Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGEF2Q9Y6D5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms