Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms