Protein–RNA interactions for Protein: P08123

COL1A2, Collagen alpha-2(I) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL1A2P08123 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL1A2P08123 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL1A2P08123 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL1A2P08123 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL1A2P08123 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms