0.82□□□□□ -2.28
RRN3P36070 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.82□□□□□ -2.28
RRN3P36070 YCR022CYCR022C 345 nt0.8□□□□□ -2.28
RRN3P36070 ULI1YFR026C 510 nt0.8□□□□□ -2.28
RRN3P36070 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.8□□□□□ -2.28
RRN3P36070 COX12YLR038C 252 nt0.79□□□□□ -2.28
RRN3P36070 OST4YDL232W 111 nt0.78□□□□□ -2.28
RRN3P36070 ABF2YMR072W 552 nt0.78□□□□□ -2.28
RRN3P36070 PRP42YDR235W 1635 nt0.77□□□□□ -2.29
RRN3P36070 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.76□□□□□ -2.29
RRN3P36070 YLR041WYLR041W 321 nt0.76□□□□□ -2.29
RRN3P36070 BEM3YPL115C 3387 nt0.76□□□□□ -2.29
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