Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BHMG1C9JSJ3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHMG1C9JSJ3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms